RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591767.5

POLR2E-209, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 1,214 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-209ENST00000591767 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.58■■■□□ 2.49
POLR2E-209ENST00000591767 TSPOAP1O95153 1857 aa30.58■■■□□ 2.49
POLR2E-209ENST00000591767 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.57■■■□□ 2.48
POLR2E-209ENST00000591767 MAPKBP1O60336 1514 aa30.57■■■□□ 2.48
POLR2E-209ENST00000591767 JPH4Q96JJ6 628 aa30.53■■■□□ 2.48
POLR2E-209ENST00000591767 KDM6BO15054 1643 aa30.52■■■□□ 2.48
POLR2E-209ENST00000591767 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.52■■■□□ 2.48
POLR2E-209ENST00000591767 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
POLR2E-209ENST00000591767 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.43■■■□□ 2.46
POLR2E-209ENST00000591767 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.32■■■□□ 2.44
POLR2E-209ENST00000591767 CUL7Q14999 1698 aa30.28■■■□□ 2.44
POLR2E-209ENST00000591767 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.27■■■□□ 2.44
POLR2E-209ENST00000591767 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
POLR2E-209ENST00000591767 IGF1RP08069 1367 aa30.09■■■□□ 2.41
POLR2E-209ENST00000591767 PTPRGP23470 1445 aa30.09■■■□□ 2.41
POLR2E-209ENST00000591767 ABCC2Q92887 1545 aa30.08■■■□□ 2.41
POLR2E-209ENST00000591767 KIF27Q86VH2 1401 aa30.08■■■□□ 2.41
POLR2E-209ENST00000591767 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
POLR2E-209ENST00000591767 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
POLR2E-209ENST00000591767 GLI2P10070 1586 aa30.06■■■□□ 2.4
POLR2E-209ENST00000591767 ADGRL1O94910 1474 aa30.05■■■□□ 2.4
POLR2E-209ENST00000591767 ASXL2Q76L83 1435 aa30.04■■■□□ 2.4
POLR2E-209ENST00000591767 IQGAP2Q13576 1575 aa30.01■■■□□ 2.39
POLR2E-209ENST00000591767 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.99■■■□□ 2.39
POLR2E-209ENST00000591767 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.99■■■□□ 2.39
POLR2E-209ENST00000591767 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.98■■■□□ 2.39
POLR2E-209ENST00000591767 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.97■■■□□ 2.39
POLR2E-209ENST00000591767 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.93■■■□□ 2.38
POLR2E-209ENST00000591767 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.91■■■□□ 2.38
POLR2E-209ENST00000591767 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.9■■■□□ 2.38
POLR2E-209ENST00000591767 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
POLR2E-209ENST00000591767 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
POLR2E-209ENST00000591767 UACAQ9BZF9 1416 aa29.87■■■□□ 2.37
POLR2E-209ENST00000591767 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
POLR2E-209ENST00000591767 DISP1Q96F81 1524 aa29.85■■■□□ 2.37
POLR2E-209ENST00000591767 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.82■■■□□ 2.36
POLR2E-209ENST00000591767 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.81■■■□□ 2.36
POLR2E-209ENST00000591767 KIAA0556O60303 1618 aa29.77■■■□□ 2.36
POLR2E-209ENST00000591767 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.73■■■□□ 2.35
POLR2E-209ENST00000591767 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.66■■■□□ 2.34
POLR2E-209ENST00000591767 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.66■■■□□ 2.34
POLR2E-209ENST00000591767 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.66■■■□□ 2.34
POLR2E-209ENST00000591767 KIF21BO75037 1637 aa29.61■■■□□ 2.33
POLR2E-209ENST00000591767 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.61■■■□□ 2.33
POLR2E-209ENST00000591767 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.52■■■□□ 2.32
POLR2E-209ENST00000591767 CD109Q6YHK3 1445 aa29.49■■■□□ 2.31
POLR2E-209ENST00000591767 ABCA8O94911 1581 aa29.48■■■□□ 2.31
POLR2E-209ENST00000591767 KCNH8Q96L42 1107 aa29.4■■■□□ 2.3
POLR2E-209ENST00000591767 GOLGA3Q08378 1498 aa29.4■■■□□ 2.3
