RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601816.3

PNKP-216, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 3

Gene PNKP, Length 682 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-216ENST00000601816 JPH4Q96JJ6 628 aa44.78■■■■■ 4.76
PNKP-216ENST00000601816 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
PNKP-216ENST00000601816 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.7■■■■■ 4.75
PNKP-216ENST00000601816 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.66■■■■■ 4.74
PNKP-216ENST00000601816 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.38■■■■■ 4.69
PNKP-216ENST00000601816 IQGAP2Q13576 1575 aa44.31■■■■■ 4.68
PNKP-216ENST00000601816 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.23■■■■■ 4.67
PNKP-216ENST00000601816 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.16■■■■■ 4.66
PNKP-216ENST00000601816 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.15■■■■■ 4.66
PNKP-216ENST00000601816 PTPRGP23470 1445 aa44.15■■■■■ 4.66
PNKP-216ENST00000601816 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.12■■■■■ 4.65
PNKP-216ENST00000601816 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP44.06■■■■■ 4.64
PNKP-216ENST00000601816 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.05■■■■■ 4.64
PNKP-216ENST00000601816 PRXQ9BXM0 1461 aa44.05■■■■■ 4.64
PNKP-216ENST00000601816 DISP1Q96F81 1524 aa44.04■■■■■ 4.64
PNKP-216ENST00000601816 MAPKBP1O60336 1514 aa44.02■■■■■ 4.64
PNKP-216ENST00000601816 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.97■■■■■ 4.63
PNKP-216ENST00000601816 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.95■■■■■ 4.63
PNKP-216ENST00000601816 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.9■■■■■ 4.62
PNKP-216ENST00000601816 KIAA0556O60303 1618 aa43.9■■■■■ 4.62
PNKP-216ENST00000601816 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.85■■■■■ 4.61
PNKP-216ENST00000601816 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.84■■■■■ 4.61
PNKP-216ENST00000601816 ABCC2Q92887 1545 aa43.83■■■■■ 4.61
PNKP-216ENST00000601816 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.83■■■■■ 4.61
PNKP-216ENST00000601816 UACAQ9BZF9 1416 aa43.82■■■■■ 4.61
PNKP-216ENST00000601816 DIP2BQ9P265 1576 aa43.81■■■■■ 4.6
PNKP-216ENST00000601816 EEA1Q15075 1411 aa43.81■■■■■ 4.6
PNKP-216ENST00000601816 GOLGA3Q08378 1498 aa43.77■■■■■ 4.6
PNKP-216ENST00000601816 ASXL2Q76L83 1435 aa43.63■■■■■ 4.57
PNKP-216ENST00000601816 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.61■■■■■ 4.57
PNKP-216ENST00000601816 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.61■■■■■ 4.57
PNKP-216ENST00000601816 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.57■■■■■ 4.57
PNKP-216ENST00000601816 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
PNKP-216ENST00000601816 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.51■■■■■ 4.56
PNKP-216ENST00000601816 ABCA8O94911 1581 aa43.46■■■■■ 4.55
PNKP-216ENST00000601816 GLI2P10070 1586 aa43.44■■■■■ 4.54
PNKP-216ENST00000601816 TSPOAP1O95153 1857 aa43.44■■■■■ 4.54
PNKP-216ENST00000601816 P3H3Q8IVL6 736 aa43.4■■■■■ 4.54
PNKP-216ENST00000601816 KIF21BO75037 1637 aa43.39■■■■■ 4.54
PNKP-216ENST00000601816 SAMD9Q5K651 1589 aa43.38■■■■■ 4.54
PNKP-216ENST00000601816 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
PNKP-216ENST00000601816 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.31■■■■■ 4.52
PNKP-216ENST00000601816 KDM6BO15054 1643 aa43.3■■■■■ 4.52
PNKP-216ENST00000601816 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.24■■■■■ 4.51
PNKP-216ENST00000601816 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
PNKP-216ENST00000601816 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.21■■■■■ 4.51
PNKP-216ENST00000601816 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.12■■■■■ 4.49
PNKP-216ENST00000601816 ARID3CA6NKF2 412 aa43.11■■■■■ 4.49
PNKP-216ENST00000601816 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.11■■■■■ 4.49
PNKP-216ENST00000601816 ATP10BO94823 1461 aa43.1■■■■■ 4.49
PNKP-216ENST00000601816 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.09■■■■■ 4.49
PNKP-216ENST00000601816 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.09■■■■■ 4.49
PNKP-216ENST00000601816 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.07■■■■■ 4.49
PNKP-216ENST00000601816 KCNH8Q96L42 1107 aa43.07■■■■■ 4.49
PNKP-216ENST00000601816 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
PNKP-216ENST00000601816 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
PNKP-216ENST00000601816 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.98■■■■■ 4.47
PNKP-216ENST00000601816 CD109Q6YHK3 1445 aa42.97■■■■■ 4.47
PNKP-216ENST00000601816 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.47
PNKP-216ENST00000601816 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.92■■■■■ 4.46
PNKP-216ENST00000601816 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
PNKP-216ENST00000601816 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
PNKP-216ENST00000601816 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
PNKP-216ENST00000601816 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.76■■■■■ 4.44
PNKP-216ENST00000601816 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.75■■■■■ 4.43
PNKP-216ENST00000601816 FMN1Q68DA7 1419 aa42.7■■■■■ 4.43
PNKP-216ENST00000601816 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.68■■■■■ 4.42
PNKP-216ENST00000601816 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
PNKP-216ENST00000601816 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.58■■■■■ 4.41
PNKP-216ENST00000601816 HECW1Q76N89 1606 aa42.57■■■■■ 4.41
PNKP-216ENST00000601816 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.56■■■■■ 4.4
PNKP-216ENST00000601816 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.55■■■■■ 4.4
PNKP-216ENST00000601816 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
PNKP-216ENST00000601816 NEO1Q92859 1461 aa42.5■■■■■ 4.39
PNKP-216ENST00000601816 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.45■■■■■ 4.39
PNKP-216ENST00000601816 ADGRL1O94910 1474 aa42.43■■■■■ 4.38
PNKP-216ENST00000601816 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.39■■■■■ 4.38
PNKP-216ENST00000601816 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
PNKP-216ENST00000601816 FANCAO15360 1455 aa42.31■■■■■ 4.36
PNKP-216ENST00000601816 RAPGEF3O95398 923 aa42.31■■■■■ 4.36
PNKP-216ENST00000601816 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.31■■■■■ 4.36
PNKP-216ENST00000601816 CLIP1P30622 1438 aa42.3■■■■■ 4.36
PNKP-216ENST00000601816 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.29■■■■■ 4.36
PNKP-216ENST00000601816 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
PNKP-216ENST00000601816 AKNAQ7Z591 1439 aa42.27■■■■■ 4.36
PNKP-216ENST00000601816 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.25■■■■■ 4.35
PNKP-216ENST00000601816 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.24■■■■■ 4.35
PNKP-216ENST00000601816 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
PNKP-216ENST00000601816 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
PNKP-216ENST00000601816 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.2■■■■■ 4.35
PNKP-216ENST00000601816 KIF14Q15058 1648 aa42.2■■■■■ 4.35
PNKP-216ENST00000601816 PLCH2O75038 1416 aa42.2■■■■■ 4.35
PNKP-216ENST00000601816 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.16■■■■■ 4.34
PNKP-216ENST00000601816 RICTORQ6R327 1708 aa42.12■■■■■ 4.33
PNKP-216ENST00000601816 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.12■■■■■ 4.33
PNKP-216ENST00000601816 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.05■■■■■ 4.32
PNKP-216ENST00000601816 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.02■■■■■ 4.32
PNKP-216ENST00000601816 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.01■■■■■ 4.32
PNKP-216ENST00000601816 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42■■■■■ 4.31
PNKP-216ENST00000601816 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.98■■■■■ 4.31
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