RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594800.5

RAB4B-203, Transcript of RAB4B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RAB4B, Length 1,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4B-203ENST00000594800 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
RAB4B-203ENST00000594800 JPH4Q96JJ6 628 aa42.05■■■■■ 4.32
RAB4B-203ENST00000594800 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.89■■■■■ 4.3
RAB4B-203ENST00000594800 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.83■■■■■ 4.29
RAB4B-203ENST00000594800 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.59■■■■■ 4.25
RAB4B-203ENST00000594800 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.58■■■■■ 4.25
RAB4B-203ENST00000594800 IQGAP2Q13576 1575 aa41.54■■■■■ 4.24
RAB4B-203ENST00000594800 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.5■■■■■ 4.23
RAB4B-203ENST00000594800 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.49■■■■■ 4.23
RAB4B-203ENST00000594800 MAPKBP1O60336 1514 aa41.48■■■■■ 4.23
RAB4B-203ENST00000594800 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.45■■■■■ 4.23
RAB4B-203ENST00000594800 PTPRGP23470 1445 aa41.43■■■■■ 4.22
RAB4B-203ENST00000594800 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.4■■■■■ 4.22
RAB4B-203ENST00000594800 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.38■■■■■ 4.22
RAB4B-203ENST00000594800 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
RAB4B-203ENST00000594800 DIP2BQ9P265 1576 aa41.33■■■■■ 4.21
RAB4B-203ENST00000594800 DISP1Q96F81 1524 aa41.32■■■■■ 4.2
RAB4B-203ENST00000594800 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.31■■■■■ 4.2
RAB4B-203ENST00000594800 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.28■■■■■ 4.2
RAB4B-203ENST00000594800 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.21■■■■■ 4.19
RAB4B-203ENST00000594800 ABCC2Q92887 1545 aa41.2■■■■■ 4.19
RAB4B-203ENST00000594800 KIAA0556O60303 1618 aa41.18■■■■■ 4.18
RAB4B-203ENST00000594800 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.16■■■■■ 4.18
RAB4B-203ENST00000594800 UACAQ9BZF9 1416 aa41.14■■■■■ 4.18
RAB4B-203ENST00000594800 PRXQ9BXM0 1461 aa41.14■■■■■ 4.18
RAB4B-203ENST00000594800 TSPOAP1O95153 1857 aa41.04■■■■■ 4.16
RAB4B-203ENST00000594800 ASXL2Q76L83 1435 aa41.02■■■■■ 4.16
RAB4B-203ENST00000594800 PLB1Q6P1J6 1458 aa41■■■■■ 4.15
RAB4B-203ENST00000594800 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.98■■■■■ 4.15
RAB4B-203ENST00000594800 GOLGA3Q08378 1498 aa40.96■■■■■ 4.15
RAB4B-203ENST00000594800 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
RAB4B-203ENST00000594800 GLI2P10070 1586 aa40.91■■■■■ 4.14
RAB4B-203ENST00000594800 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
RAB4B-203ENST00000594800 KDM6BO15054 1643 aa40.89■■■■■ 4.14
RAB4B-203ENST00000594800 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.85■■■■■ 4.13
RAB4B-203ENST00000594800 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
RAB4B-203ENST00000594800 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
RAB4B-203ENST00000594800 ABCA8O94911 1581 aa40.78■■■■■ 4.12
RAB4B-203ENST00000594800 EEA1Q15075 1411 aa40.75■■■■■ 4.11
RAB4B-203ENST00000594800 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.71■■■■■ 4.11
RAB4B-203ENST00000594800 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.68■■■■■ 4.1
RAB4B-203ENST00000594800 SAMD9Q5K651 1589 aa40.61■■■■■ 4.09
RAB4B-203ENST00000594800 P3H3Q8IVL6 736 aa40.59■■■■■ 4.09
RAB4B-203ENST00000594800 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.55■■■■■ 4.08
RAB4B-203ENST00000594800 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
RAB4B-203ENST00000594800 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
RAB4B-203ENST00000594800 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.46■■■■■ 4.07
RAB4B-203ENST00000594800 KIF21BO75037 1637 aa40.45■■■■■ 4.07
RAB4B-203ENST00000594800 KCNH8Q96L42 1107 aa40.43■■■■■ 4.06
RAB4B-203ENST00000594800 ATP10BO94823 1461 aa40.41■■■■■ 4.06
RAB4B-203ENST00000594800 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.4■■■■■ 4.06
RAB4B-203ENST00000594800 ARID3CA6NKF2 412 aa40.39■■■■■ 4.06
RAB4B-203ENST00000594800 CD109Q6YHK3 1445 aa40.39■■■■■ 4.06
RAB4B-203ENST00000594800 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.37■■■■■ 4.05
RAB4B-203ENST00000594800 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
RAB4B-203ENST00000594800 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.33■■■■■ 4.05
RAB4B-203ENST00000594800 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.32■■■■■ 4.05
RAB4B-203ENST00000594800 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.31■■■■■ 4.04
RAB4B-203ENST00000594800 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.23■■■■■ 4.03
RAB4B-203ENST00000594800 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
RAB4B-203ENST00000594800 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.19■■■■■ 4.02
RAB4B-203ENST00000594800 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
RAB4B-203ENST00000594800 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
RAB4B-203ENST00000594800 ADGRL1O94910 1474 aa40.1■■■■■ 4.01
RAB4B-203ENST00000594800 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.08■■■■■ 4.01
RAB4B-203ENST00000594800 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
RAB4B-203ENST00000594800 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.05■■■■■ 4
RAB4B-203ENST00000594800 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.97■■■■□ 3.99
RAB4B-203ENST00000594800 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.95■■■■□ 3.99
RAB4B-203ENST00000594800 NEO1Q92859 1461 aa39.93■■■■□ 3.98
RAB4B-203ENST00000594800 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.91■■■■□ 3.98
RAB4B-203ENST00000594800 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
RAB4B-203ENST00000594800 FMN1Q68DA7 1419 aa39.85■■■■□ 3.97
RAB4B-203ENST00000594800 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.82■■■■□ 3.97
RAB4B-203ENST00000594800 HECW1Q76N89 1606 aa39.8■■■■□ 3.96
RAB4B-203ENST00000594800 RAPGEF3O95398 923 aa39.78■■■■□ 3.96
RAB4B-203ENST00000594800 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.78■■■■□ 3.96
RAB4B-203ENST00000594800 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.76■■■■□ 3.96
RAB4B-203ENST00000594800 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
RAB4B-203ENST00000594800 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.72■■■■□ 3.95
RAB4B-203ENST00000594800 FANCAO15360 1455 aa39.7■■■■□ 3.95
RAB4B-203ENST00000594800 AKNAQ7Z591 1439 aa39.67■■■■□ 3.94
RAB4B-203ENST00000594800 RICTORQ6R327 1708 aa39.65■■■■□ 3.94
RAB4B-203ENST00000594800 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.94
RAB4B-203ENST00000594800 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.61■■■■□ 3.93
RAB4B-203ENST00000594800 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
RAB4B-203ENST00000594800 PLCH2O75038 1416 aa39.56■■■■□ 3.92
RAB4B-203ENST00000594800 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.53■■■■□ 3.92
RAB4B-203ENST00000594800 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.52■■■■□ 3.92
RAB4B-203ENST00000594800 KIF14Q15058 1648 aa39.52■■■■□ 3.92
RAB4B-203ENST00000594800 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.51■■■■□ 3.91
RAB4B-203ENST00000594800 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
RAB4B-203ENST00000594800 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
RAB4B-203ENST00000594800 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.48■■■■□ 3.91
RAB4B-203ENST00000594800 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.48■■■■□ 3.91
RAB4B-203ENST00000594800 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.46■■■■□ 3.91
RAB4B-203ENST00000594800 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.45■■■■□ 3.91
RAB4B-203ENST00000594800 CLIP1P30622 1438 aa39.43■■■■□ 3.9
RAB4B-203ENST00000594800 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.41■■■■□ 3.9
RAB4B-203ENST00000594800 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms