RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568721.1

KCTD13-208, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 13, humanhuman

TSL 2

Gene KCTD13, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13-208ENST00000568721 JPH4Q96JJ6 628 aa37.4■■■■□ 3.58
KCTD13-208ENST00000568721 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.39■■■■□ 3.58
KCTD13-208ENST00000568721 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.34■■■■□ 3.57
KCTD13-208ENST00000568721 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
KCTD13-208ENST00000568721 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.29■■■■□ 3.56
KCTD13-208ENST00000568721 PRXQ9BXM0 1461 aa37.23■■■■□ 3.55
KCTD13-208ENST00000568721 IQGAP2Q13576 1575 aa37.16■■■■□ 3.54
KCTD13-208ENST00000568721 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.13■■■■□ 3.53
KCTD13-208ENST00000568721 EEA1Q15075 1411 aa37.1■■■■□ 3.53
KCTD13-208ENST00000568721 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.06■■■■□ 3.52
KCTD13-208ENST00000568721 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.98■■■■□ 3.51
KCTD13-208ENST00000568721 DISP1Q96F81 1524 aa36.95■■■■□ 3.51
KCTD13-208ENST00000568721 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
KCTD13-208ENST00000568721 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.93■■■■□ 3.5
KCTD13-208ENST00000568721 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.86■■■■□ 3.49
KCTD13-208ENST00000568721 PTPRGP23470 1445 aa36.84■■■■□ 3.49
KCTD13-208ENST00000568721 KIAA0556O60303 1618 aa36.82■■■■□ 3.49
KCTD13-208ENST00000568721 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.82■■■■□ 3.49
KCTD13-208ENST00000568721 KIF21BO75037 1637 aa36.79■■■■□ 3.48
KCTD13-208ENST00000568721 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
KCTD13-208ENST00000568721 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
KCTD13-208ENST00000568721 GOLGA3Q08378 1498 aa36.68■■■■□ 3.46
KCTD13-208ENST00000568721 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.61■■■■□ 3.45
KCTD13-208ENST00000568721 UACAQ9BZF9 1416 aa36.6■■■■□ 3.45
KCTD13-208ENST00000568721 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.58■■■■□ 3.45
KCTD13-208ENST00000568721 MAPKBP1O60336 1514 aa36.58■■■■□ 3.45
KCTD13-208ENST00000568721 SAMD9Q5K651 1589 aa36.57■■■■□ 3.44
KCTD13-208ENST00000568721 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.55■■■■□ 3.44
KCTD13-208ENST00000568721 ABCC2Q92887 1545 aa36.54■■■■□ 3.44
KCTD13-208ENST00000568721 P3H3Q8IVL6 736 aa36.47■■■■□ 3.43
KCTD13-208ENST00000568721 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.47■■■■□ 3.43
KCTD13-208ENST00000568721 ABCA8O94911 1581 aa36.46■■■■□ 3.43
KCTD13-208ENST00000568721 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.45■■■■□ 3.43
KCTD13-208ENST00000568721 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.44■■■■□ 3.42
KCTD13-208ENST00000568721 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.43■■■■□ 3.42
KCTD13-208ENST00000568721 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
KCTD13-208ENST00000568721 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
KCTD13-208ENST00000568721 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
KCTD13-208ENST00000568721 DIP2BQ9P265 1576 aa36.38■■■■□ 3.41
KCTD13-208ENST00000568721 ASXL2Q76L83 1435 aa36.33■■■■□ 3.41
KCTD13-208ENST00000568721 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.31■■■■□ 3.4
KCTD13-208ENST00000568721 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.31■■■■□ 3.4
KCTD13-208ENST00000568721 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.29■■■■□ 3.4
KCTD13-208ENST00000568721 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.22■■■■□ 3.39
KCTD13-208ENST00000568721 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.18■■■■□ 3.38
KCTD13-208ENST00000568721 GLI2P10070 1586 aa36.17■■■■□ 3.38
KCTD13-208ENST00000568721 ATP10BO94823 1461 aa36.15■■■■□ 3.38
KCTD13-208ENST00000568721 TSPOAP1O95153 1857 aa36.14■■■■□ 3.38
KCTD13-208ENST00000568721 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.38
