Protein–RNA interactions for Protein: Q03361

JIP4, Uncharacterized protein JIP4, yeastyeast

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
JIP4Q03361 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.53■■□□□ 1.36
JIP4Q03361 NOP1YDL014W 984 nt23.18■■□□□ 1.3
JIP4Q03361 NSR1YGR159C 1245 nt22.9■■□□□ 1.26
JIP4Q03361 YKL036CYKL036C 393 nt21.99■■□□□ 1.11
JIP4Q03361 YJL027CYJL027C 417 nt20.62■□□□□ 0.89
JIP4Q03361 Q0297Q0297 156 nt20.52■□□□□ 0.88
JIP4Q03361 SCS3YGL126W 1143 nt20.32■□□□□ 0.84
JIP4Q03361 SRX1YKL086W 384 nt20.27■□□□□ 0.84
JIP4Q03361 MDJ1YFL016C 1536 nt19.65■□□□□ 0.74
JIP4Q03361 YCR051WYCR051W 669 nt19.24■□□□□ 0.67
JIP4Q03361 YOL085CYOL085C 342 nt19.03■□□□□ 0.64
JIP4Q03361 SCJ1YMR214W 1134 nt18.88■□□□□ 0.61
JIP4Q03361 PKP1YIL042C 1185 nt18.61■□□□□ 0.57
JIP4Q03361 RPP1BYDL130W 321 nt18.4■□□□□ 0.54
JIP4Q03361 ATS1YAL020C 1002 nt18.37■□□□□ 0.53
JIP4Q03361 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.94■□□□□ 0.46
JIP4Q03361 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.94■□□□□ 0.46
JIP4Q03361 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.94■□□□□ 0.46
JIP4Q03361 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.94■□□□□ 0.46
JIP4Q03361 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.94■□□□□ 0.46
JIP4Q03361 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.94■□□□□ 0.46
JIP4Q03361 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.94■□□□□ 0.46
JIP4Q03361 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.94■□□□□ 0.46
JIP4Q03361 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.94■□□□□ 0.46
JIP4Q03361 CCC1YLR220W 969 nt17.71■□□□□ 0.43
JIP4Q03361 DBP2YNL112W 1641 nt17.68■□□□□ 0.42
JIP4Q03361 SCR1SCR1 522 nt17.49■□□□□ 0.39
JIP4Q03361 PET122YER153C 765 nt17.48■□□□□ 0.39
JIP4Q03361 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.18■□□□□ 0.34
JIP4Q03361 RTC3YHR087W 336 nt17.08■□□□□ 0.32
JIP4Q03361 RRN5YLR141W 1092 nt17.06■□□□□ 0.32
JIP4Q03361 PST2YDR032C 597 nt16.92■□□□□ 0.3
JIP4Q03361 RSB1YOR049C 1065 nt16.87■□□□□ 0.29
JIP4Q03361 RVS167YDR388W 1449 nt16.78■□□□□ 0.28
JIP4Q03361 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.72■□□□□ 0.27
JIP4Q03361 YDJ1YNL064C 1230 nt16.65■□□□□ 0.26
JIP4Q03361 YBR190WYBR190W 312 nt16.64■□□□□ 0.25
JIP4Q03361 YKL097CYKL097C 411 nt16.56■□□□□ 0.24
JIP4Q03361 SHR5YOL110W 714 nt16.35■□□□□ 0.21
JIP4Q03361 YGR139WYGR139W 339 nt16.14■□□□□ 0.17
JIP4Q03361 GAR1YHR089C 618 nt16.11■□□□□ 0.17
JIP4Q03361 SHU1YHL006C 453 nt16.05■□□□□ 0.16
JIP4Q03361 YOR139CYOR139C 393 nt15.79■□□□□ 0.12
JIP4Q03361 DEP1YAL013W 1218 nt15.62■□□□□ 0.09
JIP4Q03361 TIR1YER011W 765 nt15.57■□□□□ 0.08
JIP4Q03361 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.57■□□□□ 0.08
JIP4Q03361 NPL3YDR432W 1245 nt15.5■□□□□ 0.07
JIP4Q03361 YNL208WYNL208W 600 nt15.5■□□□□ 0.07
JIP4Q03361 URN1YPR152C 1398 nt15.48■□□□□ 0.07
JIP4Q03361 RPN10YHR200W 807 nt15.43■□□□□ 0.06
JIP4Q03361 SSA1YAL005C 1929 nt15.23■□□□□ 0.03
JIP4Q03361 OPI9YLR338W 858 nt15.15■□□□□ 0.02
JIP4Q03361 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.14■□□□□ 0.01
JIP4Q03361 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.14■□□□□ 0.01
JIP4Q03361 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.14■□□□□ 0.01
JIP4Q03361 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.14■□□□□ 0.01
JIP4Q03361 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.14■□□□□ 0.01
JIP4Q03361 YOL037CYOL037C 354 nt15.13■□□□□ 0.01
JIP4Q03361 YGR021WYGR021W 873 nt15.11■□□□□ 0.01
JIP4Q03361 HOM6YJR139C 1080 nt15.09■□□□□ 0.01
JIP4Q03361 SRB2YHR041C 633 nt15.08■□□□□ 0
JIP4Q03361 MNP1YGL068W 585 nt15.06■□□□□ 0
JIP4Q03361 WWM1YFL010C 636 nt14.97□□□□□ -0.01
JIP4Q03361 RKM5YLR137W 1104 nt14.86□□□□□ -0.03
JIP4Q03361 SAH1YER043C 1350 nt14.85□□□□□ -0.03
JIP4Q03361 VAR1Q0140 1197 nt14.83□□□□□ -0.04
JIP4Q03361 YJR018WYJR018W 363 nt14.82□□□□□ -0.04
JIP4Q03361 MOT3YMR070W 1473 nt14.79□□□□□ -0.04
JIP4Q03361 PUS2YGL063W 1113 nt14.77□□□□□ -0.05
JIP4Q03361 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.76□□□□□ -0.05
JIP4Q03361 YJR120WYJR120W 351 nt14.73□□□□□ -0.05
JIP4Q03361 YLR281CYLR281C 468 nt14.72□□□□□ -0.05
JIP4Q03361 PUN1YLR414C 792 nt14.72□□□□□ -0.05
JIP4Q03361 BSC6YOL137W 1494 nt14.71□□□□□ -0.05
JIP4Q03361 RPP2BYDR382W 333 nt14.7□□□□□ -0.06
JIP4Q03361 SSA3YBL075C 1950 nt14.6□□□□□ -0.07
JIP4Q03361 PUT4YOR348C 1884 nt14.59□□□□□ -0.07
JIP4Q03361 NME1NME1 340 nt14.58□□□□□ -0.08
JIP4Q03361 WHI5YOR083W 888 nt14.56□□□□□ -0.08
JIP4Q03361 BDH2YAL061W 1254 nt14.53□□□□□ -0.08
JIP4Q03361 ARE1YCR048W 1833 nt14.52□□□□□ -0.09
JIP4Q03361 Q0182Q0182 405 nt14.5□□□□□ -0.09
JIP4Q03361 MRPL8YJL063C 717 nt14.5□□□□□ -0.09
JIP4Q03361 LSM3YLR438C-A 270 nt14.49□□□□□ -0.09
JIP4Q03361 PTC2YER089C 1395 nt14.39□□□□□ -0.11
JIP4Q03361 FMP45YDL222C 930 nt14.38□□□□□ -0.11
JIP4Q03361 CSM2YIL132C 642 nt14.35□□□□□ -0.11
JIP4Q03361 YPR011CYPR011C 981 nt14.34□□□□□ -0.11
JIP4Q03361 DSK2YMR276W 1122 nt14.33□□□□□ -0.12
JIP4Q03361 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.32□□□□□ -0.12
JIP4Q03361 YCH1YGR203W 447 nt14.31□□□□□ -0.12
JIP4Q03361 IMP2'YIL154C 1041 nt14.3□□□□□ -0.12
JIP4Q03361 INM2YDR287W 879 nt14.24□□□□□ -0.13
JIP4Q03361 ADO1YJR105W 1023 nt14.23□□□□□ -0.13
JIP4Q03361 YLR236CYLR236C 324 nt14.23□□□□□ -0.13
JIP4Q03361 YDR509WYDR509W 348 nt14.21□□□□□ -0.13
JIP4Q03361 POA1YBR022W 534 nt14.18□□□□□ -0.14
JIP4Q03361 UBX6YJL048C 1191 nt14.17□□□□□ -0.14
JIP4Q03361 YBL100CYBL100C 315 nt14.17□□□□□ -0.14
JIP4Q03361 PAU21YOR394W 495 nt14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.4 ms