RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568721.1

KCTD13-208, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 13, humanhuman

TSL 2

Gene KCTD13, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13-208ENST00000568721 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.05■■■■■ 6.24
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KCTD13-208ENST00000568721 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.93■■■■■ 4.78
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KCTD13-208ENST00000568721 SCRIBQ14160 1630 aa43.84■■■■■ 4.61
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KCTD13-208ENST00000568721 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.67■■■■■ 4.42
KCTD13-208ENST00000568721 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.34■■■■■ 4.37
KCTD13-208ENST00000568721 SMARCA4P51532 1647 aa41.96■■■■■ 4.31
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KCTD13-208ENST00000568721 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.67■■■■■ 4.26
KCTD13-208ENST00000568721 SMARCA2P51531 1590 aa41.65■■■■■ 4.26
KCTD13-208ENST00000568721 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.58■■■■■ 4.25
KCTD13-208ENST00000568721 HMGXB3Q12766 1538 aa41.51■■■■■ 4.24
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KCTD13-208ENST00000568721 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.34■■■■■ 4.05
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KCTD13-208ENST00000568721 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.28■■■■■ 4.04
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KCTD13-208ENST00000568721 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
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KCTD13-208ENST00000568721 PRDM2Q13029 1718 aa40.02■■■■■ 4
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KCTD13-208ENST00000568721 IFT140Q96RY7 1462 aa39.13■■■■□ 3.85
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KCTD13-208ENST00000568721 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.9■■■■□ 3.82
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KCTD13-208ENST00000568721 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.74■■■■□ 3.79
KCTD13-208ENST00000568721 TOP2BQ02880 1626 aa38.72■■■■□ 3.79
KCTD13-208ENST00000568721 SYNJ1O43426 1573 aa38.71■■■■□ 3.79
KCTD13-208ENST00000568721 WDR97A6NE52 1622 aa38.7■■■■□ 3.79
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KCTD13-208ENST00000568721 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.45■■■■□ 3.75
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KCTD13-208ENST00000568721 GRIN2BQ13224 1484 aa38.41■■■■□ 3.74
KCTD13-208ENST00000568721 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.41■■■■□ 3.74
KCTD13-208ENST00000568721 PBRM1Q86U86 1689 aa38.41■■■■□ 3.74
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KCTD13-208ENST00000568721 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.08■■■■□ 3.69
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KCTD13-208ENST00000568721 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.98■■■■□ 3.67
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KCTD13-208ENST00000568721 ARHGEF11O15085 1522 aa37.93■■■■□ 3.66
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KCTD13-208ENST00000568721 NUP160Q12769 1436 aa37.8■■■■□ 3.64
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KCTD13-208ENST00000568721 TRIM41Q8WV44 630 aa37.73■■■■□ 3.63
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KCTD13-208ENST00000568721 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.67■■■■□ 3.62
KCTD13-208ENST00000568721 ARAP1Q96P48 1450 aa37.64■■■■□ 3.62
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KCTD13-208ENST00000568721 SHROOM2Q13796 1616 aa37.57■■■■□ 3.6
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KCTD13-208ENST00000568721 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.5■■■■□ 3.59
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