RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567441.5

TMEM62-208, Transcript of transmembrane protein 62, human

TSL 3

Gene TMEM62, Length 627 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM62-208	ENST00000567441	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.17	■■■□□ 2.26
TMEM62-208	ENST00000567441	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
TMEM62-208	ENST00000567441	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TMEM62-208	ENST00000567441	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TMEM62-208	ENST00000567441	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TMEM62-208	ENST00000567441	SHROOM2	Q13796	1616 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TMEM62-208	ENST00000567441	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
TMEM62-208	ENST00000567441	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29	■■■□□ 2.23
TMEM62-208	ENST00000567441	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TMEM62-208	ENST00000567441	IQGAP2	Q13576	1575 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TMEM62-208	ENST00000567441	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.23
TMEM62-208	ENST00000567441	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TMEM62-208	ENST00000567441	KIF21B	O75037	1637 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TMEM62-208	ENST00000567441	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TMEM62-208	ENST00000567441	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.77	■■■□□ 2.2
TMEM62-208	ENST00000567441	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TMEM62-208	ENST00000567441	GOLGA3	Q08378	1498 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TMEM62-208	ENST00000567441	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TMEM62-208	ENST00000567441	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TMEM62-208	ENST00000567441	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		28.66	■■■□□ 2.18
TMEM62-208	ENST00000567441	PTPRG	P23470	1445 aa		28.62	■■■□□ 2.17
TMEM62-208	ENST00000567441	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
TMEM62-208	ENST00000567441	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
TMEM62-208	ENST00000567441	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	28.57	■■■□□ 2.16
TMEM62-208	ENST00000567441	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		28.56	■■■□□ 2.16
TMEM62-208	ENST00000567441	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.55	■■■□□ 2.16
TMEM62-208	ENST00000567441	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TMEM62-208	ENST00000567441	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
TMEM62-208	ENST00000567441	MAPKBP1	O60336	1514 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TMEM62-208	ENST00000567441	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TMEM62-208	ENST00000567441	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TMEM62-208	ENST00000567441	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TMEM62-208	ENST00000567441	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		28.41	■■■□□ 2.14
TMEM62-208	ENST00000567441	ABCC2	Q92887	1545 aa		28.4	■■■□□ 2.14
TMEM62-208	ENST00000567441	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.38	■■■□□ 2.13
TMEM62-208	ENST00000567441	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		28.37	■■■□□ 2.13
TMEM62-208	ENST00000567441	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.37	■■■□□ 2.13
TMEM62-208	ENST00000567441	DIP2B	Q9P265	1576 aa		28.37	■■■□□ 2.13
TMEM62-208	ENST00000567441	ABCA8	O94911	1581 aa		28.36	■■■□□ 2.13
TMEM62-208	ENST00000567441	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.33	■■■□□ 2.13
TMEM62-208	ENST00000567441	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TMEM62-208	ENST00000567441	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TMEM62-208	ENST00000567441	TSPOAP1	O95153	1857 aa		28.27	■■■□□ 2.12
TMEM62-208	ENST00000567441	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.25	■■■□□ 2.11
TMEM62-208	ENST00000567441	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
TMEM62-208	ENST00000567441	CLIP1	P30622	1438 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TMEM62-208	ENST00000567441	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TMEM62-208	ENST00000567441	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TMEM62-208	ENST00000567441	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
TMEM62-208	ENST00000567441	ASXL2	Q76L83	1435 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TMEM62-208	ENST00000567441	KDM6B	O15054	1643 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TMEM62-208	ENST00000567441	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TMEM62-208	ENST00000567441	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
TMEM62-208	ENST00000567441	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.11	■■■□□ 2.09
TMEM62-208	ENST00000567441	ATP10B	O94823	1461 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TMEM62-208	ENST00000567441	GLI2	P10070	1586 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TMEM62-208	ENST00000567441	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.06	■■■□□ 2.08
TMEM62-208	ENST00000567441	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.06	■■■□□ 2.08
TMEM62-208	ENST00000567441	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
TMEM62-208	ENST00000567441	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
TMEM62-208	ENST00000567441	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
TMEM62-208	ENST00000567441	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
TMEM62-208	ENST00000567441	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
TMEM62-208	ENST00000567441	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TMEM62-208	ENST00000567441	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
TMEM62-208	ENST00000567441	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
TMEM62-208	ENST00000567441	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TMEM62-208	ENST00000567441	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TMEM62-208	ENST00000567441	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TMEM62-208	ENST00000567441	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TMEM62-208	ENST00000567441	KCNH8	Q96L42	1107 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TMEM62-208	ENST00000567441	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TMEM62-208	ENST00000567441	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TMEM62-208	ENST00000567441	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TMEM62-208	ENST00000567441	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TMEM62-208	ENST00000567441	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TMEM62-208	ENST00000567441	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TMEM62-208	ENST00000567441	CD109	Q6YHK3	1445 aa		27.76	■■■□□ 2.04
TMEM62-208	ENST00000567441	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
TMEM62-208	ENST00000567441	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TMEM62-208	ENST00000567441	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	27.7	■■■□□ 2.02
TMEM62-208	ENST00000567441	KIF14	Q15058	1648 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TMEM62-208	ENST00000567441	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TMEM62-208	ENST00000567441	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
TMEM62-208	ENST00000567441	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TMEM62-208	ENST00000567441	TIAM1	Q13009	1591 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TMEM62-208	ENST00000567441	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.56	■■■□□ 2
TMEM62-208	ENST00000567441	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		27.55	■■■□□ 2
TMEM62-208	ENST00000567441	NEO1	Q92859	1461 aa		27.53	■■■□□ 2
TMEM62-208	ENST00000567441	ADGRL1	O94910	1474 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM62-208	ENST00000567441	PLCH2	O75038	1416 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM62-208	ENST00000567441	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM62-208	ENST00000567441	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		27.52	■■■□□ 2
TMEM62-208	ENST00000567441	MAP3K1	Q13233	1512 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TMEM62-208	ENST00000567441	FANCA	O15360	1455 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TMEM62-208	ENST00000567441	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		27.49	■■□□□ 1.99
TMEM62-208	ENST00000567441	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		27.49	■■□□□ 1.99
TMEM62-208	ENST00000567441	PREX2	Q70Z35	1606 aa		27.45	■■□□□ 1.99
TMEM62-208	ENST00000567441	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		27.44	■■□□□ 1.98
TMEM62-208	ENST00000567441	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		27.44	■■□□□ 1.98

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