RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567530.5

BCKDK-208, Transcript of branched chain ketoacid dehydrogenase kinase, humanhuman

TSL 5

Gene BCKDK, Length 1,796 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDK-208ENST00000567530 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.52■■■■■ 5.36
BCKDK-208ENST00000567530 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.61■■■■■ 4.41
BCKDK-208ENST00000567530 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
BCKDK-208ENST00000567530 ABCC9O60706 1549 aa40.48■■■■■ 4.07
BCKDK-208ENST00000567530 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.21■■■■■ 4.03
BCKDK-208ENST00000567530 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.06■■■■■ 4
BCKDK-208ENST00000567530 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.92■■■■□ 3.98
BCKDK-208ENST00000567530 NACADO15069 1562 aa39.76■■■■□ 3.96
BCKDK-208ENST00000567530 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.51■■■■□ 3.91
BCKDK-208ENST00000567530 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.1■■■■□ 3.85
BCKDK-208ENST00000567530 SCRIBQ14160 1630 aa38.97■■■■□ 3.83
BCKDK-208ENST00000567530 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.66■■■■□ 3.78
BCKDK-208ENST00000567530 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.26■■■■□ 3.71
BCKDK-208ENST00000567530 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.04■■■■□ 3.68
BCKDK-208ENST00000567530 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.65■■■■□ 3.62
BCKDK-208ENST00000567530 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
BCKDK-208ENST00000567530 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
BCKDK-208ENST00000567530 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
BCKDK-208ENST00000567530 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.42■■■■□ 3.58
BCKDK-208ENST00000567530 SMARCA4P51532 1647 aa37.4■■■■□ 3.58
BCKDK-208ENST00000567530 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
BCKDK-208ENST00000567530 WIZO95785 1651 aa37.1■■■■□ 3.53
BCKDK-208ENST00000567530 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.01■■■■□ 3.52
BCKDK-208ENST00000567530 SMARCA2P51531 1590 aa36.91■■■■□ 3.5
BCKDK-208ENST00000567530 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.86■■■■□ 3.49
BCKDK-208ENST00000567530 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
BCKDK-208ENST00000567530 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.7■■■■□ 3.46
BCKDK-208ENST00000567530 NCAPD3P42695 1498 aa36.66■■■■□ 3.46
BCKDK-208ENST00000567530 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
BCKDK-208ENST00000567530 HMGXB3Q12766 1538 aa36.6■■■■□ 3.45
BCKDK-208ENST00000567530 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.32■■■■□ 3.41
BCKDK-208ENST00000567530 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.02■■■■□ 3.36
BCKDK-208ENST00000567530 CFTRP13569 1480 aa35.71■■■■□ 3.31
BCKDK-208ENST00000567530 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.67■■■■□ 3.3
BCKDK-208ENST00000567530 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.66■■■■□ 3.3
BCKDK-208ENST00000567530 PRDM2Q13029 1718 aa35.59■■■■□ 3.29
BCKDK-208ENST00000567530 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.52■■■■□ 3.28
BCKDK-208ENST00000567530 NESP48681 1621 aa35.4■■■■□ 3.26
BCKDK-208ENST00000567530 ABCC8Q09428 1581 aa35.38■■■■□ 3.25
BCKDK-208ENST00000567530 TRIM41Q8WV44 630 aa35.31■■■■□ 3.24
BCKDK-208ENST00000567530 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.27■■■■□ 3.24
BCKDK-208ENST00000567530 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.26■■■■□ 3.23
BCKDK-208ENST00000567530 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.23■■■■□ 3.23
BCKDK-208ENST00000567530 SYNJ1O43426 1573 aa35.12■■■■□ 3.21
BCKDK-208ENST00000567530 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.1■■■■□ 3.21
BCKDK-208ENST00000567530 TOP2BQ02880 1626 aa35.07■■■■□ 3.21
BCKDK-208ENST00000567530 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.06■■■■□ 3.2
BCKDK-208ENST00000567530 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.05■■■■□ 3.2
