RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637223.1

CLN6-218, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 652 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-218ENST00000637223 EEA1Q15075 1411 aa28.66■■■□□ 2.18
CLN6-218ENST00000637223 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.63■■■□□ 2.17
CLN6-218ENST00000637223 NUP160Q12769 1436 aa28.61■■■□□ 2.17
CLN6-218ENST00000637223 CEP170Q5SW79 1584 aa28.6■■■□□ 2.17
CLN6-218ENST00000637223 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.59■■■□□ 2.17
CLN6-218ENST00000637223 PRXQ9BXM0 1461 aa28.56■■■□□ 2.16
CLN6-218ENST00000637223 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.41■■■□□ 2.14
CLN6-218ENST00000637223 JPH4Q96JJ6 628 aa28.36■■■□□ 2.13
CLN6-218ENST00000637223 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.34■■■□□ 2.13
CLN6-218ENST00000637223 KIF21BO75037 1637 aa28.33■■■□□ 2.13
CLN6-218ENST00000637223 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.33■■■□□ 2.12
CLN6-218ENST00000637223 SHROOM2Q13796 1616 aa28.32■■■□□ 2.12
CLN6-218ENST00000637223 IQGAP2Q13576 1575 aa28.28■■■□□ 2.12
CLN6-218ENST00000637223 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CLN6-218ENST00000637223 GOLGA3Q08378 1498 aa28.23■■■□□ 2.11
CLN6-218ENST00000637223 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.22■■■□□ 2.11
CLN6-218ENST00000637223 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
CLN6-218ENST00000637223 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.15■■■□□ 2.1
CLN6-218ENST00000637223 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.11■■■□□ 2.09
CLN6-218ENST00000637223 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.1■■■□□ 2.09
CLN6-218ENST00000637223 DISP1Q96F81 1524 aa28.09■■■□□ 2.09
CLN6-218ENST00000637223 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CLN6-218ENST00000637223 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CLN6-218ENST00000637223 KIAA0556O60303 1618 aa28.03■■■□□ 2.08
CLN6-218ENST00000637223 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.01■■■□□ 2.07
CLN6-218ENST00000637223 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.01■■■□□ 2.07
CLN6-218ENST00000637223 P3H3Q8IVL6 736 aa27.98■■■□□ 2.07
CLN6-218ENST00000637223 PTPRGP23470 1445 aa27.98■■■□□ 2.07
CLN6-218ENST00000637223 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.94■■■□□ 2.06
CLN6-218ENST00000637223 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.06
CLN6-218ENST00000637223 SAMD9Q5K651 1589 aa27.92■■■□□ 2.06
CLN6-218ENST00000637223 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.91■■■□□ 2.06
CLN6-218ENST00000637223 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.9■■■□□ 2.06
CLN6-218ENST00000637223 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.86■■■□□ 2.05
CLN6-218ENST00000637223 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.85■■■□□ 2.05
CLN6-218ENST00000637223 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CLN6-218ENST00000637223 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.81■■■□□ 2.04
CLN6-218ENST00000637223 UACAQ9BZF9 1416 aa27.79■■■□□ 2.04
CLN6-218ENST00000637223 MAPKBP1O60336 1514 aa27.78■■■□□ 2.04
CLN6-218ENST00000637223 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.78■■■□□ 2.04
CLN6-218ENST00000637223 DIP2BQ9P265 1576 aa27.77■■■□□ 2.04
CLN6-218ENST00000637223 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.76■■■□□ 2.04
CLN6-218ENST00000637223 KDM6BO15054 1643 aa27.76■■■□□ 2.03
CLN6-218ENST00000637223 CLIP1P30622 1438 aa27.75■■■□□ 2.03
CLN6-218ENST00000637223 ABCC2Q92887 1545 aa27.72■■■□□ 2.03
CLN6-218ENST00000637223 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.71■■■□□ 2.03
CLN6-218ENST00000637223 CEP162Q5TB80 1403 aa27.7■■■□□ 2.03
CLN6-218ENST00000637223 ABCA8O94911 1581 aa27.69■■■□□ 2.02
CLN6-218ENST00000637223 TSPOAP1O95153 1857 aa27.68■■■□□ 2.02
CLN6-218ENST00000637223 FMN1Q68DA7 1419 aa27.61■■■□□ 2.01
CLN6-218ENST00000637223 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.6■■■□□ 2.01
CLN6-218ENST00000637223 ARID3CA6NKF2 412 aa27.6■■■□□ 2.01
CLN6-218ENST00000637223 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.58■■■□□ 2.01
CLN6-218ENST00000637223 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CLN6-218ENST00000637223 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CLN6-218ENST00000637223 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CLN6-218ENST00000637223 ATP10BO94823 1461 aa27.5■■□□□ 1.99
CLN6-218ENST00000637223 ASXL2Q76L83 1435 aa27.49■■□□□ 1.99
CLN6-218ENST00000637223 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
CLN6-218ENST00000637223 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
CLN6-218ENST00000637223 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CLN6-218ENST00000637223 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.44■■□□□ 1.98
CLN6-218ENST00000637223 HECW1Q76N89 1606 aa27.44■■□□□ 1.98
CLN6-218ENST00000637223 ADGRL1O94910 1474 aa27.44■■□□□ 1.98
CLN6-218ENST00000637223 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
CLN6-218ENST00000637223 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CLN6-218ENST00000637223 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.38■■□□□ 1.97
CLN6-218ENST00000637223 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.38■■□□□ 1.97
CLN6-218ENST00000637223 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CLN6-218ENST00000637223 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.33■■□□□ 1.96
CLN6-218ENST00000637223 KCNH8Q96L42 1107 aa27.32■■□□□ 1.96
CLN6-218ENST00000637223 GLI2P10070 1586 aa27.31■■□□□ 1.96
CLN6-218ENST00000637223 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.3■■□□□ 1.96
CLN6-218ENST00000637223 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CLN6-218ENST00000637223 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.29■■□□□ 1.96
CLN6-218ENST00000637223 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.28■■□□□ 1.96
CLN6-218ENST00000637223 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.27■■□□□ 1.96
CLN6-218ENST00000637223 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CLN6-218ENST00000637223 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CLN6-218ENST00000637223 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.15■■□□□ 1.94
CLN6-218ENST00000637223 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.14■■□□□ 1.94
CLN6-218ENST00000637223 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.13■■□□□ 1.93
CLN6-218ENST00000637223 CD109Q6YHK3 1445 aa27.11■■□□□ 1.93
CLN6-218ENST00000637223 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.08■■□□□ 1.93
CLN6-218ENST00000637223 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.08■■□□□ 1.93
CLN6-218ENST00000637223 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.922e-6■■■■□ 19.9
CLN6-218ENST00000637223 TIAM1Q13009 1591 aa27.06■■□□□ 1.92
CLN6-218ENST00000637223 KIF14Q15058 1648 aa27.06■■□□□ 1.92
CLN6-218ENST00000637223 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.06■■□□□ 1.92
CLN6-218ENST00000637223 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.04■■□□□ 1.92
CLN6-218ENST00000637223 APLP2Q06481 763 aa27.03■■□□□ 1.92
CLN6-218ENST00000637223 FBXO41Q8TF61 875 aa27.01■■□□□ 1.91
CLN6-218ENST00000637223 MAP3K1Q13233 1512 aa27■■□□□ 1.91
CLN6-218ENST00000637223 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27■■□□□ 1.91
CLN6-218ENST00000637223 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CLN6-218ENST00000637223 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.97■■□□□ 1.91
CLN6-218ENST00000637223 PLCH2O75038 1416 aa26.91■■□□□ 1.9
CLN6-218ENST00000637223 FANCAO15360 1455 aa26.87■■□□□ 1.89
CLN6-218ENST00000637223 NCOA2Q15596 1464 aa26.87■■□□□ 1.89
CLN6-218ENST00000637223 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 263.4 ms