RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616271.4

CADM1-222, Transcript of cell adhesion molecule 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CADM1, Length 1,246 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1-222ENST00000616271 PRXQ9BXM0 1461 aa30.81■■■□□ 2.52
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CADM1-222ENST00000616271 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.74■■■□□ 2.51
CADM1-222ENST00000616271 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.73■■■□□ 2.51
CADM1-222ENST00000616271 IQGAP2Q13576 1575 aa30.71■■■□□ 2.51
CADM1-222ENST00000616271 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.7■■■□□ 2.5
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CADM1-222ENST00000616271 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.24■■■□□ 2.43
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CADM1-222ENST00000616271 UACAQ9BZF9 1416 aa30.11■■■□□ 2.41
CADM1-222ENST00000616271 ABCA8O94911 1581 aa30.06■■■□□ 2.4
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CADM1-222ENST00000616271 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.92■■■□□ 2.38
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CADM1-222ENST00000616271 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.82■■■□□ 2.36
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CADM1-222ENST00000616271 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
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CADM1-222ENST00000616271 ATP10BO94823 1461 aa29.74■■■□□ 2.35
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CADM1-222ENST00000616271 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.69■■■□□ 2.34
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CADM1-222ENST00000616271 TSPOAP1O95153 1857 aa29.61■■■□□ 2.33
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CADM1-222ENST00000616271 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.56■■■□□ 2.32
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CADM1-222ENST00000616271 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.44■■■□□ 2.3
CADM1-222ENST00000616271 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.39■■■□□ 2.3
CADM1-222ENST00000616271 CD109Q6YHK3 1445 aa29.38■■■□□ 2.29
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CADM1-222ENST00000616271 PLCH2O75038 1416 aa29.12■■■□□ 2.25
CADM1-222ENST00000616271 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.12■■■□□ 2.25
CADM1-222ENST00000616271 FANCAO15360 1455 aa29.11■■■□□ 2.25
CADM1-222ENST00000616271 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CADM1-222ENST00000616271 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CADM1-222ENST00000616271 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.04■■■□□ 2.24
CADM1-222ENST00000616271 AKNAQ7Z591 1439 aa29.03■■■□□ 2.24
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