RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C-A

VMA10, Transcript of Subunit G of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA10, Length 345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA10	YHR039C-A	HTA2	P04912	132 aa		6.45	□□□□□ -1.38
VMA10	YHR039C-A	IOC2	Q12072	812 aa		6.45	□□□□□ -1.38
VMA10	YHR039C-A	SOL3	P38858	249 aa		6.43	□□□□□ -1.38
VMA10	YHR039C-A	LDB19	Q12502	818 aa		6.4	□□□□□ -1.38
VMA10	YHR039C-A	YEL023C	P39992	682 aa		6.39	□□□□□ -1.39
VMA10	YHR039C-A	YGR273C	P53329	174 aa		6.39	□□□□□ -1.39
VMA10	YHR039C-A	NST1	P53935	1240 aa		6.39	□□□□□ -1.39
VMA10	YHR039C-A	CKB1	P43639	278 aa		6.38	□□□□□ -1.39
VMA10	YHR039C-A	JIP4	Q03361	876 aa		6.37	□□□□□ -1.39
VMA10	YHR039C-A	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
VMA10	YHR039C-A	PTC4	P38089	393 aa		6.36	□□□□□ -1.39
VMA10	YHR039C-A	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
VMA10	YHR039C-A	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
VMA10	YHR039C-A	RTG1	P32607	177 aa		6.35	□□□□□ -1.39
VMA10	YHR039C-A	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
VMA10	YHR039C-A	VHR2	P40041	505 aa		6.34	□□□□□ -1.39
VMA10	YHR039C-A	DAN4	P47179	1161 aa		6.34	□□□□□ -1.39
VMA10	YHR039C-A	MPH3	P0CE00	602 aa		6.33	□□□□□ -1.4
VMA10	YHR039C-A	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
VMA10	YHR039C-A	AI4	P03878	556 aa		6.32	□□□□□ -1.4
VMA10	YHR039C-A	PBS2	P08018	668 aa		6.31	□□□□□ -1.4
VMA10	YHR039C-A	KEX1	P09620	729 aa		6.31	□□□□□ -1.4
VMA10	YHR039C-A	SEC61	P32915	480 aa		6.31	□□□□□ -1.4
VMA10	YHR039C-A	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
VMA10	YHR039C-A	FKH1	P40466	484 aa		6.31	□□□□□ -1.4
VMA10	YHR039C-A	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
VMA10	YHR039C-A	YDR090C	Q03193	310 aa		6.3	□□□□□ -1.4
VMA10	YHR039C-A	NCR1	Q12200	1170 aa		6.3	□□□□□ -1.4
VMA10	YHR039C-A	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
VMA10	YHR039C-A	COX6	P00427	148 aa		6.27	□□□□□ -1.41
VMA10	YHR039C-A	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.27	□□□□□ -1.41	not detected
VMA10	YHR039C-A	RAD54	P32863	898 aa		6.26	□□□□□ -1.41
VMA10	YHR039C-A	DSF2	P38213	736 aa		6.26	□□□□□ -1.41
VMA10	YHR039C-A	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
VMA10	YHR039C-A	SLI15	P38283	698 aa		6.25	□□□□□ -1.41
VMA10	YHR039C-A	PML39	Q03760	334 aa		6.25	□□□□□ -1.41
VMA10	YHR039C-A	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
VMA10	YHR039C-A	KIC1	P38692	1080 aa		6.23	□□□□□ -1.41
VMA10	YHR039C-A	MID1	P41821	548 aa		6.23	□□□□□ -1.41
VMA10	YHR039C-A	YDL129W	Q07555	291 aa		6.22	□□□□□ -1.41
VMA10	YHR039C-A	MAM3	Q12296	706 aa		6.22	□□□□□ -1.41
VMA10	YHR039C-A	LEU3	P08638	886 aa		6.19	□□□□□ -1.42
VMA10	YHR039C-A	SAP30	P38429	201 aa		6.19	□□□□□ -1.42
VMA10	YHR039C-A	IES2	P40154	320 aa		6.19	□□□□□ -1.42
VMA10	YHR039C-A	YJL171C	P46992	396 aa		6.19	□□□□□ -1.42
VMA10	YHR039C-A	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
VMA10	YHR039C-A	BMT6	Q12291	365 aa		6.17	□□□□□ -1.42
VMA10	YHR039C-A	PEX29	Q03370	554 aa		6.16	□□□□□ -1.42
VMA10	YHR039C-A	CDC73	Q06697	393 aa		6.16	□□□□□ -1.42
