RNA–Protein interactions for RNA: YDR074W

TPS2, Transcript of Phosphatase subunit of the trehalose-6-P synthase/phosphatase complex, yeast

Gene TPS2, Length 2,691 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TPS2	YDR074W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TPS2	YDR074W	CKB1	P43639	278 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TPS2	YDR074W	IOC2	Q12072	812 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TPS2	YDR074W	SOL3	P38858	249 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TPS2	YDR074W	YGR273C	P53329	174 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TPS2	YDR074W	YEL023C	P39992	682 aa		5	□□□□□ -1.61
TPS2	YDR074W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TPS2	YDR074W	NST1	P53935	1240 aa		5	□□□□□ -1.61
TPS2	YDR074W	JIP4	Q03361	876 aa		5	□□□□□ -1.61
TPS2	YDR074W	LDB19	Q12502	818 aa		5	□□□□□ -1.61
TPS2	YDR074W	PTC4	P38089	393 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TPS2	YDR074W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TPS2	YDR074W	AI4	P03878	556 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPS2	YDR074W	MPH3	P0CE00	602 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPS2	YDR074W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TPS2	YDR074W	DAN4	P47179	1161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TPS2	YDR074W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	RTG1	P32607	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	VHR2	P40041	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	PBS2	P08018	668 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	SEC61	P32915	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	KEX1	P09620	729 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	FKH1	P40466	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	DSF2	P38213	736 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	COX6	P00427	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	YDR090C	Q03193	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	NCR1	Q12200	1170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	RAD54	P32863	898 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
TPS2	YDR074W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	LEU3	P08638	886 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	KIC1	P38692	1080 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TPS2	YDR074W	MAM3	Q12296	706 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPS2	YDR074W	PML39	Q03760	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPS2	YDR074W	SLI15	P38283	698 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPS2	YDR074W	YDL129W	Q07555	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPS2	YDR074W	IES2	P40154	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPS2	YDR074W	MID1	P41821	548 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPS2	YDR074W	YJL171C	P46992	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPS2	YDR074W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TPS2	YDR074W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	SAP30	P38429	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	BMT6	Q12291	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	PEX29	Q03370	554 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	ORC6	P38826	435 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	MPC54	Q08550	464 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	DPL1	Q05567	589 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	CDC73	Q06697	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	DIT2	P21595	489 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	TAF7	Q05021	590 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	CSC1	Q06538	782 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	ARH1	P48360	493 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	LEO1	P38439	464 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	NMA111	P53920	997 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	ISU2	Q12056	156 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TPS2	YDR074W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	HAP5	Q02516	242 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	TFB4	Q12004	338 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	RGR1	P19263	1082 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	PEX21	P50091	288 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	YDR344C	Q05510	147 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	GLC3	P32775	704 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	PRE3	P38624	215 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	AIM7	Q12156	149 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	ATF2	P53296	535 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	SPT23	P35210	1082 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	CLB5	P30283	435 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	BNI4	P53858	892 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	YRR1	Q12172	810 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	TEA1	P47988	759 aa		4.71	□□□□□ -1.65
TPS2	YDR074W	KIN1	P13185	1064 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TPS2	YDR074W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TPS2	YDR074W	PDR1	P12383	1068 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TPS2	YDR074W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TPS2	YDR074W	RAM1	P22007	431 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TPS2	YDR074W	NUD1	P32336	851 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TPS2	YDR074W	NIS1	P53939	407 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TPS2	YDR074W	NPL4	P33755	580 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPS2	YDR074W	YPR015C	Q12531	247 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPS2	YDR074W	SIT4	P20604	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TPS2	YDR074W	STR2	P47164	639 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TPS2	YDR074W	FPK1	P53739	893 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TPS2	YDR074W	ISM1	P48526	1002 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TPS2	YDR074W	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TPS2	YDR074W	BCK2	P33306	851 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TPS2	YDR074W	VRP1	P37370	817 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TPS2	YDR074W	RTF1	P53064	558 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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