RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569963.1

NAE1-222, Transcript of NEDD8 activating enzyme E1 subunit 1, human

TSL 2

Gene NAE1, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAE1-222	ENST00000569963	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.83	■■■□□ 2.85
NAE1-222	ENST00000569963	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.83	■■■□□ 2.85
NAE1-222	ENST00000569963	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
NAE1-222	ENST00000569963	SHROOM2	Q13796	1616 aa		32.78	■■■□□ 2.84
NAE1-222	ENST00000569963	JPH4	Q96JJ6	628 aa		32.76	■■■□□ 2.83
NAE1-222	ENST00000569963	IQGAP2	Q13576	1575 aa		32.64	■■■□□ 2.82
NAE1-222	ENST00000569963	KIF21B	O75037	1637 aa		32.63	■■■□□ 2.81
NAE1-222	ENST00000569963	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
NAE1-222	ENST00000569963	ARAP1	Q96P48	1450 aa		32.61	■■■□□ 2.81
NAE1-222	ENST00000569963	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.59	■■■□□ 2.81
NAE1-222	ENST00000569963	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.58	■■■□□ 2.81
NAE1-222	ENST00000569963	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.55	■■■□□ 2.8
NAE1-222	ENST00000569963	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		32.51	■■■□□ 2.79
NAE1-222	ENST00000569963	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.47	■■■□□ 2.79
NAE1-222	ENST00000569963	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.45	■■■□□ 2.79
NAE1-222	ENST00000569963	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.41	■■■□□ 2.78
NAE1-222	ENST00000569963	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.35	■■■□□ 2.77
NAE1-222	ENST00000569963	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
NAE1-222	ENST00000569963	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.32	■■■□□ 2.76
NAE1-222	ENST00000569963	PTPRG	P23470	1445 aa		32.3	■■■□□ 2.76
NAE1-222	ENST00000569963	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.29	■■■□□ 2.76
NAE1-222	ENST00000569963	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.21	■■■□□ 2.75
NAE1-222	ENST00000569963	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
NAE1-222	ENST00000569963	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.13	■■■□□ 2.73
NAE1-222	ENST00000569963	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
NAE1-222	ENST00000569963	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.1	■■■□□ 2.73
NAE1-222	ENST00000569963	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.09	■■■□□ 2.73
NAE1-222	ENST00000569963	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.09	■■■□□ 2.73
NAE1-222	ENST00000569963	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.08	■■■□□ 2.73
NAE1-222	ENST00000569963	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.02	■■■□□ 2.72
NAE1-222	ENST00000569963	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.01	■■■□□ 2.72
NAE1-222	ENST00000569963	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		31.99	■■■□□ 2.71
NAE1-222	ENST00000569963	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.98	■■■□□ 2.71
NAE1-222	ENST00000569963	ABCA8	O94911	1581 aa		31.98	■■■□□ 2.71
NAE1-222	ENST00000569963	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		31.97	■■■□□ 2.71
NAE1-222	ENST00000569963	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.94	■■■□□ 2.7
NAE1-222	ENST00000569963	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		31.9	■■■□□ 2.7
NAE1-222	ENST00000569963	MAPKBP1	O60336	1514 aa		31.88	■■■□□ 2.69
NAE1-222	ENST00000569963	CLIP1	P30622	1438 aa		31.87	■■■□□ 2.69
NAE1-222	ENST00000569963	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		31.84	■■■□□ 2.69
NAE1-222	ENST00000569963	FMN1	Q68DA7	1419 aa		31.83	■■■□□ 2.69
NAE1-222	ENST00000569963	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
NAE1-222	ENST00000569963	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
NAE1-222	ENST00000569963	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.77	■■■□□ 2.68
NAE1-222	ENST00000569963	ASXL2	Q76L83	1435 aa		31.73	■■■□□ 2.67
NAE1-222	ENST00000569963	ATP10B	O94823	1461 aa		31.72	■■■□□ 2.67
NAE1-222	ENST00000569963	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
NAE1-222	ENST00000569963	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		31.7	■■■□□ 2.66
NAE1-222	ENST00000569963	ARID3C	A6NKF2	412 aa		31.62	■■■□□ 2.65