BCKDK-208ENST00000567530 CUX1P39880 1505 aa35.03■■■■□ 3.2
BCKDK-208ENST00000567530 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.91■■■■□ 3.18
BCKDK-208ENST00000567530 TOPBP1Q92547 1522 aa34.83■■■■□ 3.17
BCKDK-208ENST00000567530 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
BCKDK-208ENST00000567530 ERCC6Q03468 1493 aa34.81■■■■□ 3.16
BCKDK-208ENST00000567530 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.78■■■■□ 3.16
BCKDK-208ENST00000567530 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.72■■■■□ 3.15
BCKDK-208ENST00000567530 WDR62O43379 1518 aa34.63■■■■□ 3.13
BCKDK-208ENST00000567530 SOGA1O94964 1423 aa34.62■■■■□ 3.13
BCKDK-208ENST00000567530 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
BCKDK-208ENST00000567530 EEA1Q15075 1411 aa34.62■■■■□ 3.13
BCKDK-208ENST00000567530 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
BCKDK-208ENST00000567530 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
BCKDK-208ENST00000567530 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.5■■■■□ 3.11
BCKDK-208ENST00000567530 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.45■■■■□ 3.11
BCKDK-208ENST00000567530 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.45■■■■□ 3.11
BCKDK-208ENST00000567530 KIF27Q86VH2 1401 aa34.44■■■■□ 3.1
BCKDK-208ENST00000567530 CUX2O14529 1486 aa34.4■■■■□ 3.1
BCKDK-208ENST00000567530 WDR97A6NE52 1622 aa34.39■■■■□ 3.1
BCKDK-208ENST00000567530 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.38■■■■□ 3.09
BCKDK-208ENST00000567530 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
BCKDK-208ENST00000567530 IFT140Q96RY7 1462 aa34.31■■■■□ 3.08
BCKDK-208ENST00000567530 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.21■■■■□ 3.07
BCKDK-208ENST00000567530 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.2■■■■□ 3.07
BCKDK-208ENST00000567530 KIF21BO75037 1637 aa34.17■■■■□ 3.06
BCKDK-208ENST00000567530 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
BCKDK-208ENST00000567530 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.14■■■■□ 3.06
BCKDK-208ENST00000567530 IGF1RP08069 1367 aa34.14■■■■□ 3.06
BCKDK-208ENST00000567530 PRXQ9BXM0 1461 aa34.09■■■■□ 3.05
BCKDK-208ENST00000567530 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.06■■■■□ 3.04
BCKDK-208ENST00000567530 GOLGA3Q08378 1498 aa34.06■■■■□ 3.04
BCKDK-208ENST00000567530 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
BCKDK-208ENST00000567530 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.01■■■■□ 3.042e-10■■■■□ 25.5
BCKDK-208ENST00000567530 CUL7Q14999 1698 aa34.01■■■■□ 3.03
BCKDK-208ENST00000567530 PBRM1Q86U86 1689 aa34■■■■□ 3.03
BCKDK-208ENST00000567530 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.99■■■■□ 3.03
BCKDK-208ENST00000567530 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
BCKDK-208ENST00000567530 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.97■■■■□ 3.03
BCKDK-208ENST00000567530 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.96■■■■□ 3.03
BCKDK-208ENST00000567530 GRIN2BQ13224 1484 aa33.95■■■■□ 3.03
BCKDK-208ENST00000567530 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.87■■■■□ 3.01
BCKDK-208ENST00000567530 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
BCKDK-208ENST00000567530 ADAMTS12P58397 1594 aa33.78■■■■□ 3
BCKDK-208ENST00000567530 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.77■■■■□ 3
BCKDK-208ENST00000567530 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
BCKDK-208ENST00000567530 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.73■■■□□ 2.99
BCKDK-208ENST00000567530 CEP162Q5TB80 1403 aa33.61■■■□□ 2.97
BCKDK-208ENST00000567530 SYNJ2O15056 1496 aa33.59■■■□□ 2.97
BCKDK-208ENST00000567530 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.55■■■□□ 2.96
BCKDK-208ENST00000567530 GRIN2AQ12879 1464 aa33.52■■■□□ 2.96
BCKDK-208ENST00000567530 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
BCKDK-208ENST00000567530 CLIP1P30622 1438 aa33.47■■■□□ 2.95
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