KCTD13-208ENST00000568721 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.11■■■■□ 3.37
KCTD13-208ENST00000568721 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
KCTD13-208ENST00000568721 ARID3CA6NKF2 412 aa36.06■■■■□ 3.36
KCTD13-208ENST00000568721 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
KCTD13-208ENST00000568721 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.02■■■■□ 3.36
KCTD13-208ENST00000568721 FMN1Q68DA7 1419 aa35.95■■■■□ 3.35
KCTD13-208ENST00000568721 KCNH8Q96L42 1107 aa35.93■■■■□ 3.34
KCTD13-208ENST00000568721 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.88■■■■□ 3.33
KCTD13-208ENST00000568721 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
KCTD13-208ENST00000568721 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
KCTD13-208ENST00000568721 CLIP1P30622 1438 aa35.84■■■■□ 3.33
KCTD13-208ENST00000568721 HECW1Q76N89 1606 aa35.82■■■■□ 3.32
KCTD13-208ENST00000568721 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
KCTD13-208ENST00000568721 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.81■■■■□ 3.32
KCTD13-208ENST00000568721 CD109Q6YHK3 1445 aa35.79■■■■□ 3.32
KCTD13-208ENST00000568721 KDM6BO15054 1643 aa35.79■■■■□ 3.32
KCTD13-208ENST00000568721 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.78■■■■□ 3.32
KCTD13-208ENST00000568721 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.78■■■■□ 3.32
KCTD13-208ENST00000568721 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.76■■■■□ 3.31
KCTD13-208ENST00000568721 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.75■■■■□ 3.31
KCTD13-208ENST00000568721 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.74■■■■□ 3.31
KCTD13-208ENST00000568721 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
KCTD13-208ENST00000568721 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
KCTD13-208ENST00000568721 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.71■■■■□ 3.31
KCTD13-208ENST00000568721 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
KCTD13-208ENST00000568721 CEP162Q5TB80 1403 aa35.67■■■■□ 3.3
KCTD13-208ENST00000568721 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.6■■■■□ 3.29
KCTD13-208ENST00000568721 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.59■■■■□ 3.29
KCTD13-208ENST00000568721 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.55■■■■□ 3.28
KCTD13-208ENST00000568721 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.54■■■■□ 3.28
KCTD13-208ENST00000568721 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
KCTD13-208ENST00000568721 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
KCTD13-208ENST00000568721 KIF14Q15058 1648 aa35.48■■■■□ 3.27
KCTD13-208ENST00000568721 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.47■■■■□ 3.27
KCTD13-208ENST00000568721 NEO1Q92859 1461 aa35.44■■■■□ 3.26
KCTD13-208ENST00000568721 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.43■■■■□ 3.26
KCTD13-208ENST00000568721 PLCH2O75038 1416 aa35.37■■■■□ 3.25
KCTD13-208ENST00000568721 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.37■■■■□ 3.25
KCTD13-208ENST00000568721 FANCAO15360 1455 aa35.35■■■■□ 3.25
KCTD13-208ENST00000568721 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.32■■■■□ 3.24
KCTD13-208ENST00000568721 AKNAQ7Z591 1439 aa35.31■■■■□ 3.24
KCTD13-208ENST00000568721 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.27■■■■□ 3.24
KCTD13-208ENST00000568721 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.26■■■■□ 3.24
KCTD13-208ENST00000568721 RAPGEF3O95398 923 aa35.26■■■■□ 3.24
KCTD13-208ENST00000568721 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.25■■■■□ 3.23
KCTD13-208ENST00000568721 RICTORQ6R327 1708 aa35.24■■■■□ 3.23
KCTD13-208ENST00000568721 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.21■■■■□ 3.23
KCTD13-208ENST00000568721 PREX2Q70Z35 1606 aa35.18■■■■□ 3.22
KCTD13-208ENST00000568721 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
KCTD13-208ENST00000568721 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.18■■■■□ 3.22
KCTD13-208ENST00000568721 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms