Protein–RNA interactions for Protein: Q12072

IOC2, ISWI one complex protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IOC2Q12072 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.82■□□□□ 0.76
IOC2Q12072 NSR1YGR159C 1245 nt19.78■□□□□ 0.76
IOC2Q12072 NOP1YDL014W 984 nt19.28■□□□□ 0.68
IOC2Q12072 MDJ1YFL016C 1536 nt17.71■□□□□ 0.43
IOC2Q12072 YKL036CYKL036C 393 nt17.7■□□□□ 0.42
IOC2Q12072 Q0297Q0297 156 nt16.83■□□□□ 0.28
IOC2Q12072 SRX1YKL086W 384 nt16.82■□□□□ 0.28
IOC2Q12072 YJL027CYJL027C 417 nt16.52■□□□□ 0.24
IOC2Q12072 YGR139WYGR139W 339 nt16.3■□□□□ 0.2
IOC2Q12072 SCS3YGL126W 1143 nt16.05■□□□□ 0.16
IOC2Q12072 YCR051WYCR051W 669 nt15.96■□□□□ 0.15
IOC2Q12072 VAR1Q0140 1197 nt15.88■□□□□ 0.13
IOC2Q12072 SSA3YBL075C 1950 nt15.64■□□□□ 0.09
IOC2Q12072 DBP2YNL112W 1641 nt15.57■□□□□ 0.08
IOC2Q12072 YOL085CYOL085C 342 nt15.33■□□□□ 0.04
IOC2Q12072 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.23■□□□□ 0.03
IOC2Q12072 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.23■□□□□ 0.03
IOC2Q12072 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.23■□□□□ 0.03
IOC2Q12072 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.23■□□□□ 0.03
IOC2Q12072 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.23■□□□□ 0.03
IOC2Q12072 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.23■□□□□ 0.03
IOC2Q12072 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.23■□□□□ 0.03
IOC2Q12072 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.23■□□□□ 0.03
IOC2Q12072 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.23■□□□□ 0.03
IOC2Q12072 YBR190WYBR190W 312 nt15.15■□□□□ 0.02
IOC2Q12072 RPP1BYDL130W 321 nt15.1■□□□□ 0.01
IOC2Q12072 PKP1YIL042C 1185 nt15.09■□□□□ 0.01
IOC2Q12072 CCC1YLR220W 969 nt15.09■□□□□ 0.01
IOC2Q12072 YDR509WYDR509W 348 nt14.86□□□□□ -0.03
IOC2Q12072 RTC3YHR087W 336 nt14.83□□□□□ -0.04
IOC2Q12072 RVS167YDR388W 1449 nt14.66□□□□□ -0.06
IOC2Q12072 Q0017Q0017 162 nt14.58□□□□□ -0.08
IOC2Q12072 SCJ1YMR214W 1134 nt14.5□□□□□ -0.09
IOC2Q12072 PET122YER153C 765 nt14.41□□□□□ -0.1
IOC2Q12072 Q0142Q0142 177 nt14.41□□□□□ -0.1
IOC2Q12072 CSM2YIL132C 642 nt14.41□□□□□ -0.1
IOC2Q12072 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.4□□□□□ -0.1
IOC2Q12072 NME1NME1 340 nt14.4□□□□□ -0.1
IOC2Q12072 PAM17YKR065C 594 nt14.36□□□□□ -0.11
IOC2Q12072 ATS1YAL020C 1002 nt14.35□□□□□ -0.11
IOC2Q12072 PAU21YOR394W 495 nt14.31□□□□□ -0.12
IOC2Q12072 PAU22YPL282C 495 nt14.31□□□□□ -0.12
IOC2Q12072 SCR1SCR1 522 nt14.29□□□□□ -0.12
IOC2Q12072 Q0144Q0144 330 nt14.23□□□□□ -0.13
IOC2Q12072 ARO7YPR060C 771 nt14.18□□□□□ -0.14
IOC2Q12072 MOT3YMR070W 1473 nt14.11□□□□□ -0.15
IOC2Q12072 SHR5YOL110W 714 nt14.09□□□□□ -0.15
