RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.16■■■□□ 2.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.15■■■□□ 2.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 JPH4Q96JJ6 628 aa29.14■■■□□ 2.26
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.01■■■□□ 2.23
CCNDBP1-211ENST00000567434 IQGAP2Q13576 1575 aa28.93■■■□□ 2.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.86■■■□□ 2.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRXQ9BXM0 1461 aa28.85■■■□□ 2.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 EEA1Q15075 1411 aa28.79■■■□□ 2.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.78■■■□□ 2.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.76■■■□□ 2.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.75■■■□□ 2.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPRGP23470 1445 aa28.75■■■□□ 2.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.72■■■□□ 2.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 DISP1Q96F81 1524 aa28.72■■■□□ 2.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.72■■■□□ 2.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.67■■■□□ 2.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAPKBP1O60336 1514 aa28.65■■■□□ 2.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA0556O60303 1618 aa28.65■■■□□ 2.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 GOLGA3Q08378 1498 aa28.62■■■□□ 2.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.6■■■□□ 2.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.59■■■□□ 2.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 UACAQ9BZF9 1416 aa28.56■■■□□ 2.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCC2Q92887 1545 aa28.55■■■□□ 2.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.53■■■□□ 2.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.48■■■□□ 2.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF21BO75037 1637 aa28.47■■■□□ 2.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 DIP2BQ9P265 1576 aa28.46■■■□□ 2.15
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.43■■■□□ 2.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.4■■■□□ 2.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 SAMD9Q5K651 1589 aa28.37■■■□□ 2.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASXL2Q76L83 1435 aa28.37■■■□□ 2.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCA8O94911 1581 aa28.35■■■□□ 2.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 GLI2P10070 1586 aa28.28■■■□□ 2.12
CCNDBP1-211ENST00000567434 KDM6BO15054 1643 aa28.25■■■□□ 2.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.24■■■□□ 2.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 P3H3Q8IVL6 736 aa28.24■■■□□ 2.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSPOAP1O95153 1857 aa28.23■■■□□ 2.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.21■■■□□ 2.11
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.15■■■□□ 2.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.13■■■□□ 2.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.12■■■□□ 2.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP10BO94823 1461 aa28.09■■■□□ 2.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.06■■■□□ 2.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.06■■■□□ 2.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.04■■■□□ 2.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.02■■■□□ 2.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.98■■■□□ 2.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNH8Q96L42 1107 aa27.98■■■□□ 2.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARID3CA6NKF2 412 aa27.97■■■□□ 2.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 FMN1Q68DA7 1419 aa27.97■■■□□ 2.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD109Q6YHK3 1445 aa27.96■■■□□ 2.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.96■■■□□ 2.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.89■■■□□ 2.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 HECW1Q76N89 1606 aa27.85■■■□□ 2.05
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.85■■■□□ 2.05
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.04
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADGRL1O94910 1474 aa27.79■■■□□ 2.04
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.78■■■□□ 2.04
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.73■■■□□ 2.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLIP1P30622 1438 aa27.73■■■□□ 2.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 NEO1Q92859 1461 aa27.72■■■□□ 2.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.69■■■□□ 2.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.68■■■□□ 2.021e-13■□□□□ 8.8
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CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.65■■■□□ 2.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.64■■■□□ 2.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.63■■■□□ 2.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.63■■■□□ 2.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.6■■■□□ 2.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 FANCAO15360 1455 aa27.57■■■□□ 2
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF14Q15058 1648 aa27.57■■■□□ 2
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLCH2O75038 1416 aa27.54■■■□□ 2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP162Q5TB80 1403 aa27.54■■■□□ 2
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKNAQ7Z591 1439 aa27.53■■■□□ 2
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.5■■□□□ 1.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.49■■□□□ 1.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.48■■□□□ 1.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAPGEF3O95398 923 aa27.47■■□□□ 1.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 RICTORQ6R327 1708 aa27.44■■□□□ 1.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.43■■□□□ 1.98
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.39■■□□□ 1.98
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