RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639850.1

ME2-216, Transcript of malic enzyme 2, human

TSL 5 BASIC

Gene ME2, Length 2,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME2-216	ENST00000639850	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ME2-216	ENST00000639850	ERCC6	Q03468	1493 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ME2-216	ENST00000639850	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ME2-216	ENST00000639850	P3H3	Q8IVL6	736 aa		31.13	■■■□□ 2.57
ME2-216	ENST00000639850	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	31.13	■■■□□ 2.57
ME2-216	ENST00000639850	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.12	■■■□□ 2.57
ME2-216	ENST00000639850	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	31.1	■■■□□ 2.57
ME2-216	ENST00000639850	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ME2-216	ENST00000639850	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		31.07	■■■□□ 2.56
ME2-216	ENST00000639850	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.07	■■■□□ 2.56
ME2-216	ENST00000639850	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.03	■■■□□ 2.56
ME2-216	ENST00000639850	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
ME2-216	ENST00000639850	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.01	■■■□□ 2.55
ME2-216	ENST00000639850	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31	■■■□□ 2.55
ME2-216	ENST00000639850	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	31	■■■□□ 2.55
ME2-216	ENST00000639850	SAMD9	Q5K651	1589 aa		30.97	■■■□□ 2.55
ME2-216	ENST00000639850	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		30.95	■■■□□ 2.54
ME2-216	ENST00000639850	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		30.94	■■■□□ 2.54
ME2-216	ENST00000639850	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	30.94	■■■□□ 2.54
ME2-216	ENST00000639850	FMN1	Q68DA7	1419 aa		30.93	■■■□□ 2.54
ME2-216	ENST00000639850	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		30.93	■■■□□ 2.54
ME2-216	ENST00000639850	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		30.93	■■■□□ 2.54
ME2-216	ENST00000639850	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	30.92	■■■□□ 2.54
ME2-216	ENST00000639850	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	30.88	■■■□□ 2.53
ME2-216	ENST00000639850	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		30.84	■■■□□ 2.53
ME2-216	ENST00000639850	IQGAP2	Q13576	1575 aa		30.83	■■■□□ 2.53
ME2-216	ENST00000639850	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.81	■■■□□ 2.52
ME2-216	ENST00000639850	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		30.7	■■■□□ 2.51
ME2-216	ENST00000639850	GRIN2A	Q12879	1464 aa		30.68	■■■□□ 2.5
ME2-216	ENST00000639850	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	30.68	■■■□□ 2.5
ME2-216	ENST00000639850	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		30.68	■■■□□ 2.5
ME2-216	ENST00000639850	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		30.65	■■■□□ 2.5
ME2-216	ENST00000639850	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		30.65	■■■□□ 2.5
ME2-216	ENST00000639850	ITGAE	P38570	1179 aa		30.61	■■■□□ 2.49
ME2-216	ENST00000639850	SYNJ2	O15056	1496 aa		30.59	■■■□□ 2.49
ME2-216	ENST00000639850	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		30.59	■■■□□ 2.49
ME2-216	ENST00000639850	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	30.57	■■■□□ 2.48
ME2-216	ENST00000639850	HECW1	Q76N89	1606 aa		30.54	■■■□□ 2.48
ME2-216	ENST00000639850	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	30.53	■■■□□ 2.48
ME2-216	ENST00000639850	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		30.52	■■■□□ 2.48
ME2-216	ENST00000639850	KIAA0556	O60303	1618 aa		30.5	■■■□□ 2.47
ME2-216	ENST00000639850	FBLN2	P98095	1184 aa		30.49	■■■□□ 2.47
ME2-216	ENST00000639850	CEP170	Q5SW79	1584 aa		30.48	■■■□□ 2.47
ME2-216	ENST00000639850	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	30.48	■■■□□ 2.47
ME2-216	ENST00000639850	DISP1	Q96F81	1524 aa		30.48	■■■□□ 2.47
ME2-216	ENST00000639850	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		30.47	■■■□□ 2.47
ME2-216	ENST00000639850	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	30.46	■■■□□ 2.47
ME2-216	ENST00000639850	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		30.44	■■■□□ 2.46
