RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577409.1

CNDP2-204, Transcript of carnosine dipeptidase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CNDP2, Length 422 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP2-204ENST00000577409 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.86■■■■■ 5.73
CNDP2-204ENST00000577409 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.03■■■■■ 4.8
CNDP2-204ENST00000577409 ABCC9O60706 1549 aa44.28■■■■■ 4.68
CNDP2-204ENST00000577409 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.57■■■■■ 4.41
CNDP2-204ENST00000577409 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.44■■■■■ 4.39
CNDP2-204ENST00000577409 NACADO15069 1562 aa42.42■■■■■ 4.38
CNDP2-204ENST00000577409 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
CNDP2-204ENST00000577409 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.18■■■■■ 4.34
CNDP2-204ENST00000577409 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.01■■■■■ 4.32
CNDP2-204ENST00000577409 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.47■■■■■ 4.232e-6■■■■□ 23
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CNDP2-204ENST00000577409 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.28■■■■■ 4.2
CNDP2-204ENST00000577409 SCRIBQ14160 1630 aa41.22■■■■■ 4.19
CNDP2-204ENST00000577409 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.8■■■■■ 4.12
CNDP2-204ENST00000577409 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.7■■■■■ 4.11
CNDP2-204ENST00000577409 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
CNDP2-204ENST00000577409 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.98■■■■□ 3.99
CNDP2-204ENST00000577409 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.75■■■■□ 3.95
CNDP2-204ENST00000577409 SMARCA4P51532 1647 aa39.4■■■■□ 3.9
CNDP2-204ENST00000577409 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
CNDP2-204ENST00000577409 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.28■■■■□ 3.88
CNDP2-204ENST00000577409 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.25■■■■□ 3.87
CNDP2-204ENST00000577409 NCAPD3P42695 1498 aa39.24■■■■□ 3.87
CNDP2-204ENST00000577409 SMARCA2P51531 1590 aa39.12■■■■□ 3.85
CNDP2-204ENST00000577409 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.01■■■■□ 3.84
CNDP2-204ENST00000577409 HMGXB3Q12766 1538 aa38.95■■■■□ 3.83
CNDP2-204ENST00000577409 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
CNDP2-204ENST00000577409 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.82■■■■□ 3.81
CNDP2-204ENST00000577409 WIZO95785 1651 aa38.75■■■■□ 3.79
CNDP2-204ENST00000577409 NESP48681 1621 aa38.34■■■■□ 3.73
CNDP2-204ENST00000577409 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
CNDP2-204ENST00000577409 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.11■■■■□ 3.69
CNDP2-204ENST00000577409 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.09■■■■□ 3.69
CNDP2-204ENST00000577409 ERCC6Q03468 1493 aa38.09■■■■□ 3.69
CNDP2-204ENST00000577409 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.96■■■■□ 3.67
CNDP2-204ENST00000577409 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.9■■■■□ 3.66
CNDP2-204ENST00000577409 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
CNDP2-204ENST00000577409 CFTRP13569 1480 aa37.87■■■■□ 3.65
CNDP2-204ENST00000577409 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.72■■■■□ 3.63
CNDP2-204ENST00000577409 CUX2O14529 1486 aa37.65■■■■□ 3.62
CNDP2-204ENST00000577409 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.64■■■■□ 3.62
CNDP2-204ENST00000577409 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
CNDP2-204ENST00000577409 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.55■■■■□ 3.6
CNDP2-204ENST00000577409 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.52■■■■□ 3.6
CNDP2-204ENST00000577409 WDR62O43379 1518 aa37.38■■■■□ 3.57
CNDP2-204ENST00000577409 PRDM2Q13029 1718 aa37.33■■■■□ 3.57
CNDP2-204ENST00000577409 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
CNDP2-204ENST00000577409 TOPBP1Q92547 1522 aa37.05■■■■□ 3.52
CNDP2-204ENST00000577409 ABCC8Q09428 1581 aa36.95■■■■□ 3.51
CNDP2-204ENST00000577409 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.95■■■■□ 3.51
CNDP2-204ENST00000577409 CUX1P39880 1505 aa36.8■■■■□ 3.48
CNDP2-204ENST00000577409 IFT140Q96RY7 1462 aa36.78■■■■□ 3.48
CNDP2-204ENST00000577409 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
CNDP2-204ENST00000577409 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
CNDP2-204ENST00000577409 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.65■■■■□ 3.46
CNDP2-204ENST00000577409 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.64■■■■□ 3.46
CNDP2-204ENST00000577409 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.63■■■■□ 3.45
CNDP2-204ENST00000577409 SOGA1O94964 1423 aa36.6■■■■□ 3.45
CNDP2-204ENST00000577409 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
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CNDP2-204ENST00000577409 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.5■■■■□ 3.43
CNDP2-204ENST00000577409 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
CNDP2-204ENST00000577409 SYNJ1O43426 1573 aa36.44■■■■□ 3.42
CNDP2-204ENST00000577409 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
CNDP2-204ENST00000577409 TOP2BQ02880 1626 aa36.4■■■■□ 3.42
CNDP2-204ENST00000577409 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.35■■■■□ 3.41
CNDP2-204ENST00000577409 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.29■■■■□ 3.4
CNDP2-204ENST00000577409 WDR97A6NE52 1622 aa36.23■■■■□ 3.39
CNDP2-204ENST00000577409 OSCARQ8IYS5 282 aa36.18■■■■□ 3.38
CNDP2-204ENST00000577409 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.15■■■■□ 3.38
CNDP2-204ENST00000577409 GRIN2BQ13224 1484 aa36.13■■■■□ 3.37
CNDP2-204ENST00000577409 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.11■■■■□ 3.37
CNDP2-204ENST00000577409 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.08■■■■□ 3.37
CNDP2-204ENST00000577409 FBLN2P98095 1184 aa36.05■■■■□ 3.36
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CNDP2-204ENST00000577409 PBRM1Q86U86 1689 aa35.94■■■■□ 3.34
CNDP2-204ENST00000577409 CHD1O14646 1710 aa35.92■■■■□ 3.34
CNDP2-204ENST00000577409 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
CNDP2-204ENST00000577409 SYNJ2O15056 1496 aa35.89■■■■□ 3.34
CNDP2-204ENST00000577409 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.79■■■■□ 3.32
CNDP2-204ENST00000577409 KIF27Q86VH2 1401 aa35.75■■■■□ 3.31
CNDP2-204ENST00000577409 ADAMTS12P58397 1594 aa35.75■■■■□ 3.31
CNDP2-204ENST00000577409 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.74■■■■□ 3.31
CNDP2-204ENST00000577409 TRIM41Q8WV44 630 aa35.72■■■■□ 3.31
CNDP2-204ENST00000577409 IGF1RP08069 1367 aa35.72■■■■□ 3.31
CNDP2-204ENST00000577409 GRIN2AQ12879 1464 aa35.67■■■■□ 3.3
CNDP2-204ENST00000577409 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.62■■■■□ 3.29
CNDP2-204ENST00000577409 ARHGEF11O15085 1522 aa35.57■■■■□ 3.28
CNDP2-204ENST00000577409 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.56■■■■□ 3.28
CNDP2-204ENST00000577409 NUP160Q12769 1436 aa35.55■■■■□ 3.28
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CNDP2-204ENST00000577409 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.53■■■■□ 3.28
CNDP2-204ENST00000577409 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.53■■■■□ 3.28
CNDP2-204ENST00000577409 CEP170Q5SW79 1584 aa35.5■■■■□ 3.27
CNDP2-204ENST00000577409 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.45■■■■□ 3.27
CNDP2-204ENST00000577409 CUL7Q14999 1698 aa35.4■■■■□ 3.26
CNDP2-204ENST00000577409 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.37■■■■□ 3.25
CNDP2-204ENST00000577409 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.32■■■■□ 3.24
CNDP2-204ENST00000577409 ARAP1Q96P48 1450 aa35.32■■■■□ 3.24
CNDP2-204ENST00000577409 JPH4Q96JJ6 628 aa35.23■■■■□ 3.23
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