RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588337.5

KDM4B-205, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM4B, Length 504 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-205ENST00000588337 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.34■■■■■ 5.01
KDM4B-205ENST00000588337 JPH4Q96JJ6 628 aa46.32■■■■■ 5.01
KDM4B-205ENST00000588337 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.27■■■■■ 5
KDM4B-205ENST00000588337 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.25■■■■■ 4.99
KDM4B-205ENST00000588337 IQGAP2Q13576 1575 aa45.96■■■■■ 4.95
KDM4B-205ENST00000588337 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.95■■■■■ 4.95
KDM4B-205ENST00000588337 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.85■■■■■ 4.93
KDM4B-205ENST00000588337 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.76■■■■■ 4.92
KDM4B-205ENST00000588337 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.73■■■■■ 4.91
KDM4B-205ENST00000588337 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.7■■■■■ 4.91
KDM4B-205ENST00000588337 PTPRGP23470 1445 aa45.68■■■■■ 4.9
KDM4B-205ENST00000588337 DISP1Q96F81 1524 aa45.67■■■■■ 4.9
KDM4B-205ENST00000588337 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.67■■■■■ 4.9
KDM4B-205ENST00000588337 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.67■■■■■ 4.9
KDM4B-205ENST00000588337 MAPKBP1O60336 1514 aa45.66■■■■■ 4.9
KDM4B-205ENST00000588337 PRXQ9BXM0 1461 aa45.64■■■■■ 4.9
KDM4B-205ENST00000588337 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.6■■■■■ 4.89
KDM4B-205ENST00000588337 KIAA0556O60303 1618 aa45.55■■■■■ 4.88
KDM4B-205ENST00000588337 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.54■■■■■ 4.88
KDM4B-205ENST00000588337 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.5■■■■■ 4.87
KDM4B-205ENST00000588337 DIP2BQ9P265 1576 aa45.49■■■■■ 4.87
KDM4B-205ENST00000588337 ABCC2Q92887 1545 aa45.42■■■■■ 4.86
KDM4B-205ENST00000588337 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.41■■■■■ 4.86
KDM4B-205ENST00000588337 UACAQ9BZF9 1416 aa45.38■■■■■ 4.86
KDM4B-205ENST00000588337 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.35■■■■■ 4.85
KDM4B-205ENST00000588337 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.33■■■■■ 4.85
KDM4B-205ENST00000588337 EEA1Q15075 1411 aa45.32■■■■■ 4.85
KDM4B-205ENST00000588337 GOLGA3Q08378 1498 aa45.31■■■■■ 4.84
KDM4B-205ENST00000588337 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.21■■■■■ 4.83
KDM4B-205ENST00000588337 ASXL2Q76L83 1435 aa45.19■■■■■ 4.83
KDM4B-205ENST00000588337 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP45.19■■■■■ 4.82
KDM4B-205ENST00000588337 TSPOAP1O95153 1857 aa45.16■■■■■ 4.82
KDM4B-205ENST00000588337 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.16■■■■■ 4.82
KDM4B-205ENST00000588337 ABCA8O94911 1581 aa45.08■■■■■ 4.81
KDM4B-205ENST00000588337 GLI2P10070 1586 aa45.06■■■■■ 4.8
KDM4B-205ENST00000588337 SAMD9Q5K651 1589 aa45.03■■■■■ 4.8
KDM4B-205ENST00000588337 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.03■■■■■ 4.8
KDM4B-205ENST00000588337 KIF21BO75037 1637 aa45.01■■■■■ 4.8
KDM4B-205ENST00000588337 CHIC1Q5VXU3 224 aa45■■■■■ 4.79
KDM4B-205ENST00000588337 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
KDM4B-205ENST00000588337 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
KDM4B-205ENST00000588337 KDM6BO15054 1643 aa44.91■■■■■ 4.78
KDM4B-205ENST00000588337 P3H3Q8IVL6 736 aa44.88■■■■■ 4.78
KDM4B-205ENST00000588337 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.87■■■■■ 4.77
KDM4B-205ENST00000588337 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.87■■■■■ 4.77
KDM4B-205ENST00000588337 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.72■■■■■ 4.75
KDM4B-205ENST00000588337 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.69■■■■■ 4.74
KDM4B-205ENST00000588337 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.67■■■■■ 4.74
