RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.29■■■■■ 4.84
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GCSHP2-201ENST00000560971 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.98■■■■□ 3.67
GCSHP2-201ENST00000560971 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.93■■■■□ 3.66
GCSHP2-201ENST00000560971 NACADO15069 1562 aa37.86■■■■□ 3.65
GCSHP2-201ENST00000560971 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
GCSHP2-201ENST00000560971 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.58■■■■□ 3.61
GCSHP2-201ENST00000560971 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.41■■■■□ 3.58
GCSHP2-201ENST00000560971 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.07■■■■□ 3.52
GCSHP2-201ENST00000560971 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.01■■■■□ 3.52
GCSHP2-201ENST00000560971 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.83■■■■□ 3.49
GCSHP2-201ENST00000560971 SCRIBQ14160 1630 aa36.79■■■■□ 3.48
GCSHP2-201ENST00000560971 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.44■■■■□ 3.42
GCSHP2-201ENST00000560971 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.33■■■■□ 3.41
GCSHP2-201ENST00000560971 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
GCSHP2-201ENST00000560971 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.73■■■■□ 3.31
GCSHP2-201ENST00000560971 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.52■■■■□ 3.28
GCSHP2-201ENST00000560971 SMARCA4P51532 1647 aa35.14■■■■□ 3.22
GCSHP2-201ENST00000560971 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
GCSHP2-201ENST00000560971 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35■■■■□ 3.19
GCSHP2-201ENST00000560971 NCAPD3P42695 1498 aa34.97■■■■□ 3.19
GCSHP2-201ENST00000560971 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.94■■■■□ 3.18
GCSHP2-201ENST00000560971 SMARCA2P51531 1590 aa34.91■■■■□ 3.18
GCSHP2-201ENST00000560971 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.78■■■■□ 3.16
GCSHP2-201ENST00000560971 HMGXB3Q12766 1538 aa34.76■■■■□ 3.15
GCSHP2-201ENST00000560971 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
GCSHP2-201ENST00000560971 WIZO95785 1651 aa34.55■■■■□ 3.12
GCSHP2-201ENST00000560971 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
GCSHP2-201ENST00000560971 NESP48681 1621 aa34.22■■■■□ 3.07
GCSHP2-201ENST00000560971 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
GCSHP2-201ENST00000560971 ERCC6Q03468 1493 aa34.07■■■■□ 3.04
GCSHP2-201ENST00000560971 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.02■■■■□ 3.04
GCSHP2-201ENST00000560971 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.97■■■■□ 3.03
GCSHP2-201ENST00000560971 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.83■■■■□ 3.01
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.8■■■■□ 3
GCSHP2-201ENST00000560971 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.74■■■□□ 2.99
GCSHP2-201ENST00000560971 CFTRP13569 1480 aa33.74■■■□□ 2.99
GCSHP2-201ENST00000560971 CUX2O14529 1486 aa33.69■■■□□ 2.98
GCSHP2-201ENST00000560971 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
GCSHP2-201ENST00000560971 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
GCSHP2-201ENST00000560971 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.58■■■□□ 2.97
GCSHP2-201ENST00000560971 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.52■■■□□ 2.96
GCSHP2-201ENST00000560971 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.5■■■□□ 2.95
GCSHP2-201ENST00000560971 PRDM2Q13029 1718 aa33.39■■■□□ 2.94
GCSHP2-201ENST00000560971 WDR62O43379 1518 aa33.38■■■□□ 2.93
GCSHP2-201ENST00000560971 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
GCSHP2-201ENST00000560971 TOPBP1Q92547 1522 aa33.03■■■□□ 2.88
GCSHP2-201ENST00000560971 ABCC8Q09428 1581 aa32.96■■■□□ 2.87
GCSHP2-201ENST00000560971 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.96■■■□□ 2.87
GCSHP2-201ENST00000560971 IFT140Q96RY7 1462 aa32.82■■■□□ 2.84
GCSHP2-201ENST00000560971 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.81■■■□□ 2.84
GCSHP2-201ENST00000560971 CUX1P39880 1505 aa32.77■■■□□ 2.84
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GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
GCSHP2-201ENST00000560971 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.67■■■□□ 2.82
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GCSHP2-201ENST00000560971 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.66■■■□□ 2.82
GCSHP2-201ENST00000560971 SOGA1O94964 1423 aa32.63■■■□□ 2.81
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GCSHP2-201ENST00000560971 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
GCSHP2-201ENST00000560971 SYNJ1O43426 1573 aa32.46■■■□□ 2.79
GCSHP2-201ENST00000560971 TOP2BQ02880 1626 aa32.44■■■□□ 2.78
GCSHP2-201ENST00000560971 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.41■■■□□ 2.78
GCSHP2-201ENST00000560971 WDR97A6NE52 1622 aa32.34■■■□□ 2.77
GCSHP2-201ENST00000560971 OSCARQ8IYS5 282 aa32.34■■■□□ 2.77
GCSHP2-201ENST00000560971 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.32■■■□□ 2.76
GCSHP2-201ENST00000560971 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.23■■■□□ 2.75
GCSHP2-201ENST00000560971 GRIN2BQ13224 1484 aa32.23■■■□□ 2.75
GCSHP2-201ENST00000560971 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.23■■■□□ 2.75
GCSHP2-201ENST00000560971 FBLN2P98095 1184 aa32.2■■■□□ 2.75
GCSHP2-201ENST00000560971 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.19■■■□□ 2.74
GCSHP2-201ENST00000560971 CHD1O14646 1710 aa32.14■■■□□ 2.74
GCSHP2-201ENST00000560971 PBRM1Q86U86 1689 aa32.13■■■□□ 2.73
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GCSHP2-201ENST00000560971 SYNJ2O15056 1496 aa32.03■■■□□ 2.72
GCSHP2-201ENST00000560971 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.91■■■□□ 2.7
GCSHP2-201ENST00000560971 ADAMTS12P58397 1594 aa31.9■■■□□ 2.7
GCSHP2-201ENST00000560971 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.85■■■□□ 2.69
GCSHP2-201ENST00000560971 KIF27Q86VH2 1401 aa31.83■■■□□ 2.69
GCSHP2-201ENST00000560971 GRIN2AQ12879 1464 aa31.82■■■□□ 2.68
GCSHP2-201ENST00000560971 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.81■■■□□ 2.68
GCSHP2-201ENST00000560971 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.81■■■□□ 2.68
GCSHP2-201ENST00000560971 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.81■■■□□ 2.68
GCSHP2-201ENST00000560971 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.8■■■□□ 2.68
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGEF11O15085 1522 aa31.8■■■□□ 2.68
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GCSHP2-201ENST00000560971 TRIM41Q8WV44 630 aa31.76■■■□□ 2.67
GCSHP2-201ENST00000560971 CEP170Q5SW79 1584 aa31.68■■■□□ 2.66
GCSHP2-201ENST00000560971 NUP160Q12769 1436 aa31.67■■■□□ 2.66
GCSHP2-201ENST00000560971 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.61■■■□□ 2.65
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GCSHP2-201ENST00000560971 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.57■■■□□ 2.64
GCSHP2-201ENST00000560971 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.56■■■□□ 2.64
GCSHP2-201ENST00000560971 ARAP1Q96P48 1450 aa31.55■■■□□ 2.64
GCSHP2-201ENST00000560971 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.43■■■□□ 2.62
GCSHP2-201ENST00000560971 SHROOM2Q13796 1616 aa31.42■■■□□ 2.62
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