RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 JPH4Q96JJ6 628 aa31.4■■■□□ 2.62
GCSHP2-201ENST00000560971 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.35■■■□□ 2.61
GCSHP2-201ENST00000560971 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.35■■■□□ 2.61
GCSHP2-201ENST00000560971 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.34■■■□□ 2.61
GCSHP2-201ENST00000560971 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
GCSHP2-201ENST00000560971 PRXQ9BXM0 1461 aa31.22■■■□□ 2.59
GCSHP2-201ENST00000560971 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.2■■■□□ 2.59
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
GCSHP2-201ENST00000560971 IQGAP2Q13576 1575 aa31.15■■■□□ 2.58
GCSHP2-201ENST00000560971 EEA1Q15075 1411 aa31.14■■■□□ 2.58
GCSHP2-201ENST00000560971 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.01■■■□□ 2.55
GCSHP2-201ENST00000560971 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31■■■□□ 2.55
GCSHP2-201ENST00000560971 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
GCSHP2-201ENST00000560971 DISP1Q96F81 1524 aa30.98■■■□□ 2.55
GCSHP2-201ENST00000560971 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.98■■■□□ 2.55
GCSHP2-201ENST00000560971 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
GCSHP2-201ENST00000560971 PTPRGP23470 1445 aa30.95■■■□□ 2.54
GCSHP2-201ENST00000560971 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.94■■■□□ 2.54
GCSHP2-201ENST00000560971 KIAA0556O60303 1618 aa30.87■■■□□ 2.53
GCSHP2-201ENST00000560971 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.85■■■□□ 2.53
GCSHP2-201ENST00000560971 KIF21BO75037 1637 aa30.84■■■□□ 2.53
GCSHP2-201ENST00000560971 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.8■■■□□ 2.52
GCSHP2-201ENST00000560971 GOLGA3Q08378 1498 aa30.79■■■□□ 2.52
GCSHP2-201ENST00000560971 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.78■■■□□ 2.52
GCSHP2-201ENST00000560971 UACAQ9BZF9 1416 aa30.72■■■□□ 2.51
GCSHP2-201ENST00000560971 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
GCSHP2-201ENST00000560971 P3H3Q8IVL6 736 aa30.71■■■□□ 2.51
GCSHP2-201ENST00000560971 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.68■■■□□ 2.5
GCSHP2-201ENST00000560971 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
GCSHP2-201ENST00000560971 ABCC2Q92887 1545 aa30.66■■■□□ 2.5
GCSHP2-201ENST00000560971 MAPKBP1O60336 1514 aa30.63■■■□□ 2.49
GCSHP2-201ENST00000560971 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.63■■■□□ 2.49
GCSHP2-201ENST00000560971 SAMD9Q5K651 1589 aa30.62■■■□□ 2.49
GCSHP2-201ENST00000560971 ABCA8O94911 1581 aa30.54■■■□□ 2.48
GCSHP2-201ENST00000560971 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.54■■■□□ 2.48
GCSHP2-201ENST00000560971 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.53■■■□□ 2.48
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.53■■■□□ 2.48
GCSHP2-201ENST00000560971 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.52■■■□□ 2.48
GCSHP2-201ENST00000560971 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.5■■■□□ 2.47
GCSHP2-201ENST00000560971 ASXL2Q76L83 1435 aa30.49■■■□□ 2.47
GCSHP2-201ENST00000560971 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
GCSHP2-201ENST00000560971 DIP2BQ9P265 1576 aa30.47■■■□□ 2.47
GCSHP2-201ENST00000560971 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.46■■■□□ 2.47
GCSHP2-201ENST00000560971 ARID3CA6NKF2 412 aa30.41■■■□□ 2.46
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.36■■■□□ 2.45
GCSHP2-201ENST00000560971 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.36■■■□□ 2.45
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP10BO94823 1461 aa30.32■■■□□ 2.44
GCSHP2-201ENST00000560971 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
GCSHP2-201ENST00000560971 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.31■■■□□ 2.44
GCSHP2-201ENST00000560971 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
GCSHP2-201ENST00000560971 GLI2P10070 1586 aa30.28■■■□□ 2.44
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNH8Q96L42 1107 aa30.24■■■□□ 2.43
GCSHP2-201ENST00000560971 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
GCSHP2-201ENST00000560971 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
GCSHP2-201ENST00000560971 TSPOAP1O95153 1857 aa30.23■■■□□ 2.43
GCSHP2-201ENST00000560971 FMN1Q68DA7 1419 aa30.2■■■□□ 2.42
GCSHP2-201ENST00000560971 CLIP1P30622 1438 aa30.14■■■□□ 2.42
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.14■■■□□ 2.41
GCSHP2-201ENST00000560971 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.12■■■□□ 2.41
GCSHP2-201ENST00000560971 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
GCSHP2-201ENST00000560971 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
GCSHP2-201ENST00000560971 CD109Q6YHK3 1445 aa30.05■■■□□ 2.4
GCSHP2-201ENST00000560971 HECW1Q76N89 1606 aa30.05■■■□□ 2.4
GCSHP2-201ENST00000560971 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.05■■■□□ 2.4
GCSHP2-201ENST00000560971 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.01■■■□□ 2.4
GCSHP2-201ENST00000560971 KDM6BO15054 1643 aa30■■■□□ 2.39
GCSHP2-201ENST00000560971 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.99■■■□□ 2.39
GCSHP2-201ENST00000560971 CEP162Q5TB80 1403 aa29.99■■■□□ 2.39
GCSHP2-201ENST00000560971 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.97■■■□□ 2.39
GCSHP2-201ENST00000560971 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
GCSHP2-201ENST00000560971 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.96■■■□□ 2.39
GCSHP2-201ENST00000560971 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.96■■■□□ 2.39
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.92■■■□□ 2.38
GCSHP2-201ENST00000560971 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
GCSHP2-201ENST00000560971 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
GCSHP2-201ENST00000560971 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.87■■■□□ 2.37
GCSHP2-201ENST00000560971 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.85■■■□□ 2.37
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.83■■■□□ 2.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.81■■■□□ 2.36
GCSHP2-201ENST00000560971 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
GCSHP2-201ENST00000560971 KIF14Q15058 1648 aa29.74■■■□□ 2.35
GCSHP2-201ENST00000560971 NEO1Q92859 1461 aa29.72■■■□□ 2.35
GCSHP2-201ENST00000560971 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.71■■■□□ 2.35
GCSHP2-201ENST00000560971 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.7■■■□□ 2.35
GCSHP2-201ENST00000560971 PLCH2O75038 1416 aa29.68■■■□□ 2.34
GCSHP2-201ENST00000560971 FANCAO15360 1455 aa29.68■■■□□ 2.34
GCSHP2-201ENST00000560971 AKNAQ7Z591 1439 aa29.64■■■□□ 2.34
GCSHP2-201ENST00000560971 RAPGEF3O95398 923 aa29.64■■■□□ 2.34
GCSHP2-201ENST00000560971 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.62■■■□□ 2.33
GCSHP2-201ENST00000560971 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.59■■■□□ 2.33
GCSHP2-201ENST00000560971 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.59■■■□□ 2.33
GCSHP2-201ENST00000560971 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.57■■■□□ 2.32
GCSHP2-201ENST00000560971 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.56■■■□□ 2.32
GCSHP2-201ENST00000560971 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
GCSHP2-201ENST00000560971 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.53■■■□□ 2.32
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.53■■■□□ 2.32
GCSHP2-201ENST00000560971 ADGRL1O94910 1474 aa29.52■■■□□ 2.32
GCSHP2-201ENST00000560971 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.5■■■□□ 2.31
GCSHP2-201ENST00000560971 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.48■■■□□ 2.31
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