RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577409.1

CNDP2-204, Transcript of carnosine dipeptidase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CNDP2, Length 422 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP2-204ENST00000577409 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.22■■■■□ 3.23
CNDP2-204ENST00000577409 SHROOM2Q13796 1616 aa35.2■■■■□ 3.23
CNDP2-204ENST00000577409 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.19■■■■□ 3.22
CNDP2-204ENST00000577409 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.18■■■■□ 3.22
CNDP2-204ENST00000577409 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
CNDP2-204ENST00000577409 PRXQ9BXM0 1461 aa35.12■■■■□ 3.21
CNDP2-204ENST00000577409 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.11■■■■□ 3.21
CNDP2-204ENST00000577409 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
CNDP2-204ENST00000577409 EEA1Q15075 1411 aa35.02■■■■□ 3.2
CNDP2-204ENST00000577409 IQGAP2Q13576 1575 aa34.91■■■■□ 3.18
CNDP2-204ENST00000577409 DISP1Q96F81 1524 aa34.78■■■■□ 3.16
CNDP2-204ENST00000577409 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.78■■■■□ 3.16
CNDP2-204ENST00000577409 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.76■■■■□ 3.16
CNDP2-204ENST00000577409 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.71■■■■□ 3.15
CNDP2-204ENST00000577409 PTPRGP23470 1445 aa34.71■■■■□ 3.15
CNDP2-204ENST00000577409 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
CNDP2-204ENST00000577409 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.7■■■■□ 3.14
CNDP2-204ENST00000577409 KIF21BO75037 1637 aa34.65■■■■□ 3.14
CNDP2-204ENST00000577409 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.62■■■■□ 3.13
CNDP2-204ENST00000577409 KIAA0556O60303 1618 aa34.61■■■■□ 3.13
CNDP2-204ENST00000577409 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
CNDP2-204ENST00000577409 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.55■■■■□ 3.12
CNDP2-204ENST00000577409 GOLGA3Q08378 1498 aa34.53■■■■□ 3.12
CNDP2-204ENST00000577409 P3H3Q8IVL6 736 aa34.49■■■■□ 3.11
CNDP2-204ENST00000577409 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
CNDP2-204ENST00000577409 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
CNDP2-204ENST00000577409 UACAQ9BZF9 1416 aa34.46■■■■□ 3.11
CNDP2-204ENST00000577409 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.43■■■■□ 3.1
CNDP2-204ENST00000577409 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.4■■■■□ 3.1
CNDP2-204ENST00000577409 SAMD9Q5K651 1589 aa34.38■■■■□ 3.09
CNDP2-204ENST00000577409 ABCC2Q92887 1545 aa34.36■■■■□ 3.09
CNDP2-204ENST00000577409 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.36■■■■□ 3.09
CNDP2-204ENST00000577409 MAPKBP1O60336 1514 aa34.3■■■■□ 3.08
CNDP2-204ENST00000577409 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.28■■■■□ 3.08
CNDP2-204ENST00000577409 ABCA8O94911 1581 aa34.27■■■■□ 3.08
CNDP2-204ENST00000577409 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.25■■■■□ 3.07
CNDP2-204ENST00000577409 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.2■■■■□ 3.06
CNDP2-204ENST00000577409 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.19■■■■□ 3.06
CNDP2-204ENST00000577409 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.17■■■■□ 3.06
CNDP2-204ENST00000577409 ASXL2Q76L83 1435 aa34.17■■■■□ 3.06
CNDP2-204ENST00000577409 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.14■■■■□ 3.06
CNDP2-204ENST00000577409 ARID3CA6NKF2 412 aa34.12■■■■□ 3.05
CNDP2-204ENST00000577409 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
CNDP2-204ENST00000577409 DIP2BQ9P265 1576 aa34.09■■■■□ 3.05
CNDP2-204ENST00000577409 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.08■■■■□ 3.05
CNDP2-204ENST00000577409 ATP10BO94823 1461 aa34.05■■■■□ 3.04
CNDP2-204ENST00000577409 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.02■■■■□ 3.04
CNDP2-204ENST00000577409 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
CNDP2-204ENST00000577409 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.98■■■■□ 3.03
