RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.1■■■□□ 2.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 IGF1RP08069 1367 aa31.05■■■□□ 2.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.04■■■□□ 2.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 GRIN2AQ12879 1464 aa30.98■■■□□ 2.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 CUL7Q14999 1698 aa30.96■■■□□ 2.55
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
CCNDBP1-205ENST00000564630 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.88■■■□□ 2.53
CCNDBP1-205ENST00000564630 CEP170Q5SW79 1584 aa30.86■■■□□ 2.53
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.84■■■□□ 2.53
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLIP1P30622 1438 aa30.83■■■□□ 2.53
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.81■■■□□ 2.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 NUP160Q12769 1436 aa30.8■■■□□ 2.52
CCNDBP1-205ENST00000564630 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.72■■■□□ 2.51
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRXQ9BXM0 1461 aa30.68■■■□□ 2.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGEF11O15085 1522 aa30.66■■■□□ 2.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.66■■■□□ 2.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.66■■■□□ 2.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.66■■■□□ 2.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.57■■■□□ 2.48
CCNDBP1-205ENST00000564630 SHROOM2Q13796 1616 aa30.56■■■□□ 2.48
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.54■■■□□ 2.48
CCNDBP1-205ENST00000564630 JPH4Q96JJ6 628 aa30.5■■■□□ 2.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 IQGAP2Q13576 1575 aa30.48■■■□□ 2.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.48■■■□□ 2.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 APLP2Q06481 763 aa30.46■■■□□ 2.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARAP1Q96P48 1450 aa30.45■■■□□ 2.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 NEUROD1Q13562 356 aa30.4■■■□□ 2.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.38■■■□□ 2.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYT1Q01538 1121 aa30.31■■■□□ 2.44
CCNDBP1-205ENST00000564630 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.28■■■□□ 2.44
CCNDBP1-205ENST00000564630 DISP1Q96F81 1524 aa30.25■■■□□ 2.43
CCNDBP1-205ENST00000564630 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.22■■■□□ 2.43
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIAA0556O60303 1618 aa30.2■■■□□ 2.43
CCNDBP1-205ENST00000564630 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.15■■■□□ 2.42
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.14■■■□□ 2.41
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
CCNDBP1-205ENST00000564630 P3H3Q8IVL6 736 aa30.1■■■□□ 2.41
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTPRGP23470 1445 aa30.09■■■□□ 2.41
CCNDBP1-205ENST00000564630 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
CCNDBP1-205ENST00000564630 SAMD9Q5K651 1589 aa30.06■■■□□ 2.4
CCNDBP1-205ENST00000564630 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.99■■■□□ 2.39
CCNDBP1-205ENST00000564630 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.96■■■□□ 2.39
CCNDBP1-205ENST00000564630 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.94■■■□□ 2.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.91■■■□□ 2.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.9■■■□□ 2.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 UACAQ9BZF9 1416 aa29.9■■■□□ 2.38
CCNDBP1-205ENST00000564630 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAP3K1Q13233 1512 aa29.87■■■□□ 2.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCC2Q92887 1545 aa29.86■■■□□ 2.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 TIAM1Q13009 1591 aa29.85■■■□□ 2.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCA8O94911 1581 aa29.83■■■□□ 2.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.83■■■□□ 2.37
CCNDBP1-205ENST00000564630 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.81■■■□□ 2.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.78■■■□□ 2.36
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.75■■■□□ 2.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARID3CA6NKF2 412 aa29.74■■■□□ 2.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.71■■■□□ 2.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.7■■■□□ 2.35
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.69■■■□□ 2.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAPKBP1O60336 1514 aa29.67■■■□□ 2.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 FMN1Q68DA7 1419 aa29.65■■■□□ 2.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
CCNDBP1-205ENST00000564630 MIER1Q8N108 512 aa29.62■■■□□ 2.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 ASXL2Q76L83 1435 aa29.61■■■□□ 2.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP10BO94823 1461 aa29.59■■■□□ 2.33
CCNDBP1-205ENST00000564630 ITGAEP38570 1179 aa29.55■■■□□ 2.32
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.55■■■□□ 2.32
CCNDBP1-205ENST00000564630 HECW1Q76N89 1606 aa29.53■■■□□ 2.32
CCNDBP1-205ENST00000564630 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.53■■■□□ 2.32
CCNDBP1-205ENST00000564630 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.53■■■□□ 2.32
CCNDBP1-205ENST00000564630 DIP2BQ9P265 1576 aa29.53■■■□□ 2.32
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.52■■■□□ 2.32
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.51■■■□□ 2.32
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.49■■■□□ 2.31
CCNDBP1-205ENST00000564630 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.48■■■□□ 2.31
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.48■■■□□ 2.31
CCNDBP1-205ENST00000564630 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.47■■■□□ 2.31
CCNDBP1-205ENST00000564630 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
CCNDBP1-205ENST00000564630 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.44■■■□□ 2.3
CCNDBP1-205ENST00000564630 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNH8Q96L42 1107 aa29.42■■■□□ 2.3
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSPOAP1O95153 1857 aa29.36■■■□□ 2.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 GLI2P10070 1586 aa29.34■■■□□ 2.29
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms