RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 GRIN2AQ12879 1464 aa31.24■■■□□ 2.59
PGS1-211ENST00000589425 FBLN2P98095 1184 aa31.23■■■□□ 2.59
PGS1-211ENST00000589425 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.17■■■□□ 2.58
PGS1-211ENST00000589425 ARAP1Q96P48 1450 aa31.11■■■□□ 2.57
PGS1-211ENST00000589425 CEP170Q5SW79 1584 aa31.06■■■□□ 2.56
PGS1-211ENST00000589425 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.05■■■□□ 2.56
PGS1-211ENST00000589425 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.05■■■□□ 2.56
PGS1-211ENST00000589425 IQGAP2Q13576 1575 aa31.05■■■□□ 2.56
PGS1-211ENST00000589425 NUP160Q12769 1436 aa31.04■■■□□ 2.56
PGS1-211ENST00000589425 P3H3Q8IVL6 736 aa31.03■■■□□ 2.56
PGS1-211ENST00000589425 CHD1O14646 1710 aa30.99■■■□□ 2.55
PGS1-211ENST00000589425 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.99■■■□□ 2.55
PGS1-211ENST00000589425 SAMD9Q5K651 1589 aa30.94■■■□□ 2.54
PGS1-211ENST00000589425 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.93■■■□□ 2.54
PGS1-211ENST00000589425 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.91■■■□□ 2.54
PGS1-211ENST00000589425 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
PGS1-211ENST00000589425 JPH4Q96JJ6 628 aa30.85■■■□□ 2.53
PGS1-211ENST00000589425 DISP1Q96F81 1524 aa30.81■■■□□ 2.52
PGS1-211ENST00000589425 FMN1Q68DA7 1419 aa30.75■■■□□ 2.51
PGS1-211ENST00000589425 KIAA0556O60303 1618 aa30.74■■■□□ 2.51
PGS1-211ENST00000589425 APLP2Q06481 763 aa30.74■■■□□ 2.51
PGS1-211ENST00000589425 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
PGS1-211ENST00000589425 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.66■■■□□ 2.5
PGS1-211ENST00000589425 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.66■■■□□ 2.5
PGS1-211ENST00000589425 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
PGS1-211ENST00000589425 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.65■■■□□ 2.5
PGS1-211ENST00000589425 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
PGS1-211ENST00000589425 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
PGS1-211ENST00000589425 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.62■■■□□ 2.49
PGS1-211ENST00000589425 SHROOM2Q13796 1616 aa30.61■■■□□ 2.49
PGS1-211ENST00000589425 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
PGS1-211ENST00000589425 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
PGS1-211ENST00000589425 OSCARQ8IYS5 282 aa30.55■■■□□ 2.48
PGS1-211ENST00000589425 MAP3K1Q13233 1512 aa30.53■■■□□ 2.48
PGS1-211ENST00000589425 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.53■■■□□ 2.48
PGS1-211ENST00000589425 TIAM1Q13009 1591 aa30.52■■■□□ 2.48
PGS1-211ENST00000589425 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.48■■■□□ 2.47
PGS1-211ENST00000589425 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.45■■■□□ 2.46
PGS1-211ENST00000589425 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.43■■■□□ 2.46
PGS1-211ENST00000589425 HECW1Q76N89 1606 aa30.43■■■□□ 2.46
PGS1-211ENST00000589425 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.42■■■□□ 2.46
PGS1-211ENST00000589425 PTPRGP23470 1445 aa30.42■■■□□ 2.46
PGS1-211ENST00000589425 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.41■■■□□ 2.46
PGS1-211ENST00000589425 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.41■■■□□ 2.46
PGS1-211ENST00000589425 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
PGS1-211ENST00000589425 ARID3CA6NKF2 412 aa30.36■■■□□ 2.45
PGS1-211ENST00000589425 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
PGS1-211ENST00000589425 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.34■■■□□ 2.45
PGS1-211ENST00000589425 ABCA8O94911 1581 aa30.33■■■□□ 2.45
PGS1-211ENST00000589425 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
PGS1-211ENST00000589425 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.26■■■□□ 2.43
PGS1-211ENST00000589425 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.24■■■□□ 2.43
PGS1-211ENST00000589425 UACAQ9BZF9 1416 aa30.23■■■□□ 2.43
PGS1-211ENST00000589425 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
PGS1-211ENST00000589425 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
PGS1-211ENST00000589425 ATP10BO94823 1461 aa30.17■■■□□ 2.42
PGS1-211ENST00000589425 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.16■■■□□ 2.42
PGS1-211ENST00000589425 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.15■■■□□ 2.42
PGS1-211ENST00000589425 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
PGS1-211ENST00000589425 ABCC2Q92887 1545 aa30.12■■■□□ 2.41
PGS1-211ENST00000589425 NCOA2Q15596 1464 aa30.08■■■□□ 2.41
PGS1-211ENST00000589425 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
PGS1-211ENST00000589425 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
PGS1-211ENST00000589425 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.06■■■□□ 2.4
PGS1-211ENST00000589425 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.03■■■□□ 2.4
PGS1-211ENST00000589425 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
PGS1-211ENST00000589425 ARHGEF11O15085 1522 aa30.02■■■□□ 2.4
PGS1-211ENST00000589425 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.01■■■□□ 2.4
PGS1-211ENST00000589425 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.96■■■□□ 2.39
PGS1-211ENST00000589425 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.96■■■□□ 2.39
PGS1-211ENST00000589425 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.94■■■□□ 2.38
PGS1-211ENST00000589425 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.92■■■□□ 2.38
PGS1-211ENST00000589425 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
PGS1-211ENST00000589425 KIF14Q15058 1648 aa29.89■■■□□ 2.38
PGS1-211ENST00000589425 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
PGS1-211ENST00000589425 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.86■■■□□ 2.37
PGS1-211ENST00000589425 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.86■■■□□ 2.37
PGS1-211ENST00000589425 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.86■■■□□ 2.37
PGS1-211ENST00000589425 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.81■■■□□ 2.36
PGS1-211ENST00000589425 ITGAEP38570 1179 aa29.81■■■□□ 2.36
PGS1-211ENST00000589425 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.8■■■□□ 2.36
PGS1-211ENST00000589425 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.79■■■□□ 2.36
PGS1-211ENST00000589425 MIA2Q96PC5 1412 aa29.79■■■□□ 2.36
PGS1-211ENST00000589425 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
PGS1-211ENST00000589425 KCNH8Q96L42 1107 aa29.77■■■□□ 2.36
PGS1-211ENST00000589425 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.76■■■□□ 2.35
PGS1-211ENST00000589425 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.35
PGS1-211ENST00000589425 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
PGS1-211ENST00000589425 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
PGS1-211ENST00000589425 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.69■■■□□ 2.34
PGS1-211ENST00000589425 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
PGS1-211ENST00000589425 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.68■■■□□ 2.34
PGS1-211ENST00000589425 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.67■■■□□ 2.34
PGS1-211ENST00000589425 ASXL2Q76L83 1435 aa29.67■■■□□ 2.34
PGS1-211ENST00000589425 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.67■■■□□ 2.34
PGS1-211ENST00000589425 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.65■■■□□ 2.34
PGS1-211ENST00000589425 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
PGS1-211ENST00000589425 PTPRKQ15262 1439 aa29.61■■■□□ 2.33
PGS1-211ENST00000589425 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.58■■■□□ 2.33
PGS1-211ENST00000589425 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.56■■■□□ 2.32
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