POLR2E-209ENST00000591767 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.33■■■□□ 2.29
POLR2E-209ENST00000591767 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.31■■■□□ 2.28
POLR2E-209ENST00000591767 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.26■■■□□ 2.27
POLR2E-209ENST00000591767 FBXO41Q8TF61 875 aa29.25■■■□□ 2.27
POLR2E-209ENST00000591767 PTPRMP28827 1452 aa29.24■■■□□ 2.27
POLR2E-209ENST00000591767 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.23■■■□□ 2.27
POLR2E-209ENST00000591767 ARID3CA6NKF2 412 aa29.21■■■□□ 2.27
POLR2E-209ENST00000591767 MADDQ8WXG6 1647 aa29.2■■■□□ 2.27
POLR2E-209ENST00000591767 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.17■■■□□ 2.26
POLR2E-209ENST00000591767 ATP10BO94823 1461 aa29.16■■■□□ 2.26
POLR2E-209ENST00000591767 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
POLR2E-209ENST00000591767 PRXQ9BXM0 1461 aa29.13■■■□□ 2.25
POLR2E-209ENST00000591767 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
POLR2E-209ENST00000591767 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.1■■■□□ 2.25
POLR2E-209ENST00000591767 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.08■■■□□ 2.25
POLR2E-209ENST00000591767 NEO1Q92859 1461 aa29.08■■■□□ 2.25
POLR2E-209ENST00000591767 RAPGEF3O95398 923 aa29.07■■■□□ 2.24
POLR2E-209ENST00000591767 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.07■■■□□ 2.24
POLR2E-209ENST00000591767 SAMD9Q5K651 1589 aa29.06■■■□□ 2.24
POLR2E-209ENST00000591767 P3H3Q8IVL6 736 aa29.06■■■□□ 2.24
POLR2E-209ENST00000591767 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.04■■■□□ 2.24
POLR2E-209ENST00000591767 RICTORQ6R327 1708 aa29.04■■■□□ 2.24
POLR2E-209ENST00000591767 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
POLR2E-209ENST00000591767 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
POLR2E-209ENST00000591767 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.94■■■□□ 2.22
POLR2E-209ENST00000591767 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.92■■■□□ 2.22
POLR2E-209ENST00000591767 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
POLR2E-209ENST00000591767 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
POLR2E-209ENST00000591767 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
POLR2E-209ENST00000591767 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.89■■■□□ 2.22
POLR2E-209ENST00000591767 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
POLR2E-209ENST00000591767 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.84■■■□□ 2.21
POLR2E-209ENST00000591767 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.84■■■□□ 2.21
POLR2E-209ENST00000591767 HSPA2P54652 639 aa28.83■■■□□ 2.21
POLR2E-209ENST00000591767 FANCAO15360 1455 aa28.83■■■□□ 2.21
POLR2E-209ENST00000591767 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.82■■■□□ 2.2
POLR2E-209ENST00000591767 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.81■■■□□ 2.2
POLR2E-209ENST00000591767 AKNAQ7Z591 1439 aa28.8■■■□□ 2.2
POLR2E-209ENST00000591767 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.79■■■□□ 2.2
POLR2E-209ENST00000591767 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.2
POLR2E-209ENST00000591767 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.79■■■□□ 2.2
POLR2E-209ENST00000591767 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.77■■■□□ 2.2
POLR2E-209ENST00000591767 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.75■■■□□ 2.19
POLR2E-209ENST00000591767 HECW1Q76N89 1606 aa28.73■■■□□ 2.19
POLR2E-209ENST00000591767 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.71■■■□□ 2.19
POLR2E-209ENST00000591767 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
POLR2E-209ENST00000591767 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.68■■■□□ 2.18
POLR2E-209ENST00000591767 CERKQ8TCT0 537 aa28.66■■■□□ 2.18
POLR2E-209ENST00000591767 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.66■■■□□ 2.18
POLR2E-209ENST00000591767 MLECQ14165 292 aa28.65■■■□□ 2.18
POLR2E-209ENST00000591767 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms