RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS1-225ENST00000630659 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.16■■□□□ 1.3
BBS1-225ENST00000630659 PBRM1Q86U86 1689 aa23.13■■□□□ 1.29
BBS1-225ENST00000630659 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.293e-6■■■■□ 24.7
BBS1-225ENST00000630659 NEUROD1Q13562 356 aa23.1■■□□□ 1.29
BBS1-225ENST00000630659 APLP2Q06481 763 aa23.09■■□□□ 1.29
BBS1-225ENST00000630659 GRIN2BQ13224 1484 aa23.08■■□□□ 1.29
BBS1-225ENST00000630659 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.08■■□□□ 1.29
BBS1-225ENST00000630659 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
BBS1-225ENST00000630659 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
BBS1-225ENST00000630659 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.05■■□□□ 1.28
BBS1-225ENST00000630659 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.04■■□□□ 1.28
BBS1-225ENST00000630659 ADAMTS12P58397 1594 aa23.02■■□□□ 1.28
BBS1-225ENST00000630659 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.99■■□□□ 1.27
BBS1-225ENST00000630659 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
BBS1-225ENST00000630659 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.91■■□□□ 1.26
BBS1-225ENST00000630659 P3H3Q8IVL6 736 aa22.9■■□□□ 1.26
BBS1-225ENST00000630659 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.88■■□□□ 1.25
BBS1-225ENST00000630659 SAMD9Q5K651 1589 aa22.86■■□□□ 1.25
BBS1-225ENST00000630659 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
BBS1-225ENST00000630659 MAP3K1Q13233 1512 aa22.83■■□□□ 1.25
BBS1-225ENST00000630659 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
BBS1-225ENST00000630659 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
BBS1-225ENST00000630659 IQGAP2Q13576 1575 aa22.81■■□□□ 1.24
BBS1-225ENST00000630659 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
BBS1-225ENST00000630659 GRIN2AQ12879 1464 aa22.8■■□□□ 1.24
BBS1-225ENST00000630659 FMN1Q68DA7 1419 aa22.8■■□□□ 1.24
BBS1-225ENST00000630659 TIAM1Q13009 1591 aa22.78■■□□□ 1.24
BBS1-225ENST00000630659 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.77■■□□□ 1.24
BBS1-225ENST00000630659 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.77■■□□□ 1.24
BBS1-225ENST00000630659 SYNJ2O15056 1496 aa22.76■■□□□ 1.23
BBS1-225ENST00000630659 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.74■■□□□ 1.23
BBS1-225ENST00000630659 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
BBS1-225ENST00000630659 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.71■■□□□ 1.23
BBS1-225ENST00000630659 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.71■■□□□ 1.23
BBS1-225ENST00000630659 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
BBS1-225ENST00000630659 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.68■■□□□ 1.22
BBS1-225ENST00000630659 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
BBS1-225ENST00000630659 FBLN2P98095 1184 aa22.65■■□□□ 1.22
BBS1-225ENST00000630659 CEP170Q5SW79 1584 aa22.64■■□□□ 1.22
BBS1-225ENST00000630659 NUP160Q12769 1436 aa22.62■■□□□ 1.21
BBS1-225ENST00000630659 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
BBS1-225ENST00000630659 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
BBS1-225ENST00000630659 DISP1Q96F81 1524 aa22.58■■□□□ 1.21
BBS1-225ENST00000630659 KIAA0556O60303 1618 aa22.58■■□□□ 1.21
BBS1-225ENST00000630659 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
BBS1-225ENST00000630659 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.57■■□□□ 1.2
BBS1-225ENST00000630659 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.54■■□□□ 1.2
BBS1-225ENST00000630659 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.54■■□□□ 1.2
BBS1-225ENST00000630659 HECW1Q76N89 1606 aa22.52■■□□□ 1.2
BBS1-225ENST00000630659 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.51■■□□□ 1.19
BBS1-225ENST00000630659 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.5■■□□□ 1.19
BBS1-225ENST00000630659 JPH4Q96JJ6 628 aa22.49■■□□□ 1.19
BBS1-225ENST00000630659 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.48■■□□□ 1.19
BBS1-225ENST00000630659 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.46■■□□□ 1.19
BBS1-225ENST00000630659 CHD1O14646 1710 aa22.45■■□□□ 1.18
BBS1-225ENST00000630659 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
BBS1-225ENST00000630659 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
BBS1-225ENST00000630659 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.43■■□□□ 1.18
BBS1-225ENST00000630659 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.39■■□□□ 1.18
BBS1-225ENST00000630659 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
BBS1-225ENST00000630659 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
BBS1-225ENST00000630659 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.37■■□□□ 1.17
BBS1-225ENST00000630659 NCOA2Q15596 1464 aa22.36■■□□□ 1.17
BBS1-225ENST00000630659 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
BBS1-225ENST00000630659 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
BBS1-225ENST00000630659 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
BBS1-225ENST00000630659 ITGAEP38570 1179 aa22.32■■□□□ 1.16
BBS1-225ENST00000630659 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.32■■□□□ 1.16
BBS1-225ENST00000630659 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
BBS1-225ENST00000630659 ARHGEF11O15085 1522 aa22.31■■□□□ 1.16
BBS1-225ENST00000630659 ARID3CA6NKF2 412 aa22.29■■□□□ 1.16
BBS1-225ENST00000630659 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.29■■□□□ 1.16
BBS1-225ENST00000630659 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.29■■□□□ 1.16
BBS1-225ENST00000630659 SHROOM2Q13796 1616 aa22.27■■□□□ 1.16
BBS1-225ENST00000630659 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
BBS1-225ENST00000630659 ABCA8O94911 1581 aa22.24■■□□□ 1.15
BBS1-225ENST00000630659 PTPRGP23470 1445 aa22.21■■□□□ 1.15
BBS1-225ENST00000630659 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.21■■□□□ 1.15
BBS1-225ENST00000630659 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.19■■□□□ 1.14
BBS1-225ENST00000630659 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.17■■□□□ 1.14
BBS1-225ENST00000630659 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.17■■□□□ 1.14
BBS1-225ENST00000630659 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
BBS1-225ENST00000630659 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
BBS1-225ENST00000630659 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
BBS1-225ENST00000630659 BCL11AQ9H165 835 aa22.16■■□□□ 1.14
BBS1-225ENST00000630659 MIA2Q96PC5 1412 aa22.15■■□□□ 1.14
BBS1-225ENST00000630659 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.15■■□□□ 1.14
BBS1-225ENST00000630659 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
BBS1-225ENST00000630659 ATP10BO94823 1461 aa22.12■■□□□ 1.13
BBS1-225ENST00000630659 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.1■■□□□ 1.13
BBS1-225ENST00000630659 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.09■■□□□ 1.13
BBS1-225ENST00000630659 MIER1Q8N108 512 aa22.08■■□□□ 1.13
BBS1-225ENST00000630659 UACAQ9BZF9 1416 aa22.08■■□□□ 1.13
BBS1-225ENST00000630659 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.08■■□□□ 1.12
BBS1-225ENST00000630659 PTPRKQ15262 1439 aa22.08■■□□□ 1.12
BBS1-225ENST00000630659 KIF14Q15058 1648 aa22.03■■□□□ 1.12
BBS1-225ENST00000630659 HFM1A2PYH4 1435 aa22.01■■□□□ 1.11
BBS1-225ENST00000630659 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22■■□□□ 1.11
BBS1-225ENST00000630659 ABCC2Q92887 1545 aa22■■□□□ 1.11
BBS1-225ENST00000630659 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
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