NAE1-222	ENST00000569963	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.62	■■■□□ 2.65
NAE1-222	ENST00000569963	DIP2B	Q9P265	1576 aa		31.62	■■■□□ 2.65
NAE1-222	ENST00000569963	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		31.61	■■■□□ 2.65
NAE1-222	ENST00000569963	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.61	■■■□□ 2.65
NAE1-222	ENST00000569963	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		31.61	■■■□□ 2.65
NAE1-222	ENST00000569963	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		31.61	■■■□□ 2.65
NAE1-222	ENST00000569963	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
NAE1-222	ENST00000569963	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
NAE1-222	ENST00000569963	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
NAE1-222	ENST00000569963	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
NAE1-222	ENST00000569963	GLI2	P10070	1586 aa		31.55	■■■□□ 2.64
NAE1-222	ENST00000569963	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.53	■■■□□ 2.64
NAE1-222	ENST00000569963	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
NAE1-222	ENST00000569963	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		31.5	■■■□□ 2.63
NAE1-222	ENST00000569963	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
NAE1-222	ENST00000569963	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.46	■■■□□ 2.63
NAE1-222	ENST00000569963	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.46	■■■□□ 2.63
NAE1-222	ENST00000569963	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
NAE1-222	ENST00000569963	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.44	■■■□□ 2.62
NAE1-222	ENST00000569963	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.4	■■■□□ 2.62
NAE1-222	ENST00000569963	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.38	■■■□□ 2.61
NAE1-222	ENST00000569963	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		31.34	■■■□□ 2.61
NAE1-222	ENST00000569963	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.32	■■■□□ 2.6
NAE1-222	ENST00000569963	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
NAE1-222	ENST00000569963	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.31	■■■□□ 2.6
NAE1-222	ENST00000569963	TSPOAP1	O95153	1857 aa		31.29	■■■□□ 2.6
NAE1-222	ENST00000569963	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.6
NAE1-222	ENST00000569963	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		31.26	■■■□□ 2.59
NAE1-222	ENST00000569963	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		31.24	■■■□□ 2.59
NAE1-222	ENST00000569963	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.23	■■■□□ 2.59
NAE1-222	ENST00000569963	KIF14	Q15058	1648 aa		31.18	■■■□□ 2.58
NAE1-222	ENST00000569963	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.16	■■■□□ 2.58
NAE1-222	ENST00000569963	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.14	■■■□□ 2.58
NAE1-222	ENST00000569963	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.14	■■■□□ 2.58
NAE1-222	ENST00000569963	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.13	■■■□□ 2.57
NAE1-222	ENST00000569963	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		31.09	■■■□□ 2.57
NAE1-222	ENST00000569963	PLCH2	O75038	1416 aa		31.08	■■■□□ 2.57
NAE1-222	ENST00000569963	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.08	■■■□□ 2.57
NAE1-222	ENST00000569963	NEO1	Q92859	1461 aa		31.06	■■■□□ 2.56
NAE1-222	ENST00000569963	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.05	■■■□□ 2.56
NAE1-222	ENST00000569963	APLP2	Q06481	763 aa		31.04	■■■□□ 2.56
NAE1-222	ENST00000569963	KDM6B	O15054	1643 aa		31.04	■■■□□ 2.56
NAE1-222	ENST00000569963	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.03	■■■□□ 2.56
NAE1-222	ENST00000569963	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.01	■■■□□ 2.56
NAE1-222	ENST00000569963	FANCA	O15360	1455 aa		31	■■■□□ 2.55
NAE1-222	ENST00000569963	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31	■■■□□ 2.55
NAE1-222	ENST00000569963	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	30.98	■■■□□ 2.55
NAE1-222	ENST00000569963	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		30.97	■■■□□ 2.55
NAE1-222	ENST00000569963	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	30.95	■■■□□ 2.55
NAE1-222	ENST00000569963	AKNA	Q7Z591	1439 aa		30.95	■■■□□ 2.54
NAE1-222	ENST00000569963	PREX2	Q70Z35	1606 aa		30.93	■■■□□ 2.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms