RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628308.2

PCBP1-AS1-326, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 996 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 PRXQ9BXM0 1461 aa15.11■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 FBLN2P98095 1184 aa15.1■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.09■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 PBRM1Q86U86 1689 aa15.09■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.09■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.08■□□□□ 0.01
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CUL7Q14999 1698 aa15.06■□□□□ 0
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 KIF21BO75037 1637 aa15.04■□□□□ -0
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 SYNJ2O15056 1496 aa15.02■□□□□ -0
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 ADAMTS12P58397 1594 aa15.02□□□□□ -0.01
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CEP162Q5TB80 1403 aa15□□□□□ -0.01
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 GRIN2AQ12879 1464 aa14.97□□□□□ -0.01
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.95□□□□□ -0.02
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 KCNA4P22459 653 aa14.93□□□□□ -0.02
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CLIP1P30622 1438 aa14.92□□□□□ -0.02
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 APLP2Q06481 763 aa14.89□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 OSCARQ8IYS5 282 aa14.89□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 NUP160Q12769 1436 aa14.88□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.87□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CHD1O14646 1710 aa14.86□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 JPH4Q96JJ6 628 aa14.85□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CEP170Q5SW79 1584 aa14.85□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 P3H3Q8IVL6 736 aa14.81□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 IQGAP2Q13576 1575 aa14.81□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.81□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.77□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.77□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.74□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.74□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.74□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.73□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.71□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.69□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 DISP1Q96F81 1524 aa14.68□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 ARAP1Q96P48 1450 aa14.68□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 SAMD9Q5K651 1589 aa14.66□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 SHROOM2Q13796 1616 aa14.65□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 KIAA0556O60303 1618 aa14.64□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 PTPRGP23470 1445 aa14.63□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 FMN1Q68DA7 1419 aa14.63□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.6□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.58□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 HRCP23327 699 aa14.57□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.55□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 ARHGEF11O15085 1522 aa14.53□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 ARID3CA6NKF2 412 aa14.53□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.52□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.52□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 UACAQ9BZF9 1416 aa14.51□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 MAP3K1Q13233 1512 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.47□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 ABCA8O94911 1581 aa14.47□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.46□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.45□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 HECW1Q76N89 1606 aa14.44□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.43□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.43□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 ABCC2Q92887 1545 aa14.42□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.42□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 ATP10BO94823 1461 aa14.42□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 TIAM1Q13009 1591 aa14.4□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.39□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.38□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.36□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.36□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 KCNH8Q96L42 1107 aa14.34□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.34□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.34□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.32□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.29□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-326ENST00000628308 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms