RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598936.1

FCGRT-215, Transcript of Fc fragment of IgG receptor and transporter, human

TSL 3

Gene FCGRT, Length 870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCGRT-215	ENST00000598936	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.73	■■■□□ 2.35
FCGRT-215	ENST00000598936	DIP2B	Q9P265	1576 aa		29.73	■■■□□ 2.35
FCGRT-215	ENST00000598936	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.72	■■■□□ 2.35
FCGRT-215	ENST00000598936	MAPKBP1	O60336	1514 aa		29.71	■■■□□ 2.35
FCGRT-215	ENST00000598936	KDM6B	O15054	1643 aa		29.71	■■■□□ 2.35
FCGRT-215	ENST00000598936	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		29.69	■■■□□ 2.34
FCGRT-215	ENST00000598936	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.66	■■■□□ 2.34
FCGRT-215	ENST00000598936	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		29.63	■■■□□ 2.33
FCGRT-215	ENST00000598936	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	29.63	■■■□□ 2.33
FCGRT-215	ENST00000598936	TSPOAP1	O95153	1857 aa		29.63	■■■□□ 2.33
FCGRT-215	ENST00000598936	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.31
FCGRT-215	ENST00000598936	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.37	■■■□□ 2.29
FCGRT-215	ENST00000598936	ADGRL1	O94910	1474 aa		29.33	■■■□□ 2.29
FCGRT-215	ENST00000598936	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.29	■■■□□ 2.28
FCGRT-215	ENST00000598936	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
FCGRT-215	ENST00000598936	PTPRG	P23470	1445 aa		29.27	■■■□□ 2.28
FCGRT-215	ENST00000598936	CUL7	Q14999	1698 aa		29.22	■■■□□ 2.27
FCGRT-215	ENST00000598936	ABCC2	Q92887	1545 aa		29.22	■■■□□ 2.27
FCGRT-215	ENST00000598936	ASXL2	Q76L83	1435 aa		29.21	■■■□□ 2.27
FCGRT-215	ENST00000598936	GLI2	P10070	1586 aa		29.19	■■■□□ 2.26
FCGRT-215	ENST00000598936	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		29.19	■■■□□ 2.26
FCGRT-215	ENST00000598936	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		29.19	■■■□□ 2.26
FCGRT-215	ENST00000598936	IGF1R	P08069	1367 aa		29.16	■■■□□ 2.26
FCGRT-215	ENST00000598936	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		29.14	■■■□□ 2.26
FCGRT-215	ENST00000598936	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		29.13	■■■□□ 2.25
FCGRT-215	ENST00000598936	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.11	■■■□□ 2.25
FCGRT-215	ENST00000598936	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
FCGRT-215	ENST00000598936	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FCGRT-215	ENST00000598936	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FCGRT-215	ENST00000598936	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
FCGRT-215	ENST00000598936	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FCGRT-215	ENST00000598936	UACA	Q9BZF9	1416 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FCGRT-215	ENST00000598936	IQGAP2	Q13576	1575 aa		29.01	■■■□□ 2.24
FCGRT-215	ENST00000598936	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		28.99	■■■□□ 2.23
FCGRT-215	ENST00000598936	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.94	■■■□□ 2.22
FCGRT-215	ENST00000598936	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
FCGRT-215	ENST00000598936	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.9	■■■□□ 2.22
FCGRT-215	ENST00000598936	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FCGRT-215	ENST00000598936	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FCGRT-215	ENST00000598936	FBXO41	Q8TF61	875 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FCGRT-215	ENST00000598936	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FCGRT-215	ENST00000598936	KIF21B	O75037	1637 aa		28.73	■■■□□ 2.19
FCGRT-215	ENST00000598936	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.7	■■■□□ 2.19
FCGRT-215	ENST00000598936	CD109	Q6YHK3	1445 aa		28.7	■■■□□ 2.19
FCGRT-215	ENST00000598936	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.69	■■■□□ 2.18
FCGRT-215	ENST00000598936	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.64	■■■□□ 2.18
FCGRT-215	ENST00000598936	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		28.64	■■■□□ 2.17
FCGRT-215	ENST00000598936	ABCA8	O94911	1581 aa		28.53	■■■□□ 2.16
FCGRT-215	ENST00000598936	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		28.51	■■■□□ 2.16
FCGRT-215	ENST00000598936	PTPRM	P28827	1452 aa		28.51	■■■□□ 2.15
FCGRT-215	ENST00000598936	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		28.48	■■■□□ 2.15
FCGRT-215	ENST00000598936	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		28.48	■■■□□ 2.15
FCGRT-215	ENST00000598936	GOLGA3	Q08378	1498 aa		28.48	■■■□□ 2.15
FCGRT-215	ENST00000598936	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.4	■■■□□ 2.14
FCGRT-215	ENST00000598936	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.38	■■■□□ 2.13
FCGRT-215	ENST00000598936	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		28.36	■■■□□ 2.13
FCGRT-215	ENST00000598936	MADD	Q8WXG6	1647 aa		28.36	■■■□□ 2.13
FCGRT-215	ENST00000598936	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		28.34	■■■□□ 2.13
FCGRT-215	ENST00000598936	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
FCGRT-215	ENST00000598936	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		28.32	■■■□□ 2.12
FCGRT-215	ENST00000598936	RAPGEF3	O95398	923 aa		28.32	■■■□□ 2.12
FCGRT-215	ENST00000598936	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.32	■■■□□ 2.12
FCGRT-215	ENST00000598936	ATP10B	O94823	1461 aa		28.27	■■■□□ 2.12
FCGRT-215	ENST00000598936	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.11
FCGRT-215	ENST00000598936	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		28.25	■■■□□ 2.11
FCGRT-215	ENST00000598936	NEO1	Q92859	1461 aa		28.25	■■■□□ 2.11
FCGRT-215	ENST00000598936	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
FCGRT-215	ENST00000598936	HSPA2	P54652	639 aa		28.19	■■■□□ 2.1
FCGRT-215	ENST00000598936	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.19	■■■□□ 2.1
FCGRT-215	ENST00000598936	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		28.18	■■■□□ 2.1
FCGRT-215	ENST00000598936	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		28.16	■■■□□ 2.1
FCGRT-215	ENST00000598936	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
FCGRT-215	ENST00000598936	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
FCGRT-215	ENST00000598936	PRX	Q9BXM0	1461 aa		28.12	■■■□□ 2.09
FCGRT-215	ENST00000598936	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.1	■■■□□ 2.09
FCGRT-215	ENST00000598936	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.1	■■■□□ 2.09
FCGRT-215	ENST00000598936	RICTOR	Q6R327	1708 aa		28.07	■■■□□ 2.08
FCGRT-215	ENST00000598936	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
FCGRT-215	ENST00000598936	FANCA	O15360	1455 aa		28.04	■■■□□ 2.08
FCGRT-215	ENST00000598936	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		28.03	■■■□□ 2.08
FCGRT-215	ENST00000598936	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.01	■■■□□ 2.07
FCGRT-215	ENST00000598936	AKNA	Q7Z591	1439 aa		28.01	■■■□□ 2.07
FCGRT-215	ENST00000598936	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		27.99	■■■□□ 2.07
FCGRT-215	ENST00000598936	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		27.99	■■■□□ 2.07
FCGRT-215	ENST00000598936	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		27.98	■■■□□ 2.07
FCGRT-215	ENST00000598936	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		27.98	■■■□□ 2.07
FCGRT-215	ENST00000598936	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		27.97	■■■□□ 2.07
FCGRT-215	ENST00000598936	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		27.96	■■■□□ 2.07
FCGRT-215	ENST00000598936	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
FCGRT-215	ENST00000598936	ILDR2	Q71H61	639 aa		27.96	■■■□□ 2.07
FCGRT-215	ENST00000598936	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		27.95	■■■□□ 2.06
FCGRT-215	ENST00000598936	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		27.94	■■■□□ 2.06
FCGRT-215	ENST00000598936	MLEC	Q14165	292 aa		27.94	■■■□□ 2.06
FCGRT-215	ENST00000598936	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		27.93	■■■□□ 2.06
FCGRT-215	ENST00000598936	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		27.91	■■■□□ 2.06
FCGRT-215	ENST00000598936	SOCS7	O14512	581 aa		27.91	■■■□□ 2.06
FCGRT-215	ENST00000598936	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		27.88	■■■□□ 2.05
FCGRT-215	ENST00000598936	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	27.87	■■■□□ 2.05
FCGRT-215	ENST00000598936	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		27.85	■■■□□ 2.05
FCGRT-215	ENST00000598936	HECW1	Q76N89	1606 aa		27.85	■■■□□ 2.05

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