RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-216ENST00000588477 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.37■■□□□ 1.97
IFT20-216ENST00000588477 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.32■■□□□ 1.96
IFT20-216ENST00000588477 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
IFT20-216ENST00000588477 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.31■■□□□ 1.96
IFT20-216ENST00000588477 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.27■■□□□ 1.96
IFT20-216ENST00000588477 MAPKBP1O60336 1514 aa27.27■■□□□ 1.96
IFT20-216ENST00000588477 DIP2BQ9P265 1576 aa27.26■■□□□ 1.95
IFT20-216ENST00000588477 TSPOAP1O95153 1857 aa27.25■■□□□ 1.95
IFT20-216ENST00000588477 KDM6BO15054 1643 aa27.16■■□□□ 1.94
IFT20-216ENST00000588477 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.16■■□□□ 1.94
IFT20-216ENST00000588477 CUL7Q14999 1698 aa27.13■■□□□ 1.93
IFT20-216ENST00000588477 IGF1RP08069 1367 aa27.09■■□□□ 1.93
IFT20-216ENST00000588477 KIF27Q86VH2 1401 aa27.05■■□□□ 1.92
IFT20-216ENST00000588477 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.04■■□□□ 1.92
IFT20-216ENST00000588477 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
IFT20-216ENST00000588477 PTPRGP23470 1445 aa26.99■■□□□ 1.91
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IFT20-216ENST00000588477 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
IFT20-216ENST00000588477 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.9■■□□□ 1.9
IFT20-216ENST00000588477 ABCC2Q92887 1545 aa26.9■■□□□ 1.9
IFT20-216ENST00000588477 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.9■■□□□ 1.9
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IFT20-216ENST00000588477 ASXL2Q76L83 1435 aa26.87■■□□□ 1.89
IFT20-216ENST00000588477 GLI2P10070 1586 aa26.85■■□□□ 1.89
IFT20-216ENST00000588477 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.84■■□□□ 1.89
IFT20-216ENST00000588477 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.8■■□□□ 1.88
IFT20-216ENST00000588477 UACAQ9BZF9 1416 aa26.77■■□□□ 1.88
IFT20-216ENST00000588477 DISP1Q96F81 1524 aa26.75■■□□□ 1.87
IFT20-216ENST00000588477 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.74■■□□□ 1.87
IFT20-216ENST00000588477 ADGRL1O94910 1474 aa26.72■■□□□ 1.87
IFT20-216ENST00000588477 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
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IFT20-216ENST00000588477 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.7■■□□□ 1.86
IFT20-216ENST00000588477 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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IFT20-216ENST00000588477 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.63■■□□□ 1.85
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IFT20-216ENST00000588477 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.57■■□□□ 1.84
IFT20-216ENST00000588477 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.53■■□□□ 1.84
IFT20-216ENST00000588477 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.52■■□□□ 1.84
IFT20-216ENST00000588477 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.49■■□□□ 1.83
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IFT20-216ENST00000588477 CD109Q6YHK3 1445 aa26.42■■□□□ 1.82
IFT20-216ENST00000588477 ABCA8O94911 1581 aa26.41■■□□□ 1.82
IFT20-216ENST00000588477 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.4■■□□□ 1.82
IFT20-216ENST00000588477 GOLGA3Q08378 1498 aa26.4■■□□□ 1.82
IFT20-216ENST00000588477 KIF21BO75037 1637 aa26.36■■□□□ 1.81
IFT20-216ENST00000588477 ARID3CA6NKF2 412 aa26.23■■□□□ 1.79
IFT20-216ENST00000588477 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.23■■□□□ 1.79
IFT20-216ENST00000588477 PRXQ9BXM0 1461 aa26.23■■□□□ 1.79
IFT20-216ENST00000588477 P3H3Q8IVL6 736 aa26.19■■□□□ 1.78
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IFT20-216ENST00000588477 ATP10BO94823 1461 aa26.18■■□□□ 1.78
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IFT20-216ENST00000588477 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.13■■□□□ 1.77
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IFT20-216ENST00000588477 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.05■■□□□ 1.76
IFT20-216ENST00000588477 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
IFT20-216ENST00000588477 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
IFT20-216ENST00000588477 NEO1Q92859 1461 aa26.03■■□□□ 1.76
IFT20-216ENST00000588477 FBXO41Q8TF61 875 aa26.02■■□□□ 1.76
IFT20-216ENST00000588477 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.01■■□□□ 1.75
IFT20-216ENST00000588477 MADDQ8WXG6 1647 aa26■■□□□ 1.75
IFT20-216ENST00000588477 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
IFT20-216ENST00000588477 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.94■■□□□ 1.74
IFT20-216ENST00000588477 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
IFT20-216ENST00000588477 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
IFT20-216ENST00000588477 RICTORQ6R327 1708 aa25.93■■□□□ 1.74
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IFT20-216ENST00000588477 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
IFT20-216ENST00000588477 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.88■■□□□ 1.73
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IFT20-216ENST00000588477 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.85■■□□□ 1.73
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IFT20-216ENST00000588477 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.72
IFT20-216ENST00000588477 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.8■■□□□ 1.72
IFT20-216ENST00000588477 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.78■■□□□ 1.72
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IFT20-216ENST00000588477 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.73■■□□□ 1.71
IFT20-216ENST00000588477 EEA1Q15075 1411 aa25.71■■□□□ 1.71
IFT20-216ENST00000588477 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.71■■□□□ 1.71
IFT20-216ENST00000588477 HECW1Q76N89 1606 aa25.7■■□□□ 1.71
IFT20-216ENST00000588477 MLECQ14165 292 aa25.68■■□□□ 1.7
IFT20-216ENST00000588477 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
IFT20-216ENST00000588477 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.66■■□□□ 1.7
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