RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-215ENST00000596522 SHROOM2Q13796 1616 aa23.63■■□□□ 1.37
FCHO1-215ENST00000596522 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-215ENST00000596522 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.59■■□□□ 1.37
FCHO1-215ENST00000596522 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.57■■□□□ 1.36
FCHO1-215ENST00000596522 PRXQ9BXM0 1461 aa23.56■■□□□ 1.36
FCHO1-215ENST00000596522 JPH4Q96JJ6 628 aa23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-215ENST00000596522 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-215ENST00000596522 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
FCHO1-215ENST00000596522 IQGAP2Q13576 1575 aa23.41■■□□□ 1.34
FCHO1-215ENST00000596522 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
FCHO1-215ENST00000596522 KIF21BO75037 1637 aa23.39■■□□□ 1.33
FCHO1-215ENST00000596522 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.38■■□□□ 1.33
FCHO1-215ENST00000596522 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.33■■□□□ 1.32
FCHO1-215ENST00000596522 GOLGA3Q08378 1498 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-215ENST00000596522 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-215ENST00000596522 DISP1Q96F81 1524 aa23.23■■□□□ 1.31
FCHO1-215ENST00000596522 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
FCHO1-215ENST00000596522 PTPRGP23470 1445 aa23.2■■□□□ 1.3
FCHO1-215ENST00000596522 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.2■■□□□ 1.3
FCHO1-215ENST00000596522 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
FCHO1-215ENST00000596522 KIAA0556O60303 1618 aa23.19■■□□□ 1.3
FCHO1-215ENST00000596522 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.18■■□□□ 1.3
FCHO1-215ENST00000596522 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
FCHO1-215ENST00000596522 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
FCHO1-215ENST00000596522 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.08■■□□□ 1.29
FCHO1-215ENST00000596522 SAMD9Q5K651 1589 aa23.06■■□□□ 1.28
FCHO1-215ENST00000596522 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-215ENST00000596522 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-215ENST00000596522 UACAQ9BZF9 1416 aa23.04■■□□□ 1.28
FCHO1-215ENST00000596522 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.02■■□□□ 1.28
FCHO1-215ENST00000596522 MAPKBP1O60336 1514 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-215ENST00000596522 ABCC2Q92887 1545 aa23.01■■□□□ 1.27
FCHO1-215ENST00000596522 P3H3Q8IVL6 736 aa23■■□□□ 1.27
FCHO1-215ENST00000596522 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
FCHO1-215ENST00000596522 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.96■■□□□ 1.27
FCHO1-215ENST00000596522 ABCA8O94911 1581 aa22.93■■□□□ 1.26
FCHO1-215ENST00000596522 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
FCHO1-215ENST00000596522 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.92■■□□□ 1.26
FCHO1-215ENST00000596522 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.92■■□□□ 1.26
FCHO1-215ENST00000596522 DIP2BQ9P265 1576 aa22.91■■□□□ 1.26
FCHO1-215ENST00000596522 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.91■■□□□ 1.26
FCHO1-215ENST00000596522 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.89■■□□□ 1.25
FCHO1-215ENST00000596522 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.88■■□□□ 1.25
FCHO1-215ENST00000596522 FMN1Q68DA7 1419 aa22.88■■□□□ 1.25
FCHO1-215ENST00000596522 ASXL2Q76L83 1435 aa22.87■■□□□ 1.25
FCHO1-215ENST00000596522 CLIP1P30622 1438 aa22.85■■□□□ 1.25
FCHO1-215ENST00000596522 TSPOAP1O95153 1857 aa22.85■■□□□ 1.25
FCHO1-215ENST00000596522 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.82■■□□□ 1.24
FCHO1-215ENST00000596522 CEP162Q5TB80 1403 aa22.77■■□□□ 1.24
FCHO1-215ENST00000596522 ARID3CA6NKF2 412 aa22.76■■□□□ 1.23
FCHO1-215ENST00000596522 GLI2P10070 1586 aa22.76■■□□□ 1.23
FCHO1-215ENST00000596522 ATP10BO94823 1461 aa22.74■■□□□ 1.23
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FCHO1-215ENST00000596522 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.73■■□□□ 1.23
FCHO1-215ENST00000596522 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
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FCHO1-215ENST00000596522 HECW1Q76N89 1606 aa22.7■■□□□ 1.22
FCHO1-215ENST00000596522 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.68■■□□□ 1.22
FCHO1-215ENST00000596522 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
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FCHO1-215ENST00000596522 KCNH8Q96L42 1107 aa22.67■■□□□ 1.22
FCHO1-215ENST00000596522 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.66■■□□□ 1.22
FCHO1-215ENST00000596522 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.64■■□□□ 1.21
FCHO1-215ENST00000596522 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.62■■□□□ 1.21
FCHO1-215ENST00000596522 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.61■■□□□ 1.21
FCHO1-215ENST00000596522 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
FCHO1-215ENST00000596522 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-215ENST00000596522 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
FCHO1-215ENST00000596522 KDM6BO15054 1643 aa22.57■■□□□ 1.2
FCHO1-215ENST00000596522 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.57■■□□□ 1.2
FCHO1-215ENST00000596522 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.56■■□□□ 1.2
FCHO1-215ENST00000596522 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
FCHO1-215ENST00000596522 CD109Q6YHK3 1445 aa22.54■■□□□ 1.2
FCHO1-215ENST00000596522 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.53■■□□□ 1.2
FCHO1-215ENST00000596522 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.53■■□□□ 1.2
FCHO1-215ENST00000596522 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.53■■□□□ 1.2
FCHO1-215ENST00000596522 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.49■■□□□ 1.19
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FCHO1-215ENST00000596522 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
FCHO1-215ENST00000596522 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
FCHO1-215ENST00000596522 KIF14Q15058 1648 aa22.39■■□□□ 1.17
FCHO1-215ENST00000596522 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.38■■□□□ 1.17
FCHO1-215ENST00000596522 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.36■■□□□ 1.17
FCHO1-215ENST00000596522 MAP3K1Q13233 1512 aa22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-215ENST00000596522 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.35■■□□□ 1.17
FCHO1-215ENST00000596522 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.33■■□□□ 1.17
FCHO1-215ENST00000596522 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.32■■□□□ 1.16
FCHO1-215ENST00000596522 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.31■■□□□ 1.16
FCHO1-215ENST00000596522 NEO1Q92859 1461 aa22.31■■□□□ 1.16
FCHO1-215ENST00000596522 APLP2Q06481 763 aa22.31■■□□□ 1.16
FCHO1-215ENST00000596522 TIAM1Q13009 1591 aa22.3■■□□□ 1.16
FCHO1-215ENST00000596522 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.29■■□□□ 1.16
FCHO1-215ENST00000596522 PLCH2O75038 1416 aa22.27■■□□□ 1.16
FCHO1-215ENST00000596522 FANCAO15360 1455 aa22.27■■□□□ 1.16
FCHO1-215ENST00000596522 AKNAQ7Z591 1439 aa22.23■■□□□ 1.15
FCHO1-215ENST00000596522 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.23■■□□□ 1.15
FCHO1-215ENST00000596522 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.22■■□□□ 1.15
FCHO1-215ENST00000596522 RAPGEF3O95398 923 aa22.21■■□□□ 1.15
FCHO1-215ENST00000596522 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.2■■□□□ 1.14
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