IOC2Q12072 BMT5YIL096C 1011 nt14.01□□□□□ -0.17
IOC2Q12072 RRN5YLR141W 1092 nt14.01□□□□□ -0.17
IOC2Q12072 SEM1YDR363W-A 270 nt13.97□□□□□ -0.17
IOC2Q12072 BUR6YER159C 429 nt13.95□□□□□ -0.18
IOC2Q12072 YDJ1YNL064C 1230 nt13.94□□□□□ -0.18
IOC2Q12072 REG2YBR050C 1017 nt13.93□□□□□ -0.18
IOC2Q12072 PUT4YOR348C 1884 nt13.88□□□□□ -0.19
IOC2Q12072 Q0182Q0182 405 nt13.84□□□□□ -0.19
IOC2Q12072 Q0255Q0255 1419 nt13.82□□□□□ -0.2
IOC2Q12072 URN1YPR152C 1398 nt13.8□□□□□ -0.2
IOC2Q12072 DEP1YAL013W 1218 nt13.74□□□□□ -0.21
IOC2Q12072 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.73□□□□□ -0.21
IOC2Q12072 RSB1YOR049C 1065 nt13.7□□□□□ -0.22
IOC2Q12072 YOR169CYOR169C 465 nt13.69□□□□□ -0.22
IOC2Q12072 Q0010Q0010 387 nt13.66□□□□□ -0.22
IOC2Q12072 AI5_BETAQ0075 1065 nt13.63□□□□□ -0.23
IOC2Q12072 GAR1YHR089C 618 nt13.63□□□□□ -0.23
IOC2Q12072 OPI9YLR338W 858 nt13.63□□□□□ -0.23
IOC2Q12072 YGL188CYGL188C 174 nt13.61□□□□□ -0.23
IOC2Q12072 SAH1YER043C 1350 nt13.58□□□□□ -0.23
IOC2Q12072 RPN10YHR200W 807 nt13.58□□□□□ -0.24
IOC2Q12072 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt13.58□□□□□ -0.24
IOC2Q12072 ARE1YCR048W 1833 nt13.57□□□□□ -0.24
IOC2Q12072 AI3Q0060 1248 nt13.55□□□□□ -0.24
IOC2Q12072 SPT5YML010W 3192 nt13.53□□□□□ -0.24
IOC2Q12072 SSA4YER103W 1929 nt13.51□□□□□ -0.25
IOC2Q12072 YNL208WYNL208W 600 nt13.51□□□□□ -0.25
IOC2Q12072 SRN2YLR119W 642 nt13.49□□□□□ -0.25
IOC2Q12072 YCR099CYCR099C 468 nt13.44□□□□□ -0.26
IOC2Q12072 POA1YBR022W 534 nt13.44□□□□□ -0.26
IOC2Q12072 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.43□□□□□ -0.26
IOC2Q12072 ATP6Q0085 780 nt13.37□□□□□ -0.27
IOC2Q12072 PST2YDR032C 597 nt13.31□□□□□ -0.28
IOC2Q12072 PUN1YLR414C 792 nt13.25□□□□□ -0.29
IOC2Q12072 ARP10YDR106W 855 nt13.24□□□□□ -0.29
IOC2Q12072 BSC6YOL137W 1494 nt13.19□□□□□ -0.3
IOC2Q12072 AIR1YIL079C 1083 nt13.19□□□□□ -0.3
IOC2Q12072 BDF1YLR399C 2061 nt13.18□□□□□ -0.3
IOC2Q12072 TIR1YER011W 765 nt13.18□□□□□ -0.3
IOC2Q12072 YJR018WYJR018W 363 nt13.15□□□□□ -0.3
IOC2Q12072 PET20YPL159C 762 nt13.15□□□□□ -0.3
IOC2Q12072 BUD23YCR047C 828 nt13.11□□□□□ -0.31
IOC2Q12072 PAC11YDR488C 1602 nt13.1□□□□□ -0.31
IOC2Q12072 PTC2YER089C 1395 nt13.1□□□□□ -0.31
IOC2Q12072 ARA2YMR041C 1008 nt13.09□□□□□ -0.31
IOC2Q12072 SSA1YAL005C 1929 nt13.01□□□□□ -0.33
IOC2Q12072 NAB2YGL122C 1578 nt12.96□□□□□ -0.33
IOC2Q12072 TAT1YBR069C 1860 nt12.95□□□□□ -0.34
IOC2Q12072 NVJ2YPR091C 2313 nt12.92□□□□□ -0.34
IOC2Q12072 YNR068CYNR068C 819 nt12.89□□□□□ -0.35
IOC2Q12072 YJR120WYJR120W 351 nt12.88□□□□□ -0.35
IOC2Q12072 snR78snR78 87 nt12.87□□□□□ -0.35
IOC2Q12072 KTR3YBR205W 1215 nt12.87□□□□□ -0.35
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