RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565666.5

CMTM3-210, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-210ENST00000565666 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.53■■■□□ 2.64
CMTM3-210ENST00000565666 JPH4Q96JJ6 628 aa31.52■■■□□ 2.64
CMTM3-210ENST00000565666 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.51■■■□□ 2.63
CMTM3-210ENST00000565666 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
CMTM3-210ENST00000565666 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.38■■■□□ 2.61
CMTM3-210ENST00000565666 IQGAP2Q13576 1575 aa31.38■■■□□ 2.61
CMTM3-210ENST00000565666 PRXQ9BXM0 1461 aa31.33■■■□□ 2.61
CMTM3-210ENST00000565666 EEA1Q15075 1411 aa31.33■■■□□ 2.61
CMTM3-210ENST00000565666 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.3■■■□□ 2.6
CMTM3-210ENST00000565666 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.29■■■□□ 2.6
CMTM3-210ENST00000565666 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
CMTM3-210ENST00000565666 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.23■■■□□ 2.59
CMTM3-210ENST00000565666 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.16■■■□□ 2.58
CMTM3-210ENST00000565666 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
CMTM3-210ENST00000565666 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
CMTM3-210ENST00000565666 DISP1Q96F81 1524 aa31.11■■■□□ 2.57
CMTM3-210ENST00000565666 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.11■■■□□ 2.57
CMTM3-210ENST00000565666 PTPRGP23470 1445 aa31.1■■■□□ 2.57
CMTM3-210ENST00000565666 KIAA0556O60303 1618 aa31.07■■■□□ 2.56
CMTM3-210ENST00000565666 KIF21BO75037 1637 aa31.04■■■□□ 2.56
CMTM3-210ENST00000565666 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.04■■■□□ 2.56
CMTM3-210ENST00000565666 GOLGA3Q08378 1498 aa31.01■■■□□ 2.56
CMTM3-210ENST00000565666 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.99■■■□□ 2.55
CMTM3-210ENST00000565666 UACAQ9BZF9 1416 aa30.89■■■□□ 2.53
CMTM3-210ENST00000565666 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.87■■■□□ 2.53
CMTM3-210ENST00000565666 MAPKBP1O60336 1514 aa30.85■■■□□ 2.53
CMTM3-210ENST00000565666 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.85■■■□□ 2.53
CMTM3-210ENST00000565666 ABCC2Q92887 1545 aa30.84■■■□□ 2.53
CMTM3-210ENST00000565666 SAMD9Q5K651 1589 aa30.81■■■□□ 2.52
CMTM3-210ENST00000565666 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
CMTM3-210ENST00000565666 P3H3Q8IVL6 736 aa30.81■■■□□ 2.52
CMTM3-210ENST00000565666 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
CMTM3-210ENST00000565666 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.76■■■□□ 2.51
CMTM3-210ENST00000565666 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.76■■■□□ 2.51
CMTM3-210ENST00000565666 ABCA8O94911 1581 aa30.71■■■□□ 2.51
CMTM3-210ENST00000565666 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.71■■■□□ 2.51
CMTM3-210ENST00000565666 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
CMTM3-210ENST00000565666 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.7■■■□□ 2.51
CMTM3-210ENST00000565666 DIP2BQ9P265 1576 aa30.69■■■□□ 2.5
CMTM3-210ENST00000565666 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.67■■■□□ 2.5
CMTM3-210ENST00000565666 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.67■■■□□ 2.5
CMTM3-210ENST00000565666 ASXL2Q76L83 1435 aa30.65■■■□□ 2.5
CMTM3-210ENST00000565666 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.63■■■□□ 2.49
CMTM3-210ENST00000565666 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.58■■■□□ 2.49
CMTM3-210ENST00000565666 ARID3CA6NKF2 412 aa30.51■■■□□ 2.47
CMTM3-210ENST00000565666 TSPOAP1O95153 1857 aa30.49■■■□□ 2.47
CMTM3-210ENST00000565666 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.49■■■□□ 2.47
CMTM3-210ENST00000565666 GLI2P10070 1586 aa30.48■■■□□ 2.47
CMTM3-210ENST00000565666 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.47■■■□□ 2.47
CMTM3-210ENST00000565666 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
