RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.32■■■■□ 3.56
RARA-AS1-201ENST00000581080 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
RARA-AS1-201ENST00000581080 NUP160Q12769 1436 aa37.15■■■■□ 3.54
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.14■■■■□ 3.54
RARA-AS1-201ENST00000581080 CEP170Q5SW79 1584 aa37.14■■■■□ 3.54
RARA-AS1-201ENST00000581080 CHD1O14646 1710 aa37.13■■■■□ 3.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 IQGAP2Q13576 1575 aa37.12■■■■□ 3.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.11■■■■□ 3.53
RARA-AS1-201ENST00000581080 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.01■■■■□ 3.52
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARAP1Q96P48 1450 aa37■■■■□ 3.51
RARA-AS1-201ENST00000581080 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.95■■■■□ 3.51
RARA-AS1-201ENST00000581080 SAMD9Q5K651 1589 aa36.94■■■■□ 3.5
RARA-AS1-201ENST00000581080 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.93■■■■□ 3.5
RARA-AS1-201ENST00000581080 P3H3Q8IVL6 736 aa36.91■■■■□ 3.5
RARA-AS1-201ENST00000581080 JPH4Q96JJ6 628 aa36.87■■■■□ 3.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.85■■■■□ 3.49
RARA-AS1-201ENST00000581080 DISP1Q96F81 1524 aa36.79■■■■□ 3.48
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.75■■■■□ 3.47
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIAA0556O60303 1618 aa36.74■■■■□ 3.47
RARA-AS1-201ENST00000581080 FMN1Q68DA7 1419 aa36.7■■■■□ 3.47
RARA-AS1-201ENST00000581080 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.69■■■■□ 3.46
RARA-AS1-201ENST00000581080 SHROOM2Q13796 1616 aa36.68■■■■□ 3.46
RARA-AS1-201ENST00000581080 OSCARQ8IYS5 282 aa36.68■■■■□ 3.46
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
RARA-AS1-201ENST00000581080 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.56■■■■□ 3.44
RARA-AS1-201ENST00000581080 APLP2Q06481 763 aa36.55■■■■□ 3.44
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
RARA-AS1-201ENST00000581080 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.52■■■■□ 3.44
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
RARA-AS1-201ENST00000581080 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.43■■■■□ 3.42
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAP3K1Q13233 1512 aa36.39■■■■□ 3.42
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTPRGP23470 1445 aa36.38■■■■□ 3.41
RARA-AS1-201ENST00000581080 TIAM1Q13009 1591 aa36.33■■■■□ 3.41
RARA-AS1-201ENST00000581080 HECW1Q76N89 1606 aa36.32■■■■□ 3.41
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.32■■■■□ 3.4
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.32■■■■□ 3.4
RARA-AS1-201ENST00000581080 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.26■■■■□ 3.4
RARA-AS1-201ENST00000581080 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.26■■■■□ 3.4
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABCA8O94911 1581 aa36.25■■■■□ 3.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.24■■■■□ 3.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.19■■■■□ 3.38
RARA-AS1-201ENST00000581080 UACAQ9BZF9 1416 aa36.16■■■■□ 3.38
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARID3CA6NKF2 412 aa36.13■■■■□ 3.37
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
RARA-AS1-201ENST00000581080 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.05■■■■□ 3.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABCC2Q92887 1545 aa36.05■■■■□ 3.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARHGEF11O15085 1522 aa36.03■■■■□ 3.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATP10BO94823 1461 aa36.02■■■■□ 3.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.01■■■■□ 3.36
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36■■■■□ 3.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.97■■■■□ 3.35
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.94■■■■□ 3.34
RARA-AS1-201ENST00000581080 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.87■■■■□ 3.33
RARA-AS1-201ENST00000581080 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.87■■■■□ 3.33
RARA-AS1-201ENST00000581080 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
RARA-AS1-201ENST00000581080 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
RARA-AS1-201ENST00000581080 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.86■■■■□ 3.33
RARA-AS1-201ENST00000581080 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
RARA-AS1-201ENST00000581080 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
RARA-AS1-201ENST00000581080 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.83■■■■□ 3.33
RARA-AS1-201ENST00000581080 NCOA2Q15596 1464 aa35.83■■■■□ 3.33
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
RARA-AS1-201ENST00000581080 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.72■■■■□ 3.31
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.67■■■■□ 3.3
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.66■■■■□ 3.3
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIF14Q15058 1648 aa35.65■■■■□ 3.3
RARA-AS1-201ENST00000581080 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.64■■■■□ 3.3
RARA-AS1-201ENST00000581080 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.61■■■■□ 3.29
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.56■■■■□ 3.28
RARA-AS1-201ENST00000581080 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.53■■■■□ 3.28
RARA-AS1-201ENST00000581080 MIA2Q96PC5 1412 aa35.52■■■■□ 3.28
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCNH8Q96L42 1107 aa35.52■■■■□ 3.28
RARA-AS1-201ENST00000581080 ASXL2Q76L83 1435 aa35.52■■■■□ 3.28
RARA-AS1-201ENST00000581080 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.51■■■■□ 3.27
RARA-AS1-201ENST00000581080 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
RARA-AS1-201ENST00000581080 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.46■■■■□ 3.27
RARA-AS1-201ENST00000581080 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.45■■■■□ 3.27
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.44■■■■□ 3.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.41■■■■□ 3.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.4■■■■□ 3.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAPKBP1O60336 1514 aa35.37■■■■□ 3.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 ITGAEP38570 1179 aa35.33■■■■□ 3.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 PREX2Q70Z35 1606 aa35.31■■■■□ 3.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.29■■■■□ 3.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.29■■■■□ 3.24
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