Protein–RNA interactions for Protein: P47179

DAN4, Cell wall protein DAN4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DAN4P47179 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.21■□□□□ 0.83
DAN4P47179 NSR1YGR159C 1245 nt19.98■□□□□ 0.79
DAN4P47179 NOP1YDL014W 984 nt19.85■□□□□ 0.77
DAN4P47179 YKL036CYKL036C 393 nt18.82■□□□□ 0.6
DAN4P47179 MDJ1YFL016C 1536 nt17.85■□□□□ 0.45
DAN4P47179 YJL027CYJL027C 417 nt17.65■□□□□ 0.42
DAN4P47179 Q0297Q0297 156 nt17.55■□□□□ 0.4
DAN4P47179 SCS3YGL126W 1143 nt17.37■□□□□ 0.37
DAN4P47179 SRX1YKL086W 384 nt17.32■□□□□ 0.36
DAN4P47179 YCR051WYCR051W 669 nt16.44■□□□□ 0.22
DAN4P47179 YOL085CYOL085C 342 nt16.26■□□□□ 0.19
DAN4P47179 SCJ1YMR214W 1134 nt16.25■□□□□ 0.19
DAN4P47179 YGR139WYGR139W 339 nt16.02■□□□□ 0.16
DAN4P47179 PKP1YIL042C 1185 nt15.88■□□□□ 0.13
DAN4P47179 DBP2YNL112W 1641 nt15.81■□□□□ 0.12
DAN4P47179 RPP1BYDL130W 321 nt15.74■□□□□ 0.11
DAN4P47179 ATS1YAL020C 1002 nt15.74■□□□□ 0.11
DAN4P47179 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.51■□□□□ 0.07
DAN4P47179 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.51■□□□□ 0.07
DAN4P47179 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.51■□□□□ 0.07
DAN4P47179 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.51■□□□□ 0.07
DAN4P47179 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.51■□□□□ 0.07
DAN4P47179 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.51■□□□□ 0.07
DAN4P47179 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.51■□□□□ 0.07
DAN4P47179 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.51■□□□□ 0.07
DAN4P47179 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.51■□□□□ 0.07
DAN4P47179 CCC1YLR220W 969 nt15.39■□□□□ 0.05
DAN4P47179 MOT3YMR070W 1473 nt15.1■□□□□ 0.01
DAN4P47179 YBR190WYBR190W 312 nt15.09■□□□□ 0.01
DAN4P47179 Q0182Q0182 405 nt15.03■□□□□ -0
DAN4P47179 SCR1SCR1 522 nt14.99□□□□□ -0.01
DAN4P47179 VAR1Q0140 1197 nt14.93□□□□□ -0.02
DAN4P47179 PET122YER153C 765 nt14.9□□□□□ -0.02
DAN4P47179 RTC3YHR087W 336 nt14.79□□□□□ -0.04
DAN4P47179 SSA3YBL075C 1950 nt14.79□□□□□ -0.04
DAN4P47179 RVS167YDR388W 1449 nt14.72□□□□□ -0.05
DAN4P47179 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.69□□□□□ -0.06
DAN4P47179 NME1NME1 340 nt14.65□□□□□ -0.06
DAN4P47179 RRN5YLR141W 1092 nt14.56□□□□□ -0.08
DAN4P47179 PST2YDR032C 597 nt14.49□□□□□ -0.09
DAN4P47179 RSB1YOR049C 1065 nt14.43□□□□□ -0.1
DAN4P47179 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.29□□□□□ -0.12
DAN4P47179 CSM2YIL132C 642 nt14.27□□□□□ -0.13
DAN4P47179 SHR5YOL110W 714 nt14.27□□□□□ -0.13
DAN4P47179 YDR509WYDR509W 348 nt14.26□□□□□ -0.13
DAN4P47179 PUT4YOR348C 1884 nt14.25□□□□□ -0.13
DAN4P47179 YKL097CYKL097C 411 nt14.22□□□□□ -0.13
DAN4P47179 YDJ1YNL064C 1230 nt14.22□□□□□ -0.13
DAN4P47179 PAU21YOR394W 495 nt14.12□□□□□ -0.15
DAN4P47179 PAU22YPL282C 495 nt14.12□□□□□ -0.15
DAN4P47179 PAM17YKR065C 594 nt14.04□□□□□ -0.16
DAN4P47179 ARO7YPR060C 771 nt13.98□□□□□ -0.17
DAN4P47179 DEP1YAL013W 1218 nt13.95□□□□□ -0.18
DAN4P47179 GAR1YHR089C 618 nt13.91□□□□□ -0.18
DAN4P47179 URN1YPR152C 1398 nt13.88□□□□□ -0.19
DAN4P47179 ARE1YCR048W 1833 nt13.83□□□□□ -0.2
DAN4P47179 Q0144Q0144 330 nt13.72□□□□□ -0.21
DAN4P47179 SHU1YHL006C 453 nt13.71□□□□□ -0.21
DAN4P47179 POA1YBR022W 534 nt13.7□□□□□ -0.22
DAN4P47179 REG2YBR050C 1017 nt13.7□□□□□ -0.22
DAN4P47179 BMT5YIL096C 1011 nt13.64□□□□□ -0.23
DAN4P47179 OPI9YLR338W 858 nt13.64□□□□□ -0.23
DAN4P47179 BUR6YER159C 429 nt13.63□□□□□ -0.23
DAN4P47179 YNL208WYNL208W 600 nt13.63□□□□□ -0.23
DAN4P47179 Q0017Q0017 162 nt13.63□□□□□ -0.23
DAN4P47179 SAH1YER043C 1350 nt13.61□□□□□ -0.23
DAN4P47179 Q0142Q0142 177 nt13.61□□□□□ -0.23
DAN4P47179 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.57□□□□□ -0.24
DAN4P47179 RPN10YHR200W 807 nt13.57□□□□□ -0.24
DAN4P47179 SPT5YML010W 3192 nt13.55□□□□□ -0.24
DAN4P47179 BSC6YOL137W 1494 nt13.53□□□□□ -0.24
DAN4P47179 SEM1YDR363W-A 270 nt13.52□□□□□ -0.25
DAN4P47179 YOR139CYOR139C 393 nt13.49□□□□□ -0.25
DAN4P47179 TIR1YER011W 765 nt13.41□□□□□ -0.26
DAN4P47179 Q0010Q0010 387 nt13.39□□□□□ -0.27
DAN4P47179 SSA1YAL005C 1929 nt13.31□□□□□ -0.28
DAN4P47179 NPL3YDR432W 1245 nt13.3□□□□□ -0.28
DAN4P47179 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.29□□□□□ -0.28
DAN4P47179 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt13.28□□□□□ -0.28
DAN4P47179 YJR018WYJR018W 363 nt13.22□□□□□ -0.29
DAN4P47179 SRB2YHR041C 633 nt13.21□□□□□ -0.29
DAN4P47179 SRN2YLR119W 642 nt13.21□□□□□ -0.29
DAN4P47179 PUN1YLR414C 792 nt13.21□□□□□ -0.29
DAN4P47179 SSA4YER103W 1929 nt13.2□□□□□ -0.3
DAN4P47179 BUD23YCR047C 828 nt13.15□□□□□ -0.3
DAN4P47179 YJR120WYJR120W 351 nt13.15□□□□□ -0.3
DAN4P47179 Q0255Q0255 1419 nt13.13□□□□□ -0.31
DAN4P47179 PTC2YER089C 1395 nt13.12□□□□□ -0.31
DAN4P47179 AI3Q0060 1248 nt13.06□□□□□ -0.32
DAN4P47179 AI5_BETAQ0075 1065 nt13.04□□□□□ -0.32
DAN4P47179 YCR099CYCR099C 468 nt13.02□□□□□ -0.33
DAN4P47179 YOR169CYOR169C 465 nt13□□□□□ -0.33
DAN4P47179 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.96□□□□□ -0.33
DAN4P47179 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.96□□□□□ -0.33
DAN4P47179 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.96□□□□□ -0.33
DAN4P47179 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.96□□□□□ -0.33
DAN4P47179 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.96□□□□□ -0.33
DAN4P47179 YOL037CYOL037C 354 nt12.95□□□□□ -0.34
DAN4P47179 YGL188CYGL188C 174 nt12.94□□□□□ -0.34
DAN4P47179 YGR021WYGR021W 873 nt12.94□□□□□ -0.34
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