KDM4B-205ENST00000588337 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.65■■■■■ 4.74
KDM4B-205ENST00000588337 ATP10BO94823 1461 aa44.65■■■■■ 4.74
KDM4B-205ENST00000588337 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.64■■■■■ 4.74
KDM4B-205ENST00000588337 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.62■■■■■ 4.73
KDM4B-205ENST00000588337 ARID3CA6NKF2 412 aa44.59■■■■■ 4.73
KDM4B-205ENST00000588337 KCNH8Q96L42 1107 aa44.54■■■■■ 4.72
KDM4B-205ENST00000588337 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.52■■■■■ 4.72
KDM4B-205ENST00000588337 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.52■■■■■ 4.72
KDM4B-205ENST00000588337 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
KDM4B-205ENST00000588337 CD109Q6YHK3 1445 aa44.49■■■■■ 4.71
KDM4B-205ENST00000588337 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
KDM4B-205ENST00000588337 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.47■■■■■ 4.71
KDM4B-205ENST00000588337 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.47■■■■■ 4.71
KDM4B-205ENST00000588337 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.39■■■■■ 4.7
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KDM4B-205ENST00000588337 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.31■■■■■ 4.68
KDM4B-205ENST00000588337 FMN1Q68DA7 1419 aa44.18■■■■■ 4.66
KDM4B-205ENST00000588337 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
KDM4B-205ENST00000588337 HECW1Q76N89 1606 aa44.15■■■■■ 4.66
KDM4B-205ENST00000588337 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.11■■■■■ 4.65
KDM4B-205ENST00000588337 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.11■■■■■ 4.65
KDM4B-205ENST00000588337 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.1■■■■■ 4.65
KDM4B-205ENST00000588337 NEO1Q92859 1461 aa44.03■■■■■ 4.64
KDM4B-205ENST00000588337 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.03■■■■■ 4.642e-6■■■□□ 17.9
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KDM4B-205ENST00000588337 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.01■■■■■ 4.64
KDM4B-205ENST00000588337 ADGRL1O94910 1474 aa43.98■■■■■ 4.63
KDM4B-205ENST00000588337 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.97■■■■■ 4.63
KDM4B-205ENST00000588337 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
KDM4B-205ENST00000588337 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.89■■■■■ 4.62
KDM4B-205ENST00000588337 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.62
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KDM4B-205ENST00000588337 FANCAO15360 1455 aa43.83■■■■■ 4.61
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KDM4B-205ENST00000588337 KIF14Q15058 1648 aa43.78■■■■■ 4.6
KDM4B-205ENST00000588337 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.78■■■■■ 4.6
KDM4B-205ENST00000588337 RICTORQ6R327 1708 aa43.77■■■■■ 4.6
KDM4B-205ENST00000588337 CLIP1P30622 1438 aa43.77■■■■■ 4.6
KDM4B-205ENST00000588337 AKNAQ7Z591 1439 aa43.76■■■■■ 4.6
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KDM4B-205ENST00000588337 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.7■■■■■ 4.59
KDM4B-205ENST00000588337 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
KDM4B-205ENST00000588337 PLCH2O75038 1416 aa43.69■■■■■ 4.58
KDM4B-205ENST00000588337 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.68■■■■■ 4.58
KDM4B-205ENST00000588337 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.6■■■■■ 4.57
KDM4B-205ENST00000588337 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.58■■■■■ 4.57
KDM4B-205ENST00000588337 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.48■■■■■ 4.55
KDM4B-205ENST00000588337 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.48■■■■■ 4.55
KDM4B-205ENST00000588337 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.48■■■■■ 4.55
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