RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
PPP4C-212ENST00000567828 JPH4Q96JJ6 628 aa39.31■■■■□ 3.88
PPP4C-212ENST00000567828 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.21■■■■□ 3.87
PPP4C-212ENST00000567828 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.2■■■■□ 3.87
PPP4C-212ENST00000567828 IQGAP2Q13576 1575 aa38.98■■■■□ 3.83
PPP4C-212ENST00000567828 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.97■■■■□ 3.83
PPP4C-212ENST00000567828 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.97■■■■□ 3.83
PPP4C-212ENST00000567828 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.91■■■■□ 3.82
PPP4C-212ENST00000567828 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.8■■■■□ 3.8
PPP4C-212ENST00000567828 MAPKBP1O60336 1514 aa38.79■■■■□ 3.8
PPP4C-212ENST00000567828 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.76■■■■□ 3.8
PPP4C-212ENST00000567828 PTPRGP23470 1445 aa38.76■■■■□ 3.8
PPP4C-212ENST00000567828 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.76■■■■□ 3.8
PPP4C-212ENST00000567828 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.73■■■■□ 3.79
PPP4C-212ENST00000567828 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
PPP4C-212ENST00000567828 DISP1Q96F81 1524 aa38.72■■■■□ 3.79
PPP4C-212ENST00000567828 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.69■■■■□ 3.78
PPP4C-212ENST00000567828 DIP2BQ9P265 1576 aa38.68■■■■□ 3.78
PPP4C-212ENST00000567828 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.67■■■■□ 3.78
PPP4C-212ENST00000567828 KIAA0556O60303 1618 aa38.63■■■■□ 3.78
PPP4C-212ENST00000567828 PRXQ9BXM0 1461 aa38.59■■■■□ 3.77
PPP4C-212ENST00000567828 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.58■■■■□ 3.77
PPP4C-212ENST00000567828 ABCC2Q92887 1545 aa38.56■■■■□ 3.76
PPP4C-212ENST00000567828 TSPOAP1O95153 1857 aa38.52■■■■□ 3.76
PPP4C-212ENST00000567828 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.51■■■■□ 3.76
PPP4C-212ENST00000567828 UACAQ9BZF9 1416 aa38.49■■■■□ 3.75
PPP4C-212ENST00000567828 ASXL2Q76L83 1435 aa38.38■■■■□ 3.74
PPP4C-212ENST00000567828 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.38■■■■□ 3.74
PPP4C-212ENST00000567828 GOLGA3Q08378 1498 aa38.37■■■■□ 3.73
PPP4C-212ENST00000567828 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.35■■■■□ 3.73
PPP4C-212ENST00000567828 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.34■■■■□ 3.73
PPP4C-212ENST00000567828 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.32■■■■□ 3.72
PPP4C-212ENST00000567828 GLI2P10070 1586 aa38.26■■■■□ 3.72
PPP4C-212ENST00000567828 KDM6BO15054 1643 aa38.25■■■■□ 3.71
PPP4C-212ENST00000567828 EEA1Q15075 1411 aa38.25■■■■□ 3.71
PPP4C-212ENST00000567828 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
PPP4C-212ENST00000567828 ABCA8O94911 1581 aa38.22■■■■□ 3.71
PPP4C-212ENST00000567828 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.17■■■■□ 3.7
PPP4C-212ENST00000567828 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.14■■■■□ 3.7
PPP4C-212ENST00000567828 SAMD9Q5K651 1589 aa38.13■■■■□ 3.69
PPP4C-212ENST00000567828 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
PPP4C-212ENST00000567828 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.09■■■■□ 3.69
PPP4C-212ENST00000567828 P3H3Q8IVL6 736 aa38.08■■■■□ 3.69
PPP4C-212ENST00000567828 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.68
PPP4C-212ENST00000567828 KIF21BO75037 1637 aa38.04■■■■□ 3.68
PPP4C-212ENST00000567828 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.95■■■■□ 3.67
PPP4C-212ENST00000567828 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.92■■■■□ 3.66
PPP4C-212ENST00000567828 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.92■■■■□ 3.66
PPP4C-212ENST00000567828 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
PPP4C-212ENST00000567828 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.9■■■■□ 3.66
PPP4C-212ENST00000567828 ARID3CA6NKF2 412 aa37.88■■■■□ 3.65
