RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565666.5

CMTM3-210, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-210ENST00000565666 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.52■■■■■ 4.88
CMTM3-210ENST00000565666 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.56■■■■■ 4.08
CMTM3-210ENST00000565666 ABCC9O60706 1549 aa39.76■■■■□ 3.96
CMTM3-210ENST00000565666 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.22■■■■□ 3.71
CMTM3-210ENST00000565666 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.14■■■■□ 3.7
CMTM3-210ENST00000565666 NACADO15069 1562 aa38.12■■■■□ 3.69
CMTM3-210ENST00000565666 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
CMTM3-210ENST00000565666 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.82■■■■□ 3.64
CMTM3-210ENST00000565666 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.62■■■■□ 3.61
CMTM3-210ENST00000565666 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.36■■■■□ 3.57
CMTM3-210ENST00000565666 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.12■■■■□ 3.53
CMTM3-210ENST00000565666 SCRIBQ14160 1630 aa37.02■■■■□ 3.52
CMTM3-210ENST00000565666 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.01■■■■□ 3.52
CMTM3-210ENST00000565666 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.62■■■■□ 3.45
CMTM3-210ENST00000565666 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.49■■■■□ 3.43
CMTM3-210ENST00000565666 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.37
CMTM3-210ENST00000565666 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.97■■■■□ 3.35
CMTM3-210ENST00000565666 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.72■■■■□ 3.31
CMTM3-210ENST00000565666 SMARCA4P51532 1647 aa35.37■■■■□ 3.25
CMTM3-210ENST00000565666 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
CMTM3-210ENST00000565666 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.16■■■■□ 3.22
CMTM3-210ENST00000565666 SMARCA2P51531 1590 aa35.15■■■■□ 3.22
CMTM3-210ENST00000565666 NCAPD3P42695 1498 aa35.14■■■■□ 3.22
CMTM3-210ENST00000565666 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.08■■■■□ 3.21
CMTM3-210ENST00000565666 HMGXB3Q12766 1538 aa35■■■■□ 3.19
CMTM3-210ENST00000565666 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.98■■■■□ 3.19
CMTM3-210ENST00000565666 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
CMTM3-210ENST00000565666 WIZO95785 1651 aa34.73■■■■□ 3.15
CMTM3-210ENST00000565666 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
CMTM3-210ENST00000565666 NESP48681 1621 aa34.37■■■■□ 3.09
CMTM3-210ENST00000565666 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
CMTM3-210ENST00000565666 ERCC6Q03468 1493 aa34.31■■■■□ 3.08
CMTM3-210ENST00000565666 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.28■■■■□ 3.08
CMTM3-210ENST00000565666 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.12■■■■□ 3.05
CMTM3-210ENST00000565666 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.04■■■■□ 3.04
CMTM3-210ENST00000565666 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34■■■■□ 3.03
CMTM3-210ENST00000565666 CUX2O14529 1486 aa33.94■■■■□ 3.02
CMTM3-210ENST00000565666 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.92■■■■□ 3.02
CMTM3-210ENST00000565666 CFTRP13569 1480 aa33.89■■■■□ 3.02
CMTM3-210ENST00000565666 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
CMTM3-210ENST00000565666 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.76■■■■□ 3
CMTM3-210ENST00000565666 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
CMTM3-210ENST00000565666 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.75■■■□□ 2.99
CMTM3-210ENST00000565666 PRDM2Q13029 1718 aa33.73■■■□□ 2.99
CMTM3-210ENST00000565666 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.7■■■□□ 2.99
CMTM3-210ENST00000565666 WDR62O43379 1518 aa33.58■■■□□ 2.97
CMTM3-210ENST00000565666 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
CMTM3-210ENST00000565666 TOPBP1Q92547 1522 aa33.21■■■□□ 2.91
