RNA–Protein interactions for RNA: YJL177W

RPL17B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L17B, yeastyeast

Gene RPL17B, Length 555 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL17BYJL177W HTA2P04912 132 aa6.53□□□□□ -1.36
RPL17BYJL177W ULI1P43604 169 aa6.52□□□□□ -1.37
RPL17BYJL177W TRP5P00931 707 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RPL17BYJL177W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RPL17BYJL177W REF2P42073 533 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RPL17BYJL177W SOL3P38858 249 aa6.5□□□□□ -1.37
RPL17BYJL177W YGR273CP53329 174 aa6.5□□□□□ -1.37
RPL17BYJL177W PBS2P08018 668 aa6.48□□□□□ -1.37
RPL17BYJL177W YEL023CP39992 682 aa6.47□□□□□ -1.37
RPL17BYJL177W VHR2P40041 505 aa6.47□□□□□ -1.37
RPL17BYJL177W IOC2Q12072 812 aa6.47□□□□□ -1.37
RPL17BYJL177W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RPL17BYJL177W UBP14P38237 781 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W NST1P53935 1240 aa6.46□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W FKH1P40466 484 aa6.45□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W PTC4P38089 393 aa6.44□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W LEU3P08638 886 aa6.43□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W DSF2P38213 736 aa6.43□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W JIP4Q03361 876 aa6.43□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W LDB19Q12502 818 aa6.43□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W KEX1P09620 729 aa6.42□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W MPH3P0CE00 602 aa6.42□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W COX6P00427 148 aa6.41□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W AI4P03878 556 aa6.41□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W DAN4P47179 1161 aa6.4□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W YDR090CQ03193 310 aa6.4□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W MAM3Q12296 706 aa6.4□□□□□ -1.38
RPL17BYJL177W RTG1P32607 177 aa6.39□□□□□ -1.39
RPL17BYJL177W RAD54P32863 898 aa6.39□□□□□ -1.39
RPL17BYJL177W KIC1P38692 1080 aa6.39□□□□□ -1.39
RPL17BYJL177W ILV3P39522 585 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RPL17BYJL177W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data6.38□□□□□ -1.39not detected
RPL17BYJL177W YJL171CP46992 396 aa6.37□□□□□ -1.39
RPL17BYJL177W SEC61P32915 480 aa6.36□□□□□ -1.39
RPL17BYJL177W IES2P40154 320 aa6.34□□□□□ -1.39
RPL17BYJL177W NCR1Q12200 1170 aa6.34□□□□□ -1.39
RPL17BYJL177W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RPL17BYJL177W PML39Q03760 334 aa6.33□□□□□ -1.4
RPL17BYJL177W SLI15P38283 698 aa6.32□□□□□ -1.4
RPL17BYJL177W LEO1P38439 464 aa6.32□□□□□ -1.4
RPL17BYJL177W NUP42P49686 430 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RPL17BYJL177W DIT2P21595 489 aa6.3□□□□□ -1.4
RPL17BYJL177W MID1P41821 548 aa6.3□□□□□ -1.4
RPL17BYJL177W RPN1P38764 993 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RPL17BYJL177W BMT6Q12291 365 aa6.29□□□□□ -1.4
RPL17BYJL177W YDL129WQ07555 291 aa6.28□□□□□ -1.4
RPL17BYJL177W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RPL17BYJL177W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RPL17BYJL177W ORC6P38826 435 aa6.26□□□□□ -1.41
RPL17BYJL177W CDC73Q06697 393 aa6.26□□□□□ -1.41
RPL17BYJL177W PEX29Q03370 554 aa6.24□□□□□ -1.41
RPL17BYJL177W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RPL17BYJL177W GLC3P32775 704 aa6.23□□□□□ -1.41
RPL17BYJL177W SAP30P38429 201 aa6.23□□□□□ -1.41
RPL17BYJL177W DPL1Q05567 589 aa6.23□□□□□ -1.41
RPL17BYJL177W MPC54Q08550 464 aa6.23□□□□□ -1.41
RPL17BYJL177W ATF2P53296 535 aa6.21□□□□□ -1.42
RPL17BYJL177W CSC1Q06538 782 aa6.21□□□□□ -1.42
RPL17BYJL177W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RPL17BYJL177W RGR1P19263 1082 aa6.2□□□□□ -1.42
RPL17BYJL177W MVP1P40959 511 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RPL17BYJL177W PEX21P50091 288 aa6.2□□□□□ -1.42
RPL17BYJL177W NMA111P53920 997 aa6.19□□□□□ -1.42
RPL17BYJL177W AIM7Q12156 149 aa6.19□□□□□ -1.42
RPL17BYJL177W ISU2Q12056 156 aa6.18□□□□□ -1.42
RPL17BYJL177W KIN1P13185 1064 aa6.17□□□□□ -1.42
RPL17BYJL177W TFB4Q12004 338 aa6.17□□□□□ -1.42
RPL17BYJL177W ARH1P48360 493 aa6.16□□□□□ -1.42
RPL17BYJL177W YPR109WQ06104 294 aa6.16□□□□□ -1.42
RPL17BYJL177W HAP5Q02516 242 aa6.15□□□□□ -1.42
RPL17BYJL177W YDR344CQ05510 147 aa6.15□□□□□ -1.42
RPL17BYJL177W TEA1P47988 759 aa6.14□□□□□ -1.43
RPL17BYJL177W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RPL17BYJL177W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RPL17BYJL177W CLB5P30283 435 aa6.13□□□□□ -1.43
RPL17BYJL177W YRR1Q12172 810 aa6.13□□□□□ -1.43
RPL17BYJL177W PRE3P38624 215 aa6.1□□□□□ -1.43
RPL17BYJL177W SPT23P35210 1082 aa6.09□□□□□ -1.43
RPL17BYJL177W BNI4P53858 892 aa6.09□□□□□ -1.43
RPL17BYJL177W PDR1P12383 1068 aa6.08□□□□□ -1.44
RPL17BYJL177W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
RPL17BYJL177W NIS1P53939 407 aa6.06□□□□□ -1.44
RPL17BYJL177W NUD1P32336 851 aa6.05□□□□□ -1.44
RPL17BYJL177W GUA1P38625 525 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RPL17BYJL177W PTC2P39966 464 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RPL17BYJL177W FPK1P53739 893 aa6.04□□□□□ -1.44
RPL17BYJL177W YMR196WQ04336 1088 aa6.04□□□□□ -1.44
RPL17BYJL177W NPL4P33755 580 aa6.03□□□□□ -1.44
RPL17BYJL177W CSN12P47130 423 aa6.03□□□□□ -1.44
RPL17BYJL177W SIT4P20604 311 aa6.02□□□□□ -1.45
RPL17BYJL177W RAM1P22007 431 aa6.02□□□□□ -1.45
RPL17BYJL177W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RPL17BYJL177W ISM1P48526 1002 aa6.01□□□□□ -1.45
RPL17BYJL177W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RPL17BYJL177W STR2P47164 639 aa6□□□□□ -1.45
RPL17BYJL177W HST2P53686 357 aa6□□□□□ -1.45
RPL17BYJL177W DMA2P53924 522 aa6□□□□□ -1.45
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