Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.57■□□□□ 0.88
BUD20Q08004 NSR1YGR159C 1245 nt20.52■□□□□ 0.88
BUD20Q08004 NOP1YDL014W 984 nt19.91■□□□□ 0.78
BUD20Q08004 MDJ1YFL016C 1536 nt18.37■□□□□ 0.53
BUD20Q08004 YKL036CYKL036C 393 nt18.31■□□□□ 0.52
BUD20Q08004 Q0297Q0297 156 nt17.44■□□□□ 0.38
BUD20Q08004 SRX1YKL086W 384 nt17.44■□□□□ 0.38
BUD20Q08004 YJL027CYJL027C 417 nt17.07■□□□□ 0.32
BUD20Q08004 SCS3YGL126W 1143 nt16.64■□□□□ 0.25
BUD20Q08004 YCR051WYCR051W 669 nt16.53■□□□□ 0.24
BUD20Q08004 DBP2YNL112W 1641 nt16.24■□□□□ 0.19
BUD20Q08004 YOL085CYOL085C 342 nt15.9■□□□□ 0.14
BUD20Q08004 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.84■□□□□ 0.13
BUD20Q08004 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.84■□□□□ 0.13
BUD20Q08004 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.84■□□□□ 0.13
BUD20Q08004 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.84■□□□□ 0.13
BUD20Q08004 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.84■□□□□ 0.13
BUD20Q08004 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.84■□□□□ 0.13
BUD20Q08004 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.84■□□□□ 0.13
BUD20Q08004 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.84■□□□□ 0.13
BUD20Q08004 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.84■□□□□ 0.13
BUD20Q08004 PKP1YIL042C 1185 nt15.69■□□□□ 0.1
BUD20Q08004 CCC1YLR220W 969 nt15.68■□□□□ 0.1
BUD20Q08004 YBR190WYBR190W 312 nt15.65■□□□□ 0.1
BUD20Q08004 RPP1BYDL130W 321 nt15.64■□□□□ 0.09
BUD20Q08004 RTC3YHR087W 336 nt15.29■□□□□ 0.04
BUD20Q08004 SCJ1YMR214W 1134 nt15.14■□□□□ 0.01
BUD20Q08004 RVS167YDR388W 1449 nt15.14■□□□□ 0.01
BUD20Q08004 PET122YER153C 765 nt14.99□□□□□ -0.01
BUD20Q08004 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.96□□□□□ -0.01
BUD20Q08004 ATS1YAL020C 1002 nt14.84□□□□□ -0.03
BUD20Q08004 YGR139WYGR139W 339 nt14.78□□□□□ -0.04
BUD20Q08004 SCR1SCR1 522 nt14.73□□□□□ -0.05
BUD20Q08004 SHR5YOL110W 714 nt14.63□□□□□ -0.07
BUD20Q08004 RRN5YLR141W 1092 nt14.55□□□□□ -0.08
BUD20Q08004 YDJ1YNL064C 1230 nt14.45□□□□□ -0.1
BUD20Q08004 MOT3YMR070W 1473 nt14.33□□□□□ -0.12
BUD20Q08004 PUT4YOR348C 1884 nt14.33□□□□□ -0.12
BUD20Q08004 URN1YPR152C 1398 nt14.3□□□□□ -0.12
BUD20Q08004 DEP1YAL013W 1218 nt14.28□□□□□ -0.12
BUD20Q08004 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.26□□□□□ -0.13
BUD20Q08004 Q0182Q0182 405 nt14.24□□□□□ -0.13
BUD20Q08004 RSB1YOR049C 1065 nt14.19□□□□□ -0.14
BUD20Q08004 GAR1YHR089C 618 nt14.16□□□□□ -0.14
BUD20Q08004 OPI9YLR338W 858 nt14.1□□□□□ -0.15
BUD20Q08004 SAH1YER043C 1350 nt14.07□□□□□ -0.16
BUD20Q08004 ARE1YCR048W 1833 nt14.04□□□□□ -0.16
BUD20Q08004 YNL208WYNL208W 600 nt14.01□□□□□ -0.17
BUD20Q08004 RPN10YHR200W 807 nt13.99□□□□□ -0.17
BUD20Q08004 POA1YBR022W 534 nt13.87□□□□□ -0.19
BUD20Q08004 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.84□□□□□ -0.19
BUD20Q08004 PST2YDR032C 597 nt13.78□□□□□ -0.2
BUD20Q08004 NME1NME1 340 nt13.75□□□□□ -0.21
BUD20Q08004 TIR1YER011W 765 nt13.68□□□□□ -0.22
BUD20Q08004 PUN1YLR414C 792 nt13.67□□□□□ -0.22
BUD20Q08004 YJR018WYJR018W 363 nt13.62□□□□□ -0.23
BUD20Q08004 BSC6YOL137W 1494 nt13.59□□□□□ -0.23
BUD20Q08004 SSA1YAL005C 1929 nt13.58□□□□□ -0.24
BUD20Q08004 SSA3YBL075C 1950 nt13.58□□□□□ -0.24
BUD20Q08004 PTC2YER089C 1395 nt13.56□□□□□ -0.24
BUD20Q08004 BUD23YCR047C 828 nt13.5□□□□□ -0.25
BUD20Q08004 YJR120WYJR120W 351 nt13.47□□□□□ -0.25
BUD20Q08004 SRB2YHR041C 633 nt13.39□□□□□ -0.27
BUD20Q08004 NAB2YGL122C 1578 nt13.37□□□□□ -0.27
BUD20Q08004 CSM2YIL132C 642 nt13.34□□□□□ -0.27
BUD20Q08004 RPP2BYDR382W 333 nt13.28□□□□□ -0.28
BUD20Q08004 SHU1YHL006C 453 nt13.26□□□□□ -0.29
BUD20Q08004 FIS1YIL065C 468 nt13.21□□□□□ -0.29
BUD20Q08004 DAL1YIR027C 1383 nt13.18□□□□□ -0.3
BUD20Q08004 FPR4YLR449W 1179 nt13.15□□□□□ -0.3
BUD20Q08004 YKL097CYKL097C 411 nt13.14□□□□□ -0.31
BUD20Q08004 PAU21YOR394W 495 nt13.14□□□□□ -0.31
BUD20Q08004 PAU22YPL282C 495 nt13.14□□□□□ -0.31
BUD20Q08004 INM2YDR287W 879 nt13.13□□□□□ -0.31
BUD20Q08004 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.1□□□□□ -0.31
BUD20Q08004 WWM1YFL010C 636 nt13.09□□□□□ -0.31
BUD20Q08004 PHO4YFR034C 939 nt13.07□□□□□ -0.32
BUD20Q08004 SPT5YML010W 3192 nt13.06□□□□□ -0.32
BUD20Q08004 BDH2YAL061W 1254 nt13.03□□□□□ -0.32
BUD20Q08004 YBL100CYBL100C 315 nt13□□□□□ -0.33
BUD20Q08004 ARO7YPR060C 771 nt12.99□□□□□ -0.33
BUD20Q08004 YGR021WYGR021W 873 nt12.92□□□□□ -0.34
BUD20Q08004 HOM6YJR139C 1080 nt12.92□□□□□ -0.34
BUD20Q08004 MNP1YGL068W 585 nt12.87□□□□□ -0.35
BUD20Q08004 FUN26YAL022C 1554 nt12.86□□□□□ -0.35
BUD20Q08004 YPS1YLR120C 1710 nt12.85□□□□□ -0.35
BUD20Q08004 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.84□□□□□ -0.35
BUD20Q08004 PAM17YKR065C 594 nt12.83□□□□□ -0.36
BUD20Q08004 LSM3YLR438C-A 270 nt12.83□□□□□ -0.36
BUD20Q08004 TRM9YML014W 840 nt12.79□□□□□ -0.36
BUD20Q08004 YDR095CYDR095C 411 nt12.76□□□□□ -0.37
BUD20Q08004 MEP2YNL142W 1500 nt12.75□□□□□ -0.37
BUD20Q08004 RKM5YLR137W 1104 nt12.72□□□□□ -0.37
BUD20Q08004 VAR1Q0140 1197 nt12.71□□□□□ -0.37
BUD20Q08004 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.7□□□□□ -0.38
BUD20Q08004 YOR139CYOR139C 393 nt12.7□□□□□ -0.38
BUD20Q08004 REG2YBR050C 1017 nt12.68□□□□□ -0.38
BUD20Q08004 CCT6YDR188W 1641 nt12.68□□□□□ -0.38
BUD20Q08004 ALF1YNL148C 765 nt12.66□□□□□ -0.38
BUD20Q08004 YDR509WYDR509W 348 nt12.64□□□□□ -0.39
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