CMTM3-210ENST00000565666 ATP10BO94823 1461 aa30.45■■■□□ 2.47
CMTM3-210ENST00000565666 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
CMTM3-210ENST00000565666 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
CMTM3-210ENST00000565666 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
CMTM3-210ENST00000565666 FMN1Q68DA7 1419 aa30.38■■■□□ 2.45
CMTM3-210ENST00000565666 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.36■■■□□ 2.45
CMTM3-210ENST00000565666 KCNH8Q96L42 1107 aa30.36■■■□□ 2.45
CMTM3-210ENST00000565666 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
CMTM3-210ENST00000565666 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CMTM3-210ENST00000565666 HECW1Q76N89 1606 aa30.29■■■□□ 2.44
CMTM3-210ENST00000565666 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.28■■■□□ 2.44
CMTM3-210ENST00000565666 CLIP1P30622 1438 aa30.28■■■□□ 2.44
CMTM3-210ENST00000565666 KDM6BO15054 1643 aa30.26■■■□□ 2.44
CMTM3-210ENST00000565666 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.24■■■□□ 2.43
CMTM3-210ENST00000565666 CD109Q6YHK3 1445 aa30.22■■■□□ 2.43
CMTM3-210ENST00000565666 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CMTM3-210ENST00000565666 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.2■■■□□ 2.43
CMTM3-210ENST00000565666 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.17■■■□□ 2.42
CMTM3-210ENST00000565666 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
CMTM3-210ENST00000565666 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.14■■■□□ 2.42
CMTM3-210ENST00000565666 CEP162Q5TB80 1403 aa30.12■■■□□ 2.41
CMTM3-210ENST00000565666 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.12■■■□□ 2.41
CMTM3-210ENST00000565666 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.11■■■□□ 2.41
CMTM3-210ENST00000565666 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.1■■■□□ 2.41
CMTM3-210ENST00000565666 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
CMTM3-210ENST00000565666 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.06■■■□□ 2.4
CMTM3-210ENST00000565666 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.04■■■□□ 2.4
CMTM3-210ENST00000565666 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.01■■■□□ 2.43e-7■■■■■ 59
CMTM3-210ENST00000565666 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CMTM3-210ENST00000565666 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.98■■■□□ 2.39
CMTM3-210ENST00000565666 KIF14Q15058 1648 aa29.96■■■□□ 2.39
CMTM3-210ENST00000565666 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CMTM3-210ENST00000565666 NEO1Q92859 1461 aa29.92■■■□□ 2.38
CMTM3-210ENST00000565666 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.9■■■□□ 2.38
CMTM3-210ENST00000565666 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.89■■■□□ 2.38
CMTM3-210ENST00000565666 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.89■■■□□ 2.38
CMTM3-210ENST00000565666 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.87■■■□□ 2.37
CMTM3-210ENST00000565666 FANCAO15360 1455 aa29.86■■■□□ 2.37
CMTM3-210ENST00000565666 PLCH2O75038 1416 aa29.81■■■□□ 2.36
CMTM3-210ENST00000565666 AKNAQ7Z591 1439 aa29.79■■■□□ 2.36
CMTM3-210ENST00000565666 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.75■■■□□ 2.35
CMTM3-210ENST00000565666 RAPGEF3O95398 923 aa29.74■■■□□ 2.35
CMTM3-210ENST00000565666 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.73■■■□□ 2.35
CMTM3-210ENST00000565666 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.73■■■□□ 2.35
CMTM3-210ENST00000565666 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CMTM3-210ENST00000565666 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.72■■■□□ 2.35
CMTM3-210ENST00000565666 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.71■■■□□ 2.35
CMTM3-210ENST00000565666 ADGRL1O94910 1474 aa29.7■■■□□ 2.35
CMTM3-210ENST00000565666 PREX2Q70Z35 1606 aa29.7■■■□□ 2.34
CMTM3-210ENST00000565666 RICTORQ6R327 1708 aa29.68■■■□□ 2.34
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