ME2-216	ENST00000639850	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	30.44	■■■□□ 2.46
ME2-216	ENST00000639850	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	30.43	■■■□□ 2.46
ME2-216	ENST00000639850	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		30.42	■■■□□ 2.46
ME2-216	ENST00000639850	NCOA2	Q15596	1464 aa		30.42	■■■□□ 2.46
ME2-216	ENST00000639850	NUP160	Q12769	1436 aa		30.39	■■■□□ 2.45
ME2-216	ENST00000639850	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		30.38	■■■□□ 2.45
ME2-216	ENST00000639850	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		30.37	■■■□□ 2.45
ME2-216	ENST00000639850	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		30.36	■■■□□ 2.45
ME2-216	ENST00000639850	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	30.34	■■■□□ 2.45
ME2-216	ENST00000639850	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		30.34	■■■□□ 2.45
ME2-216	ENST00000639850	ARHGEF11	O15085	1522 aa		30.31	■■■□□ 2.44
ME2-216	ENST00000639850	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		30.3	■■■□□ 2.44
ME2-216	ENST00000639850	JPH4	Q96JJ6	628 aa		30.28	■■■□□ 2.44
ME2-216	ENST00000639850	ARID3C	A6NKF2	412 aa		30.27	■■■□□ 2.44
ME2-216	ENST00000639850	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		30.26	■■■□□ 2.43
ME2-216	ENST00000639850	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	30.24	■■■□□ 2.43
ME2-216	ENST00000639850	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		30.22	■■■□□ 2.43
ME2-216	ENST00000639850	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	30.17	■■■□□ 2.42
ME2-216	ENST00000639850	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		30.13	■■■□□ 2.41
ME2-216	ENST00000639850	CHD1	O14646	1710 aa		30.13	■■■□□ 2.41
ME2-216	ENST00000639850	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	30.12	■■■□□ 2.41
ME2-216	ENST00000639850	PTPRK	Q15262	1439 aa		30.12	■■■□□ 2.41
ME2-216	ENST00000639850	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	30.11	■■■□□ 2.41
ME2-216	ENST00000639850	MAPKBP1	O60336	1514 aa		30.1	■■■□□ 2.41
ME2-216	ENST00000639850	MIA2	Q96PC5	1412 aa		30.09	■■■□□ 2.41
ME2-216	ENST00000639850	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	30.08	■■■□□ 2.41
ME2-216	ENST00000639850	HFM1	A2PYH4	1435 aa		30.06	■■■□□ 2.4
ME2-216	ENST00000639850	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	30.01	■■■□□ 2.39
ME2-216	ENST00000639850	ABCA8	O94911	1581 aa		30	■■■□□ 2.39
ME2-216	ENST00000639850	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	29.99	■■■□□ 2.39
ME2-216	ENST00000639850	NAIP	Q13075	1403 aa		29.98	■■■□□ 2.39
ME2-216	ENST00000639850	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		29.91	■■■□□ 2.38
ME2-216	ENST00000639850	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		29.9	■■■□□ 2.38
ME2-216	ENST00000639850	PTPRG	P23470	1445 aa		29.9	■■■□□ 2.38
ME2-216	ENST00000639850	SHROOM2	Q13796	1616 aa		29.89	■■■□□ 2.38
ME2-216	ENST00000639850	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		29.88	■■■□□ 2.37
ME2-216	ENST00000639850	UACA	Q9BZF9	1416 aa		29.88	■■■□□ 2.37
ME2-216	ENST00000639850	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		29.87	■■■□□ 2.37
ME2-216	ENST00000639850	KIF14	Q15058	1648 aa		29.87	■■■□□ 2.37
ME2-216	ENST00000639850	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		29.87	■■■□□ 2.37
ME2-216	ENST00000639850	AKNA	Q7Z591	1439 aa		29.86	■■■□□ 2.37
ME2-216	ENST00000639850	ATP10B	O94823	1461 aa		29.86	■■■□□ 2.37
ME2-216	ENST00000639850	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		29.84	■■■□□ 2.37
ME2-216	ENST00000639850	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		29.84	■■■□□ 2.37
ME2-216	ENST00000639850	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	29.83	■■■□□ 2.37
ME2-216	ENST00000639850	DAPK1	P53355	1430 aa		29.81	■■■□□ 2.36
ME2-216	ENST00000639850	NEUROD1	Q13562	356 aa		29.81	■■■□□ 2.36
ME2-216	ENST00000639850	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
ME2-216	ENST00000639850	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
ME2-216	ENST00000639850	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	29.79	■■■□□ 2.36
ME2-216	ENST00000639850	ABCC5	O15440	1437 aa		29.76	■■■□□ 2.36
ME2-216	ENST00000639850	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		29.75	■■■□□ 2.35

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