RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 JPH4Q96JJ6 628 aa52.14■■■■■ 5.94
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CTDNEP1-206ENST00000571409 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa52■■■■■ 5.92
CTDNEP1-206ENST00000571409 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa51.69■■■■■ 5.87
CTDNEP1-206ENST00000571409 IQGAP2Q13576 1575 aa51.63■■■■■ 5.86
CTDNEP1-206ENST00000571409 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa51.47■■■■■ 5.83
CTDNEP1-206ENST00000571409 ADCY10Q96PN6 1610 aa51.46■■■■■ 5.83
CTDNEP1-206ENST00000571409 PTPRGP23470 1445 aa51.38■■■■■ 5.82
CTDNEP1-206ENST00000571409 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP51.37■■■■■ 5.81
CTDNEP1-206ENST00000571409 TNIKQ9UKE5 1360 aa51.36■■■■■ 5.81
CTDNEP1-206ENST00000571409 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP51.33■■■■■ 5.81
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CTDNEP1-206ENST00000571409 DISP1Q96F81 1524 aa51.32■■■■■ 5.81
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CTDNEP1-206ENST00000571409 KIF13AQ9H1H9 1805 aa51.25■■■■■ 5.8
CTDNEP1-206ENST00000571409 MAPKBP1O60336 1514 aa51.25■■■■■ 5.79
CTDNEP1-206ENST00000571409 KIAA0556O60303 1618 aa51.16■■■■■ 5.78
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CTDNEP1-206ENST00000571409 UACAQ9BZF9 1416 aa51.03■■■■■ 5.76
CTDNEP1-206ENST00000571409 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa51.02■■■■■ 5.76
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CTDNEP1-206ENST00000571409 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP50.8■■■■■ 5.72
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CTDNEP1-206ENST00000571409 PLB1Q6P1J6 1458 aa50.76■■■■■ 5.72
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CTDNEP1-206ENST00000571409 GLI2P10070 1586 aa50.58■■■■■ 5.69
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CTDNEP1-206ENST00000571409 KDM6BO15054 1643 aa50.42■■■■■ 5.66
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CTDNEP1-206ENST00000571409 FHOD3Q2V2M9 1422 aa50.24■■■■■ 5.63
CTDNEP1-206ENST00000571409 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa50.24■■■■■ 5.63
CTDNEP1-206ENST00000571409 ARID3CA6NKF2 412 aa50.23■■■■■ 5.63
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CTDNEP1-206ENST00000571409 EFCAB5A4FU69 1503 aa50.18■■■■■ 5.62
CTDNEP1-206ENST00000571409 KCNH8Q96L42 1107 aa50.17■■■■■ 5.62
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CTDNEP1-206ENST00000571409 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa49.57■■■■■ 5.53
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CTDNEP1-206ENST00000571409 NEO1Q92859 1461 aa49.48■■■■■ 5.51
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CTDNEP1-206ENST00000571409 RICTORQ6R327 1708 aa49.09■■■■■ 5.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa48.94■■■■■ 5.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 SCAPERQ9BY12 1400 aa48.92■■■■■ 5.42
CTDNEP1-206ENST00000571409 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa48.92■■■■■ 5.42
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa48.91■■■■■ 5.42
CTDNEP1-206ENST00000571409 ARHGAP5Q13017 1502 aa48.89■■■■■ 5.42
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