RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598020.3

PNKP-211, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 3

Gene PNKP, Length 534 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-211ENST00000598020 SHROOM2Q13796 1616 aa33.76■■■■□ 3
PNKP-211ENST00000598020 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.75■■■□□ 2.99
PNKP-211ENST00000598020 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.75■■■□□ 2.99
PNKP-211ENST00000598020 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.75■■■□□ 2.99
PNKP-211ENST00000598020 JPH4Q96JJ6 628 aa33.69■■■□□ 2.98
PNKP-211ENST00000598020 KIF21BO75037 1637 aa33.65■■■□□ 2.98
PNKP-211ENST00000598020 IQGAP2Q13576 1575 aa33.62■■■□□ 2.97
PNKP-211ENST00000598020 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
PNKP-211ENST00000598020 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.58■■■□□ 2.97
PNKP-211ENST00000598020 ARAP1Q96P48 1450 aa33.55■■■□□ 2.96
PNKP-211ENST00000598020 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.55■■■□□ 2.96
PNKP-211ENST00000598020 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.48■■■□□ 2.95
PNKP-211ENST00000598020 GOLGA3Q08378 1498 aa33.45■■■□□ 2.95
PNKP-211ENST00000598020 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.44■■■□□ 2.94
PNKP-211ENST00000598020 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.41■■■□□ 2.94
PNKP-211ENST00000598020 DISP1Q96F81 1524 aa33.38■■■□□ 2.93
PNKP-211ENST00000598020 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
PNKP-211ENST00000598020 KIAA0556O60303 1618 aa33.29■■■□□ 2.92
PNKP-211ENST00000598020 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.29■■■□□ 2.92
PNKP-211ENST00000598020 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.24■■■□□ 2.91
PNKP-211ENST00000598020 PTPRGP23470 1445 aa33.23■■■□□ 2.91
PNKP-211ENST00000598020 SAMD9Q5K651 1589 aa33.2■■■□□ 2.91
PNKP-211ENST00000598020 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.11■■■□□ 2.89
PNKP-211ENST00000598020 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
PNKP-211ENST00000598020 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
PNKP-211ENST00000598020 UACAQ9BZF9 1416 aa33.03■■■□□ 2.88
PNKP-211ENST00000598020 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.03■■■□□ 2.88
PNKP-211ENST00000598020 P3H3Q8IVL6 736 aa33.03■■■□□ 2.88
PNKP-211ENST00000598020 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.02■■■□□ 2.88
PNKP-211ENST00000598020 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.97■■■□□ 2.87
PNKP-211ENST00000598020 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.96■■■□□ 2.87
PNKP-211ENST00000598020 ABCC2Q92887 1545 aa32.96■■■□□ 2.87
PNKP-211ENST00000598020 ABCA8O94911 1581 aa32.94■■■□□ 2.86
PNKP-211ENST00000598020 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.93■■■□□ 2.86
PNKP-211ENST00000598020 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.92■■■□□ 2.86
PNKP-211ENST00000598020 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.9■■■□□ 2.86
PNKP-211ENST00000598020 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.85■■■□□ 2.85
PNKP-211ENST00000598020 CLIP1P30622 1438 aa32.85■■■□□ 2.85
PNKP-211ENST00000598020 MAPKBP1O60336 1514 aa32.82■■■□□ 2.84
PNKP-211ENST00000598020 FMN1Q68DA7 1419 aa32.8■■■□□ 2.84
PNKP-211ENST00000598020 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.8■■■□□ 2.84
PNKP-211ENST00000598020 CEP162Q5TB80 1403 aa32.77■■■□□ 2.84
PNKP-211ENST00000598020 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
PNKP-211ENST00000598020 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
PNKP-211ENST00000598020 ATP10BO94823 1461 aa32.67■■■□□ 2.82
PNKP-211ENST00000598020 ASXL2Q76L83 1435 aa32.65■■■□□ 2.82
PNKP-211ENST00000598020 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
PNKP-211ENST00000598020 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.61■■■□□ 2.81
PNKP-211ENST00000598020 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.58■■■□□ 2.81
PNKP-211ENST00000598020 HECW1Q76N89 1606 aa32.58■■■□□ 2.81
PNKP-211ENST00000598020 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.54■■■□□ 2.8
PNKP-211ENST00000598020 DIP2BQ9P265 1576 aa32.54■■■□□ 2.8
PNKP-211ENST00000598020 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.54■■■□□ 2.8
PNKP-211ENST00000598020 ARID3CA6NKF2 412 aa32.54■■■□□ 2.8
PNKP-211ENST00000598020 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
PNKP-211ENST00000598020 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.5■■■□□ 2.79
PNKP-211ENST00000598020 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
PNKP-211ENST00000598020 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.49■■■□□ 2.79
PNKP-211ENST00000598020 GLI2P10070 1586 aa32.48■■■□□ 2.79
PNKP-211ENST00000598020 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
PNKP-211ENST00000598020 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
PNKP-211ENST00000598020 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
PNKP-211ENST00000598020 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
PNKP-211ENST00000598020 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.42■■■□□ 2.78
PNKP-211ENST00000598020 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.41■■■□□ 2.78
PNKP-211ENST00000598020 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.41■■■□□ 2.78
PNKP-211ENST00000598020 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.38■■■□□ 2.77
PNKP-211ENST00000598020 KCNH8Q96L42 1107 aa32.35■■■□□ 2.77
PNKP-211ENST00000598020 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
PNKP-211ENST00000598020 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.3■■■□□ 2.76
PNKP-211ENST00000598020 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.26■■■□□ 2.75
PNKP-211ENST00000598020 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.26■■■□□ 2.75
PNKP-211ENST00000598020 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
PNKP-211ENST00000598020 CD109Q6YHK3 1445 aa32.21■■■□□ 2.75
PNKP-211ENST00000598020 TSPOAP1O95153 1857 aa32.2■■■□□ 2.75
PNKP-211ENST00000598020 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.74
PNKP-211ENST00000598020 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.17■■■□□ 2.74
PNKP-211ENST00000598020 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.16■■■□□ 2.74
PNKP-211ENST00000598020 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.14■■■□□ 2.74
PNKP-211ENST00000598020 KIF14Q15058 1648 aa32.12■■■□□ 2.73
PNKP-211ENST00000598020 MAP3K1Q13233 1512 aa32.12■■■□□ 2.73
PNKP-211ENST00000598020 TIAM1Q13009 1591 aa32.1■■■□□ 2.73
PNKP-211ENST00000598020 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.09■■■□□ 2.73
PNKP-211ENST00000598020 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.07■■■□□ 2.72
PNKP-211ENST00000598020 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.03■■■□□ 2.72
PNKP-211ENST00000598020 PLCH2O75038 1416 aa32■■■□□ 2.71
PNKP-211ENST00000598020 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.99■■■□□ 2.71
PNKP-211ENST00000598020 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.99■■■□□ 2.71
PNKP-211ENST00000598020 NEO1Q92859 1461 aa31.97■■■□□ 2.71
PNKP-211ENST00000598020 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.97■■■□□ 2.71
PNKP-211ENST00000598020 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.97■■■□□ 2.71
PNKP-211ENST00000598020 APLP2Q06481 763 aa31.96■■■□□ 2.71
PNKP-211ENST00000598020 KDM6BO15054 1643 aa31.93■■■□□ 2.7
PNKP-211ENST00000598020 FANCAO15360 1455 aa31.91■■■□□ 2.7
PNKP-211ENST00000598020 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.9■■■□□ 2.7
PNKP-211ENST00000598020 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
PNKP-211ENST00000598020 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
PNKP-211ENST00000598020 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
PNKP-211ENST00000598020 PREX2Q70Z35 1606 aa31.87■■■□□ 2.69
PNKP-211ENST00000598020 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.87■■■□□ 2.69
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