VMA10	YHR039C-A	MPC54	Q08550	464 aa		6.16	□□□□□ -1.42
VMA10	YHR039C-A	DIT2	P21595	489 aa		6.14	□□□□□ -1.43
VMA10	YHR039C-A	DPL1	Q05567	589 aa		6.14	□□□□□ -1.43
VMA10	YHR039C-A	ORC6	P38826	435 aa		6.13	□□□□□ -1.43
VMA10	YHR039C-A	YDR344C	Q05510	147 aa		6.13	□□□□□ -1.43
VMA10	YHR039C-A	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
VMA10	YHR039C-A	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
VMA10	YHR039C-A	LEO1	P38439	464 aa		6.11	□□□□□ -1.43
VMA10	YHR039C-A	NMA111	P53920	997 aa		6.11	□□□□□ -1.43
VMA10	YHR039C-A	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
VMA10	YHR039C-A	ARH1	P48360	493 aa		6.09	□□□□□ -1.43
VMA10	YHR039C-A	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
VMA10	YHR039C-A	CSC1	Q06538	782 aa		6.09	□□□□□ -1.43
VMA10	YHR039C-A	ISU2	Q12056	156 aa		6.09	□□□□□ -1.43
VMA10	YHR039C-A	RGR1	P19263	1082 aa		6.08	□□□□□ -1.44
VMA10	YHR039C-A	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
VMA10	YHR039C-A	HAP5	Q02516	242 aa		6.08	□□□□□ -1.44
VMA10	YHR039C-A	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
VMA10	YHR039C-A	PRE3	P38624	215 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VMA10	YHR039C-A	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
VMA10	YHR039C-A	TFB4	Q12004	338 aa		6.06	□□□□□ -1.44
VMA10	YHR039C-A	GLC3	P32775	704 aa		6.05	□□□□□ -1.44
VMA10	YHR039C-A	PEX21	P50091	288 aa		6.05	□□□□□ -1.44
VMA10	YHR039C-A	TAF7	Q05021	590 aa		6.05	□□□□□ -1.44
VMA10	YHR039C-A	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
VMA10	YHR039C-A	YPR109W	Q06104	294 aa		6.04	□□□□□ -1.44
VMA10	YHR039C-A	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
VMA10	YHR039C-A	YRR1	Q12172	810 aa		6.03	□□□□□ -1.44
VMA10	YHR039C-A	SPT23	P35210	1082 aa		6.02	□□□□□ -1.45
VMA10	YHR039C-A	ATF2	P53296	535 aa		6.02	□□□□□ -1.45
VMA10	YHR039C-A	BNI4	P53858	892 aa		6.02	□□□□□ -1.45
VMA10	YHR039C-A	AIM7	Q12156	149 aa		6.01	□□□□□ -1.45
VMA10	YHR039C-A	PDR1	P12383	1068 aa		6	□□□□□ -1.45
VMA10	YHR039C-A	TEA1	P47988	759 aa		6	□□□□□ -1.45
VMA10	YHR039C-A	CLB5	P30283	435 aa		5.98	□□□□□ -1.45
VMA10	YHR039C-A	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
VMA10	YHR039C-A	KIN1	P13185	1064 aa		5.97	□□□□□ -1.45
VMA10	YHR039C-A	RAM1	P22007	431 aa		5.97	□□□□□ -1.45
VMA10	YHR039C-A	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
VMA10	YHR039C-A	YPR015C	Q12531	247 aa		5.95	□□□□□ -1.46
VMA10	YHR039C-A	NUD1	P32336	851 aa		5.94	□□□□□ -1.46
VMA10	YHR039C-A	NIS1	P53939	407 aa		5.93	□□□□□ -1.46
VMA10	YHR039C-A	STR2	P47164	639 aa		5.92	□□□□□ -1.46
VMA10	YHR039C-A	ISM1	P48526	1002 aa		5.92	□□□□□ -1.46
VMA10	YHR039C-A	SIT4	P20604	311 aa		5.9	□□□□□ -1.46
VMA10	YHR039C-A	NPL4	P33755	580 aa		5.9	□□□□□ -1.46
VMA10	YHR039C-A	VRP1	P37370	817 aa		5.9	□□□□□ -1.46
VMA10	YHR039C-A	FPK1	P53739	893 aa		5.9	□□□□□ -1.46
VMA10	YHR039C-A	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
VMA10	YHR039C-A	BCK2	P33306	851 aa		5.89	□□□□□ -1.47
VMA10	YHR039C-A	KEX2	P13134	814 aa		5.88	□□□□□ -1.47

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