Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

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Length 810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.36■■□□□ 1.01
YRR1Q12172 NSR1YGR159C 1245 nt21.31■■□□□ 1
YRR1Q12172 NOP1YDL014W 984 nt20.77■□□□□ 0.92
YRR1Q12172 YKL036CYKL036C 393 nt19.14■□□□□ 0.65
YRR1Q12172 MDJ1YFL016C 1536 nt18.93■□□□□ 0.62
YRR1Q12172 Q0297Q0297 156 nt18.2■□□□□ 0.5
YRR1Q12172 SRX1YKL086W 384 nt18.16■□□□□ 0.5
YRR1Q12172 YJL027CYJL027C 417 nt17.84■□□□□ 0.45
YRR1Q12172 SCS3YGL126W 1143 nt17.39■□□□□ 0.37
YRR1Q12172 YCR051WYCR051W 669 nt17.2■□□□□ 0.34
YRR1Q12172 DBP2YNL112W 1641 nt16.78■□□□□ 0.28
YRR1Q12172 YOL085CYOL085C 342 nt16.6■□□□□ 0.25
YRR1Q12172 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.45■□□□□ 0.22
YRR1Q12172 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.45■□□□□ 0.22
YRR1Q12172 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.45■□□□□ 0.22
YRR1Q12172 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.45■□□□□ 0.22
YRR1Q12172 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.45■□□□□ 0.22
YRR1Q12172 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.45■□□□□ 0.22
YRR1Q12172 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.45■□□□□ 0.22
YRR1Q12172 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.45■□□□□ 0.22
YRR1Q12172 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.45■□□□□ 0.22
YRR1Q12172 PKP1YIL042C 1185 nt16.33■□□□□ 0.2
YRR1Q12172 RPP1BYDL130W 321 nt16.32■□□□□ 0.2
YRR1Q12172 CCC1YLR220W 969 nt16.25■□□□□ 0.19
YRR1Q12172 SCJ1YMR214W 1134 nt16.25■□□□□ 0.19
YRR1Q12172 YBR190WYBR190W 312 nt16.16■□□□□ 0.18
YRR1Q12172 RTC3YHR087W 336 nt15.76■□□□□ 0.11
YRR1Q12172 RVS167YDR388W 1449 nt15.7■□□□□ 0.1
YRR1Q12172 ATS1YAL020C 1002 nt15.62■□□□□ 0.09
YRR1Q12172 PET122YER153C 765 nt15.6■□□□□ 0.09
YRR1Q12172 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.55■□□□□ 0.08
YRR1Q12172 SCR1SCR1 522 nt15.38■□□□□ 0.05
YRR1Q12172 SHR5YOL110W 714 nt15.18■□□□□ 0.02
YRR1Q12172 RRN5YLR141W 1092 nt15.15■□□□□ 0.02
YRR1Q12172 YGR139WYGR139W 339 nt15.1■□□□□ 0.01
YRR1Q12172 YDJ1YNL064C 1230 nt15.05■□□□□ -0
YRR1Q12172 MOT3YMR070W 1473 nt15□□□□□ -0.01
YRR1Q12172 Q0182Q0182 405 nt14.99□□□□□ -0.01
YRR1Q12172 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.85□□□□□ -0.03
YRR1Q12172 RSB1YOR049C 1065 nt14.79□□□□□ -0.04
YRR1Q12172 URN1YPR152C 1398 nt14.76□□□□□ -0.05
YRR1Q12172 DEP1YAL013W 1218 nt14.74□□□□□ -0.05
YRR1Q12172 PUT4YOR348C 1884 nt14.72□□□□□ -0.05
YRR1Q12172 GAR1YHR089C 618 nt14.7□□□□□ -0.06
YRR1Q12172 OPI9YLR338W 858 nt14.58□□□□□ -0.08
YRR1Q12172 YNL208WYNL208W 600 nt14.53□□□□□ -0.08
YRR1Q12172 RPN10YHR200W 807 nt14.52□□□□□ -0.09