PPP4C-212ENST00000567828 ATP10BO94823 1461 aa37.85■■■■□ 3.65
PPP4C-212ENST00000567828 KCNH8Q96L42 1107 aa37.84■■■■□ 3.65
PPP4C-212ENST00000567828 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.84■■■■□ 3.65
PPP4C-212ENST00000567828 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
PPP4C-212ENST00000567828 CD109Q6YHK3 1445 aa37.78■■■■□ 3.64
PPP4C-212ENST00000567828 EFCAB5A4FU69 1503 aa37.77■■■■□ 3.64
PPP4C-212ENST00000567828 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.75■■■■□ 3.63
PPP4C-212ENST00000567828 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.74■■■■□ 3.63
PPP4C-212ENST00000567828 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
PPP4C-212ENST00000567828 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.67■■■■□ 3.62
PPP4C-212ENST00000567828 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
PPP4C-212ENST00000567828 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
PPP4C-212ENST00000567828 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
PPP4C-212ENST00000567828 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.6■■■■□ 3.61
PPP4C-212ENST00000567828 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.48■■■■□ 3.59
PPP4C-212ENST00000567828 ADGRL1O94910 1474 aa37.46■■■■□ 3.59
PPP4C-212ENST00000567828 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.45■■■■□ 3.59
PPP4C-212ENST00000567828 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
PPP4C-212ENST00000567828 HECW1Q76N89 1606 aa37.39■■■■□ 3.58
PPP4C-212ENST00000567828 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.39■■■■□ 3.58
PPP4C-212ENST00000567828 FMN1Q68DA7 1419 aa37.37■■■■□ 3.57
PPP4C-212ENST00000567828 NEO1Q92859 1461 aa37.35■■■■□ 3.57
PPP4C-212ENST00000567828 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.34■■■■□ 3.571e-10■■□□□ 13.3
PPP4C-212ENST00000567828 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.34■■■■□ 3.57
PPP4C-212ENST00000567828 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.32■■■■□ 3.57
PPP4C-212ENST00000567828 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.29■■■■□ 3.56
PPP4C-212ENST00000567828 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
PPP4C-212ENST00000567828 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.26■■■■□ 3.56
PPP4C-212ENST00000567828 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.25■■■■□ 3.55
PPP4C-212ENST00000567828 RAPGEF3O95398 923 aa37.21■■■■□ 3.55
PPP4C-212ENST00000567828 FANCAO15360 1455 aa37.19■■■■□ 3.54
PPP4C-212ENST00000567828 RICTORQ6R327 1708 aa37.19■■■■□ 3.54
PPP4C-212ENST00000567828 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
PPP4C-212ENST00000567828 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.13■■■■□ 3.54
PPP4C-212ENST00000567828 AKNAQ7Z591 1439 aa37.13■■■■□ 3.53
PPP4C-212ENST00000567828 KIF14Q15058 1648 aa37.13■■■■□ 3.53
PPP4C-212ENST00000567828 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
PPP4C-212ENST00000567828 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
PPP4C-212ENST00000567828 PLCH2O75038 1416 aa37.03■■■■□ 3.52
PPP4C-212ENST00000567828 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.03■■■■□ 3.52
PPP4C-212ENST00000567828 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
PPP4C-212ENST00000567828 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.02■■■■□ 3.52
PPP4C-212ENST00000567828 CLIP1P30622 1438 aa36.99■■■■□ 3.51
PPP4C-212ENST00000567828 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.97■■■■□ 3.51
PPP4C-212ENST00000567828 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.97■■■■□ 3.51
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.97■■■■□ 3.51
PPP4C-212ENST00000567828 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.96■■■■□ 3.51
PPP4C-212ENST00000567828 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.94■■■■□ 3.5
PPP4C-212ENST00000567828 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.9■■■■□ 3.5
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