RNA–Protein interactions for RNA: YER113C

TMN3, Transcript of Protein with a role in cellular adhesion and filamentous growth, yeast

Gene TMN3, Length 2,121 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMN3	YER113C	ATH1	P48016	1211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TMN3	YER113C	SEC61	P32915	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMN3	YER113C	YEL023C	P39992	682 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMN3	YER113C	GUT1	P32190	709 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMN3	YER113C	JIP4	Q03361	876 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMN3	YER113C	NCR1	Q12200	1170 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMN3	YER113C	DMA1	P38823	416 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMN3	YER113C	DAN4	P47179	1161 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMN3	YER113C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMN3	YER113C	PTC4	P38089	393 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMN3	YER113C	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TMN3	YER113C	BMT6	Q12291	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMN3	YER113C	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMN3	YER113C	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TMN3	YER113C	NST1	P53935	1240 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMN3	YER113C	SOL3	P38858	249 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TMN3	YER113C	INO80	P53115	1489 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TMN3	YER113C	YDL129W	Q07555	291 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TMN3	YER113C	SGS1	P35187	1447 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TMN3	YER113C	SAP30	P38429	201 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TMN3	YER113C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
TMN3	YER113C	YGR273C	P53329	174 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TMN3	YER113C	AI4	P03878	556 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TMN3	YER113C	PML39	Q03760	334 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TMN3	YER113C	MPH3	P0CE00	602 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TMN3	YER113C	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
TMN3	YER113C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TMN3	YER113C	MID1	P41821	548 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TMN3	YER113C	IFH1	P39520	1085 aa		4.44	□□□□□ -1.7
TMN3	YER113C	YDR344C	Q05510	147 aa		4.43	□□□□□ -1.7
TMN3	YER113C	KEX1	P09620	729 aa		4.42	□□□□□ -1.7
TMN3	YER113C	YPR148C	Q06523	435 aa		4.42	□□□□□ -1.7
TMN3	YER113C	PRE3	P38624	215 aa		4.42	□□□□□ -1.7
TMN3	YER113C	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
TMN3	YER113C	VHR2	P40041	505 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TMN3	YER113C	SWR1	Q05471	1514 aa		4.4	□□□□□ -1.7
TMN3	YER113C	PEX29	Q03370	554 aa		4.4	□□□□□ -1.7
TMN3	YER113C	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.7
TMN3	YER113C	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
TMN3	YER113C	SLI15	P38283	698 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TMN3	YER113C	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TMN3	YER113C	VPS70	P47161	811 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TMN3	YER113C	ARH1	P48360	493 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TMN3	YER113C	MPC54	Q08550	464 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TMN3	YER113C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.37	□□□□□ -1.71	not detected
TMN3	YER113C	RAD54	P32863	898 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TMN3	YER113C	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TMN3	YER113C	HAP5	Q02516	242 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMN3	YER113C	YDR090C	Q03193	310 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMN3	YER113C	DPL1	Q05567	589 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TMN3	YER113C	BCK2	P33306	851 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TMN3	YER113C	SPT23	P35210	1082 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	NMA111	P53920	997 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	CDC73	Q06697	393 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	4.33	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	HSL1	P34244	1518 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	KIC1	P38692	1080 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	BNI4	P53858	892 aa		4.32	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	DNA2	P38859	1522 aa		4.32	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	VRP1	P37370	817 aa		4.31	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	KOG1	P38873	1557 aa		4.3	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	CKB1	P43639	278 aa		4.3	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	ISU2	Q12056	156 aa		4.3	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	COX6	P00427	148 aa		4.28	□□□□□ -1.72
TMN3	YER113C	PBS2	P08018	668 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	ORC6	P38826	435 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	XDJ1	P39102	459 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	RAM1	P22007	431 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	YPR015C	Q12531	247 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	PDR1	P12383	1068 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	PEX21	P50091	288 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	CSC1	Q06538	782 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	SSN2	P38931	1420 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	HIR3	P47171	1648 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	TFB4	Q12004	338 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	YRR1	Q12172	810 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	DSF2	P38213	736 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	MAM3	Q12296	706 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TMN3	YER113C	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TMN3	YER113C	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TMN3	YER113C	RGR1	P19263	1082 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMN3	YER113C	IES2	P40154	320 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TMN3	YER113C	NUD1	P32336	851 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMN3	YER113C	STR2	P47164	639 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMN3	YER113C	GYP1	Q08484	637 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TMN3	YER113C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TMN3	YER113C	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TMN3	YER113C	LEU3	P08638	886 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TMN3	YER113C	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TMN3	YER113C	YPR109W	Q06104	294 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TMN3	YER113C	ISM1	P48526	1002 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TMN3	YER113C	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74

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