YRR1Q12172 SAH1YER043C 1350 nt14.48□□□□□ -0.09
YRR1Q12172 ARE1YCR048W 1833 nt14.44□□□□□ -0.1
YRR1Q12172 PST2YDR032C 597 nt14.44□□□□□ -0.1
YRR1Q12172 POA1YBR022W 534 nt14.24□□□□□ -0.13
YRR1Q12172 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.23□□□□□ -0.13
YRR1Q12172 NME1NME1 340 nt14.23□□□□□ -0.13
YRR1Q12172 TIR1YER011W 765 nt14.22□□□□□ -0.13
YRR1Q12172 PUN1YLR414C 792 nt14.14□□□□□ -0.15
YRR1Q12172 YKL097CYKL097C 411 nt14.11□□□□□ -0.15
YRR1Q12172 YJR018WYJR018W 363 nt14.09□□□□□ -0.15
YRR1Q12172 SSA1YAL005C 1929 nt14.07□□□□□ -0.16
YRR1Q12172 SSA3YBL075C 1950 nt13.98□□□□□ -0.17
YRR1Q12172 PTC2YER089C 1395 nt13.97□□□□□ -0.17
YRR1Q12172 BSC6YOL137W 1494 nt13.94□□□□□ -0.18
YRR1Q12172 YJR120WYJR120W 351 nt13.91□□□□□ -0.18
YRR1Q12172 BUD23YCR047C 828 nt13.87□□□□□ -0.19
YRR1Q12172 SRB2YHR041C 633 nt13.85□□□□□ -0.19
YRR1Q12172 SHU1YHL006C 453 nt13.84□□□□□ -0.19
YRR1Q12172 NAB2YGL122C 1578 nt13.79□□□□□ -0.2
YRR1Q12172 RPP2BYDR382W 333 nt13.77□□□□□ -0.21
YRR1Q12172 CSM2YIL132C 642 nt13.67□□□□□ -0.22
YRR1Q12172 FIS1YIL065C 468 nt13.62□□□□□ -0.23
YRR1Q12172 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.62□□□□□ -0.23
YRR1Q12172 DAL1YIR027C 1383 nt13.61□□□□□ -0.23
YRR1Q12172 INM2YDR287W 879 nt13.6□□□□□ -0.23
YRR1Q12172 WWM1YFL010C 636 nt13.58□□□□□ -0.24
YRR1Q12172 FPR4YLR449W 1179 nt13.54□□□□□ -0.24
YRR1Q12172 BDH2YAL061W 1254 nt13.52□□□□□ -0.25
YRR1Q12172 YGR021WYGR021W 873 nt13.49□□□□□ -0.25
YRR1Q12172 PHO4YFR034C 939 nt13.48□□□□□ -0.25
YRR1Q12172 HOM6YJR139C 1080 nt13.46□□□□□ -0.25
YRR1Q12172 YOR139CYOR139C 393 nt13.46□□□□□ -0.25
YRR1Q12172 YBL100CYBL100C 315 nt13.45□□□□□ -0.26
YRR1Q12172 PAU21YOR394W 495 nt13.44□□□□□ -0.26
YRR1Q12172 PAU22YPL282C 495 nt13.44□□□□□ -0.26
YRR1Q12172 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.37□□□□□ -0.27
YRR1Q12172 MNP1YGL068W 585 nt13.37□□□□□ -0.27
YRR1Q12172 LSM3YLR438C-A 270 nt13.35□□□□□ -0.27
YRR1Q12172 SPT5YML010W 3192 nt13.35□□□□□ -0.27
YRR1Q12172 FUN26YAL022C 1554 nt13.3□□□□□ -0.28
YRR1Q12172 ARO7YPR060C 771 nt13.29□□□□□ -0.28
YRR1Q12172 RKM5YLR137W 1104 nt13.26□□□□□ -0.29
YRR1Q12172 TRM9YML014W 840 nt13.26□□□□□ -0.29
YRR1Q12172 YPS1YLR120C 1710 nt13.24□□□□□ -0.29
YRR1Q12172 YDR095CYDR095C 411 nt13.16□□□□□ -0.3
YRR1Q12172 CCT6YDR188W 1641 nt13.14□□□□□ -0.31
YRR1Q12172 NPL3YDR432W 1245 nt13.14□□□□□ -0.31
YRR1Q12172 YOL037CYOL037C 354 nt13.13□□□□□ -0.31
YRR1Q12172 MEP2YNL142W 1500 nt13.09□□□□□ -0.31
YRR1Q12172 ALF1YNL148C 765 nt13.09□□□□□ -0.31
YRR1Q12172 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.06□□□□□ -0.32
YRR1Q12172 PAM17YKR065C 594 nt13.03□□□□□ -0.32
YRR1Q12172 SUF2tP(AGG)C 72 nt13□□□□□ -0.33
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