CNDP2-204ENST00000577409 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
CNDP2-204ENST00000577409 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.96■■■■□ 3.03
CNDP2-204ENST00000577409 CLIP1P30622 1438 aa33.91■■■■□ 3.02
CNDP2-204ENST00000577409 FMN1Q68DA7 1419 aa33.91■■■■□ 3.02
CNDP2-204ENST00000577409 GLI2P10070 1586 aa33.9■■■■□ 3.02
CNDP2-204ENST00000577409 KCNH8Q96L42 1107 aa33.89■■■■□ 3.02
CNDP2-204ENST00000577409 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
CNDP2-204ENST00000577409 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
CNDP2-204ENST00000577409 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
CNDP2-204ENST00000577409 CEP162Q5TB80 1403 aa33.77■■■■□ 3
CNDP2-204ENST00000577409 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.76■■■■□ 3
CNDP2-204ENST00000577409 TSPOAP1O95153 1857 aa33.73■■■□□ 2.99
CNDP2-204ENST00000577409 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.72■■■□□ 2.99
CNDP2-204ENST00000577409 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.71■■■□□ 2.99
CNDP2-204ENST00000577409 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
CNDP2-204ENST00000577409 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.7■■■□□ 2.98
CNDP2-204ENST00000577409 HECW1Q76N89 1606 aa33.68■■■□□ 2.98
CNDP2-204ENST00000577409 CD109Q6YHK3 1445 aa33.68■■■□□ 2.98
CNDP2-204ENST00000577409 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
CNDP2-204ENST00000577409 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.58■■■□□ 2.97
CNDP2-204ENST00000577409 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.57■■■□□ 2.96
CNDP2-204ENST00000577409 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.56■■■□□ 2.96
CNDP2-204ENST00000577409 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.56■■■□□ 2.96
CNDP2-204ENST00000577409 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.56■■■□□ 2.96
CNDP2-204ENST00000577409 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.56■■■□□ 2.96
CNDP2-204ENST00000577409 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
CNDP2-204ENST00000577409 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
CNDP2-204ENST00000577409 KDM6BO15054 1643 aa33.5■■■□□ 2.95
CNDP2-204ENST00000577409 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.48■■■□□ 2.95
CNDP2-204ENST00000577409 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.48■■■□□ 2.95
CNDP2-204ENST00000577409 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
CNDP2-204ENST00000577409 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.42■■■□□ 2.94
CNDP2-204ENST00000577409 KIF14Q15058 1648 aa33.37■■■□□ 2.93
CNDP2-204ENST00000577409 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.34■■■□□ 2.93
CNDP2-204ENST00000577409 NEO1Q92859 1461 aa33.31■■■□□ 2.92
CNDP2-204ENST00000577409 PLCH2O75038 1416 aa33.3■■■□□ 2.92
CNDP2-204ENST00000577409 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.29■■■□□ 2.92
CNDP2-204ENST00000577409 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.29■■■□□ 2.92
CNDP2-204ENST00000577409 FANCAO15360 1455 aa33.26■■■□□ 2.92
CNDP2-204ENST00000577409 AKNAQ7Z591 1439 aa33.24■■■□□ 2.91
CNDP2-204ENST00000577409 RAPGEF3O95398 923 aa33.23■■■□□ 2.91
CNDP2-204ENST00000577409 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.2■■■□□ 2.9
CNDP2-204ENST00000577409 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.17■■■□□ 2.9
CNDP2-204ENST00000577409 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.12■■■□□ 2.89
CNDP2-204ENST00000577409 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.11■■■□□ 2.89
CNDP2-204ENST00000577409 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.1■■■□□ 2.89
CNDP2-204ENST00000577409 TIAM1Q13009 1591 aa33.09■■■□□ 2.89
CNDP2-204ENST00000577409 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.09■■■□□ 2.89
CNDP2-204ENST00000577409 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.09■■■□□ 2.89
CNDP2-204ENST00000577409 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
CNDP2-204ENST00000577409 ADGRL1O94910 1474 aa33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms