RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567530.5

BCKDK-208, Transcript of branched chain ketoacid dehydrogenase kinase, human

TSL 5

Gene BCKDK, Length 1,796 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BCKDK-208	ENST00000567530	FBLN2	P98095	1184 aa		33.38	■■■□□ 2.93
BCKDK-208	ENST00000567530	CHD1	O14646	1710 aa		33.33	■■■□□ 2.93
BCKDK-208	ENST00000567530	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33.33	■■■□□ 2.93
BCKDK-208	ENST00000567530	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.31	■■■□□ 2.92
BCKDK-208	ENST00000567530	NUP160	Q12769	1436 aa		33.31	■■■□□ 2.92
BCKDK-208	ENST00000567530	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.31	■■■□□ 2.92
BCKDK-208	ENST00000567530	CEP170	Q5SW79	1584 aa		33.3	■■■□□ 2.92
BCKDK-208	ENST00000567530	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		33.26	■■■□□ 2.92
BCKDK-208	ENST00000567530	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.25	■■■□□ 2.91
BCKDK-208	ENST00000567530	ARAP1	Q96P48	1450 aa		33.18	■■■□□ 2.9
BCKDK-208	ENST00000567530	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.16	■■■□□ 2.9
BCKDK-208	ENST00000567530	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.16	■■■□□ 2.9
BCKDK-208	ENST00000567530	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.13	■■■□□ 2.89
BCKDK-208	ENST00000567530	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.01	■■■□□ 2.87
BCKDK-208	ENST00000567530	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.01	■■■□□ 2.87
BCKDK-208	ENST00000567530	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.01	■■■□□ 2.87
BCKDK-208	ENST00000567530	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.97	■■■□□ 2.87
BCKDK-208	ENST00000567530	DISP1	Q96F81	1524 aa		32.97	■■■□□ 2.87
BCKDK-208	ENST00000567530	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.96	■■■□□ 2.87
BCKDK-208	ENST00000567530	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.94	■■■□□ 2.86
BCKDK-208	ENST00000567530	SHROOM2	Q13796	1616 aa		32.93	■■■□□ 2.86
BCKDK-208	ENST00000567530	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		32.92	■■■□□ 2.86
BCKDK-208	ENST00000567530	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.83	■■■□□ 2.85
BCKDK-208	ENST00000567530	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
BCKDK-208	ENST00000567530	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.8	■■■□□ 2.84
BCKDK-208	ENST00000567530	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
BCKDK-208	ENST00000567530	APLP2	Q06481	763 aa		32.79	■■■□□ 2.84
BCKDK-208	ENST00000567530	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.79	■■■□□ 2.84
BCKDK-208	ENST00000567530	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.69	■■■□□ 2.82
BCKDK-208	ENST00000567530	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.64	■■■□□ 2.82
BCKDK-208	ENST00000567530	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.62	■■■□□ 2.81
BCKDK-208	ENST00000567530	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
BCKDK-208	ENST00000567530	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.62	■■■□□ 2.81
BCKDK-208	ENST00000567530	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.61	■■■□□ 2.81
BCKDK-208	ENST00000567530	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.6	■■■□□ 2.81
BCKDK-208	ENST00000567530	PTPRG	P23470	1445 aa		32.59	■■■□□ 2.81
BCKDK-208	ENST00000567530	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
BCKDK-208	ENST00000567530	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
BCKDK-208	ENST00000567530	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.56	■■■□□ 2.8
BCKDK-208	ENST00000567530	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.55	■■■□□ 2.8
BCKDK-208	ENST00000567530	ABCA8	O94911	1581 aa		32.53	■■■□□ 2.8
BCKDK-208	ENST00000567530	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.52	■■■□□ 2.8
BCKDK-208	ENST00000567530	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
BCKDK-208	ENST00000567530	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
BCKDK-208	ENST00000567530	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
BCKDK-208	ENST00000567530	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.46	■■■□□ 2.79
BCKDK-208	ENST00000567530	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.42	■■■□□ 2.78
BCKDK-208	ENST00000567530	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
BCKDK-208	ENST00000567530	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
BCKDK-208	ENST00000567530	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.34	■■■□□ 2.77
BCKDK-208	ENST00000567530	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.32	■■■□□ 2.77
BCKDK-208	ENST00000567530	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.32	■■■□□ 2.76
BCKDK-208	ENST00000567530	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.32	■■■□□ 2.76
BCKDK-208	ENST00000567530	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.28	■■■□□ 2.76
BCKDK-208	ENST00000567530	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
BCKDK-208	ENST00000567530	ATP10B	O94823	1461 aa		32.28	■■■□□ 2.76
BCKDK-208	ENST00000567530	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.27	■■■□□ 2.76
BCKDK-208	ENST00000567530	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.26	■■■□□ 2.75
BCKDK-208	ENST00000567530	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
BCKDK-208	ENST00000567530	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
BCKDK-208	ENST00000567530	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
BCKDK-208	ENST00000567530	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.19	■■■□□ 2.74
BCKDK-208	ENST00000567530	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.16	■■■□□ 2.74
BCKDK-208	ENST00000567530	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.16	■■■□□ 2.74
BCKDK-208	ENST00000567530	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
BCKDK-208	ENST00000567530	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.15	■■■□□ 2.74
BCKDK-208	ENST00000567530	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.15	■■■□□ 2.74
BCKDK-208	ENST00000567530	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.15	■■■□□ 2.74
BCKDK-208	ENST00000567530	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.13	■■■□□ 2.73
BCKDK-208	ENST00000567530	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.12	■■■□□ 2.73
BCKDK-208	ENST00000567530	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
BCKDK-208	ENST00000567530	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.09	■■■□□ 2.73
BCKDK-208	ENST00000567530	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
BCKDK-208	ENST00000567530	KIF14	Q15058	1648 aa		32	■■■□□ 2.71
BCKDK-208	ENST00000567530	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.99	■■■□□ 2.71
BCKDK-208	ENST00000567530	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		31.99	■■■□□ 2.71
BCKDK-208	ENST00000567530	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		31.94	■■■□□ 2.7
BCKDK-208	ENST00000567530	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	31.93	■■■□□ 2.7
BCKDK-208	ENST00000567530	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.92	■■■□□ 2.7
BCKDK-208	ENST00000567530	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	31.88	■■■□□ 2.69
BCKDK-208	ENST00000567530	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.88	■■■□□ 2.69
BCKDK-208	ENST00000567530	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		31.88	■■■□□ 2.69
BCKDK-208	ENST00000567530	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.88	■■■□□ 2.69
BCKDK-208	ENST00000567530	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		31.86	■■■□□ 2.69
BCKDK-208	ENST00000567530	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		31.83	■■■□□ 2.69
BCKDK-208	ENST00000567530	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
BCKDK-208	ENST00000567530	ASXL2	Q76L83	1435 aa		31.81	■■■□□ 2.68
BCKDK-208	ENST00000567530	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.8	■■■□□ 2.68
BCKDK-208	ENST00000567530	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.79	■■■□□ 2.68
BCKDK-208	ENST00000567530	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
BCKDK-208	ENST00000567530	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
BCKDK-208	ENST00000567530	KCNH8	Q96L42	1107 aa		31.76	■■■□□ 2.68
BCKDK-208	ENST00000567530	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.75	■■■□□ 2.67
BCKDK-208	ENST00000567530	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
BCKDK-208	ENST00000567530	MAPKBP1	O60336	1514 aa		31.73	■■■□□ 2.67
BCKDK-208	ENST00000567530	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.72	■■■□□ 2.67
BCKDK-208	ENST00000567530	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.71	■■■□□ 2.67
BCKDK-208	ENST00000567530	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.68	■■■□□ 2.66
BCKDK-208	ENST00000567530	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.66	■■■□□ 2.66
BCKDK-208	ENST00000567530	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.63	■■■□□ 2.65

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