CMTM3-210ENST00000565666 ABCC8Q09428 1581 aa33.21■■■□□ 2.91
CMTM3-210ENST00000565666 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.18■■■□□ 2.9
CMTM3-210ENST00000565666 IFT140Q96RY7 1462 aa33.03■■■□□ 2.88
CMTM3-210ENST00000565666 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.95■■■□□ 2.87
CMTM3-210ENST00000565666 CUX1P39880 1505 aa32.92■■■□□ 2.86
CMTM3-210ENST00000565666 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
CMTM3-210ENST00000565666 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
CMTM3-210ENST00000565666 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
CMTM3-210ENST00000565666 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.85■■■□□ 2.85
CMTM3-210ENST00000565666 SOGA1O94964 1423 aa32.79■■■□□ 2.84
CMTM3-210ENST00000565666 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
CMTM3-210ENST00000565666 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.78■■■□□ 2.84
CMTM3-210ENST00000565666 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.68■■■□□ 2.82
CMTM3-210ENST00000565666 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.68■■■□□ 2.82
CMTM3-210ENST00000565666 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.65■■■□□ 2.82
CMTM3-210ENST00000565666 TOP2BQ02880 1626 aa32.62■■■□□ 2.81
CMTM3-210ENST00000565666 SYNJ1O43426 1573 aa32.62■■■□□ 2.81
CMTM3-210ENST00000565666 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
CMTM3-210ENST00000565666 WDR97A6NE52 1622 aa32.59■■■□□ 2.81
CMTM3-210ENST00000565666 OSCARQ8IYS5 282 aa32.51■■■□□ 2.79
CMTM3-210ENST00000565666 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.5■■■□□ 2.79
CMTM3-210ENST00000565666 GRIN2BQ13224 1484 aa32.42■■■□□ 2.78
CMTM3-210ENST00000565666 CHD1O14646 1710 aa32.42■■■□□ 2.78
CMTM3-210ENST00000565666 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.42■■■□□ 2.78
CMTM3-210ENST00000565666 PBRM1Q86U86 1689 aa32.41■■■□□ 2.78
CMTM3-210ENST00000565666 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.4■■■□□ 2.78
CMTM3-210ENST00000565666 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.4■■■□□ 2.78
CMTM3-210ENST00000565666 FBLN2P98095 1184 aa32.37■■■□□ 2.77
CMTM3-210ENST00000565666 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
CMTM3-210ENST00000565666 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
CMTM3-210ENST00000565666 SYNJ2O15056 1496 aa32.22■■■□□ 2.75
CMTM3-210ENST00000565666 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.12■■■□□ 2.73
CMTM3-210ENST00000565666 ADAMTS12P58397 1594 aa32.11■■■□□ 2.73
CMTM3-210ENST00000565666 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.04■■■□□ 2.72
CMTM3-210ENST00000565666 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.04■■■□□ 2.72
CMTM3-210ENST00000565666 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.04■■■□□ 2.72
CMTM3-210ENST00000565666 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.03■■■□□ 2.72
CMTM3-210ENST00000565666 KIF27Q86VH2 1401 aa32.01■■■□□ 2.72
CMTM3-210ENST00000565666 CLASP1Q7Z460 1538 aa32■■■□□ 2.71
CMTM3-210ENST00000565666 GRIN2AQ12879 1464 aa32■■■□□ 2.71
CMTM3-210ENST00000565666 ARHGEF11O15085 1522 aa32■■■□□ 2.71
CMTM3-210ENST00000565666 TRIM41Q8WV44 630 aa31.93■■■□□ 2.7
CMTM3-210ENST00000565666 CEP170Q5SW79 1584 aa31.85■■■□□ 2.69
CMTM3-210ENST00000565666 CUL7Q14999 1698 aa31.85■■■□□ 2.69
CMTM3-210ENST00000565666 IGF1RP08069 1367 aa31.84■■■□□ 2.69
CMTM3-210ENST00000565666 NUP160Q12769 1436 aa31.83■■■□□ 2.69
CMTM3-210ENST00000565666 ARAP1Q96P48 1450 aa31.72■■■□□ 2.67
CMTM3-210ENST00000565666 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.7■■■□□ 2.67
CMTM3-210ENST00000565666 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.69■■■□□ 2.66
CMTM3-210ENST00000565666 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.68■■■□□ 2.66
CMTM3-210ENST00000565666 SHROOM2Q13796 1616 aa31.63■■■□□ 2.65
CMTM3-210ENST00000565666 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms