RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606828.2

MED16-211, Transcript of mediator complex subunit 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MED16, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16-211ENST00000606828 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.2■■□□□ 1.3
MED16-211ENST00000606828 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.19■■□□□ 1.3
MED16-211ENST00000606828 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
MED16-211ENST00000606828 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.11■■□□□ 1.29
MED16-211ENST00000606828 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
MED16-211ENST00000606828 IQGAP2Q13576 1575 aa23■■□□□ 1.27
MED16-211ENST00000606828 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.98■■□□□ 1.27
MED16-211ENST00000606828 PRXQ9BXM0 1461 aa22.98■■□□□ 1.27
MED16-211ENST00000606828 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.95■■□□□ 1.26
MED16-211ENST00000606828 EEA1Q15075 1411 aa22.92■■□□□ 1.26
MED16-211ENST00000606828 PTPRGP23470 1445 aa22.91■■□□□ 1.26
MED16-211ENST00000606828 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.9■■□□□ 1.26
MED16-211ENST00000606828 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.9■■□□□ 1.26
MED16-211ENST00000606828 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
MED16-211ENST00000606828 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.87■■□□□ 1.25
MED16-211ENST00000606828 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
MED16-211ENST00000606828 DISP1Q96F81 1524 aa22.86■■□□□ 1.25
MED16-211ENST00000606828 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
MED16-211ENST00000606828 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.81■■□□□ 1.24
MED16-211ENST00000606828 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.8■■□□□ 1.24
MED16-211ENST00000606828 KIAA0556O60303 1618 aa22.77■■□□□ 1.24
MED16-211ENST00000606828 GOLGA3Q08378 1498 aa22.77■■□□□ 1.24
MED16-211ENST00000606828 MAPKBP1O60336 1514 aa22.74■■□□□ 1.23
MED16-211ENST00000606828 UACAQ9BZF9 1416 aa22.74■■□□□ 1.23
MED16-211ENST00000606828 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.72■■□□□ 1.23
MED16-211ENST00000606828 ABCC2Q92887 1545 aa22.71■■□□□ 1.23
MED16-211ENST00000606828 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.67■■□□□ 1.22
MED16-211ENST00000606828 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.67■■□□□ 1.22
MED16-211ENST00000606828 KIF21BO75037 1637 aa22.64■■□□□ 1.22
MED16-211ENST00000606828 P3H3Q8IVL6 736 aa22.61■■□□□ 1.21
MED16-211ENST00000606828 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.6■■□□□ 1.21
MED16-211ENST00000606828 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.6■■□□□ 1.21
MED16-211ENST00000606828 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.59■■□□□ 1.21
MED16-211ENST00000606828 DIP2BQ9P265 1576 aa22.59■■□□□ 1.21
MED16-211ENST00000606828 ASXL2Q76L83 1435 aa22.58■■□□□ 1.21
MED16-211ENST00000606828 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
MED16-211ENST00000606828 SAMD9Q5K651 1589 aa22.55■■□□□ 1.2
MED16-211ENST00000606828 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
MED16-211ENST00000606828 ABCA8O94911 1581 aa22.54■■□□□ 1.2
MED16-211ENST00000606828 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.53■■□□□ 1.2
MED16-211ENST00000606828 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
MED16-211ENST00000606828 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.46■■□□□ 1.19
MED16-211ENST00000606828 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.45■■□□□ 1.18
MED16-211ENST00000606828 GLI2P10070 1586 aa22.45■■□□□ 1.18
MED16-211ENST00000606828 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
MED16-211ENST00000606828 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.44■■□□□ 1.18
MED16-211ENST00000606828 ARID3CA6NKF2 412 aa22.41■■□□□ 1.18
MED16-211ENST00000606828 ATP10BO94823 1461 aa22.38■■□□□ 1.17
MED16-211ENST00000606828 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.37■■□□□ 1.17
MED16-211ENST00000606828 KCNH8Q96L42 1107 aa22.36■■□□□ 1.17
MED16-211ENST00000606828 TSPOAP1O95153 1857 aa22.34■■□□□ 1.17
MED16-211ENST00000606828 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
MED16-211ENST00000606828 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
MED16-211ENST00000606828 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
MED16-211ENST00000606828 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.31■■□□□ 1.16
MED16-211ENST00000606828 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.3■■□□□ 1.16
MED16-211ENST00000606828 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.29■■□□□ 1.16
MED16-211ENST00000606828 FMN1Q68DA7 1419 aa22.29■■□□□ 1.16
MED16-211ENST00000606828 KDM6BO15054 1643 aa22.28■■□□□ 1.16
MED16-211ENST00000606828 CD109Q6YHK3 1445 aa22.27■■□□□ 1.16
MED16-211ENST00000606828 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
MED16-211ENST00000606828 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.23■■□□□ 1.15
MED16-211ENST00000606828 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.21■■□□□ 1.15
MED16-211ENST00000606828 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.21■■□□□ 1.15
MED16-211ENST00000606828 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
MED16-211ENST00000606828 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
MED16-211ENST00000606828 CLIP1P30622 1438 aa22.14■■□□□ 1.14
MED16-211ENST00000606828 HECW1Q76N89 1606 aa22.14■■□□□ 1.14
MED16-211ENST00000606828 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.14■■□□□ 1.14
MED16-211ENST00000606828 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
MED16-211ENST00000606828 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MED16-211ENST00000606828 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.08■■□□□ 1.12
MED16-211ENST00000606828 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.07■■□□□ 1.12
MED16-211ENST00000606828 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
MED16-211ENST00000606828 NEO1Q92859 1461 aa22.03■■□□□ 1.12
MED16-211ENST00000606828 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.03■■□□□ 1.12
MED16-211ENST00000606828 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.125e-6■□□□□ 9.5
MED16-211ENST00000606828 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.01■■□□□ 1.11
MED16-211ENST00000606828 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
MED16-211ENST00000606828 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22■■□□□ 1.11
MED16-211ENST00000606828 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
MED16-211ENST00000606828 CEP162Q5TB80 1403 aa21.98■■□□□ 1.11
MED16-211ENST00000606828 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.97■■□□□ 1.11
MED16-211ENST00000606828 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.96■■□□□ 1.11
MED16-211ENST00000606828 FANCAO15360 1455 aa21.96■■□□□ 1.11
MED16-211ENST00000606828 PLCH2O75038 1416 aa21.93■■□□□ 1.1
MED16-211ENST00000606828 RAPGEF3O95398 923 aa21.93■■□□□ 1.1
MED16-211ENST00000606828 AKNAQ7Z591 1439 aa21.93■■□□□ 1.1
MED16-211ENST00000606828 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.92■■□□□ 1.1
MED16-211ENST00000606828 KIF14Q15058 1648 aa21.92■■□□□ 1.1
MED16-211ENST00000606828 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.9■■□□□ 1.1
MED16-211ENST00000606828 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.9■■□□□ 1.1
MED16-211ENST00000606828 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.88■■□□□ 1.09
MED16-211ENST00000606828 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
MED16-211ENST00000606828 ADGRL1O94910 1474 aa21.83■■□□□ 1.09
MED16-211ENST00000606828 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.82■■□□□ 1.08
MED16-211ENST00000606828 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.82■■□□□ 1.08
MED16-211ENST00000606828 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.81■■□□□ 1.08
MED16-211ENST00000606828 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.8■■□□□ 1.08
MED16-211ENST00000606828 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms