RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560514.1

TSPAN3-208, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-208ENST00000560514 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.97■■■□□ 2.71
TSPAN3-208ENST00000560514 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.92■■■□□ 2.7
TSPAN3-208ENST00000560514 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.85■■■□□ 2.69
TSPAN3-208ENST00000560514 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.83■■■□□ 2.69
TSPAN3-208ENST00000560514 MAPKBP1O60336 1514 aa31.8■■■□□ 2.68
TSPAN3-208ENST00000560514 DIP2BQ9P265 1576 aa31.75■■■□□ 2.67
TSPAN3-208ENST00000560514 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.72■■■□□ 2.67
TSPAN3-208ENST00000560514 KDM6BO15054 1643 aa31.69■■■□□ 2.66
TSPAN3-208ENST00000560514 TSPOAP1O95153 1857 aa31.65■■■□□ 2.66
TSPAN3-208ENST00000560514 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.63■■■□□ 2.65
TSPAN3-208ENST00000560514 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.56■■■□□ 2.64
TSPAN3-208ENST00000560514 CUL7Q14999 1698 aa31.54■■■□□ 2.64
TSPAN3-208ENST00000560514 KIF27Q86VH2 1401 aa31.51■■■□□ 2.64
TSPAN3-208ENST00000560514 IGF1RP08069 1367 aa31.51■■■□□ 2.63
TSPAN3-208ENST00000560514 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
TSPAN3-208ENST00000560514 PTPRGP23470 1445 aa31.49■■■□□ 2.63
TSPAN3-208ENST00000560514 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.41■■■□□ 2.62
TSPAN3-208ENST00000560514 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.38■■■□□ 2.61
TSPAN3-208ENST00000560514 ABCC2Q92887 1545 aa31.37■■■□□ 2.61
TSPAN3-208ENST00000560514 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.33■■■□□ 2.61
TSPAN3-208ENST00000560514 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.33■■■□□ 2.61
TSPAN3-208ENST00000560514 ASXL2Q76L83 1435 aa31.32■■■□□ 2.61
TSPAN3-208ENST00000560514 GLI2P10070 1586 aa31.28■■■□□ 2.6
TSPAN3-208ENST00000560514 IQGAP2Q13576 1575 aa31.26■■■□□ 2.59
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TSPAN3-208ENST00000560514 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
TSPAN3-208ENST00000560514 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.22■■■□□ 2.59
TSPAN3-208ENST00000560514 UACAQ9BZF9 1416 aa31.22■■■□□ 2.59
TSPAN3-208ENST00000560514 ADGRL1O94910 1474 aa31.21■■■□□ 2.59
TSPAN3-208ENST00000560514 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.14■■■□□ 2.57
TSPAN3-208ENST00000560514 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
TSPAN3-208ENST00000560514 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.09■■■□□ 2.57
TSPAN3-208ENST00000560514 DISP1Q96F81 1524 aa31.09■■■□□ 2.57
TSPAN3-208ENST00000560514 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.08■■■□□ 2.57
TSPAN3-208ENST00000560514 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
TSPAN3-208ENST00000560514 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
TSPAN3-208ENST00000560514 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.01■■■□□ 2.55
TSPAN3-208ENST00000560514 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.99■■■□□ 2.55
TSPAN3-208ENST00000560514 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.96■■■□□ 2.55
TSPAN3-208ENST00000560514 KIAA0556O60303 1618 aa30.96■■■□□ 2.55
TSPAN3-208ENST00000560514 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.93■■■□□ 2.54
TSPAN3-208ENST00000560514 CD109Q6YHK3 1445 aa30.83■■■□□ 2.53
TSPAN3-208ENST00000560514 KCNH8Q96L42 1107 aa30.82■■■□□ 2.52
TSPAN3-208ENST00000560514 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.81■■■□□ 2.52
TSPAN3-208ENST00000560514 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.79■■■□□ 2.52
TSPAN3-208ENST00000560514 GOLGA3Q08378 1498 aa30.79■■■□□ 2.52
TSPAN3-208ENST00000560514 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.78■■■□□ 2.52
TSPAN3-208ENST00000560514 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
TSPAN3-208ENST00000560514 ABCA8O94911 1581 aa30.7■■■□□ 2.5
TSPAN3-208ENST00000560514 KIF21BO75037 1637 aa30.65■■■□□ 2.5
TSPAN3-208ENST00000560514 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.57■■■□□ 2.48
TSPAN3-208ENST00000560514 ARID3CA6NKF2 412 aa30.55■■■□□ 2.48
TSPAN3-208ENST00000560514 FBXO41Q8TF61 875 aa30.51■■■□□ 2.47
TSPAN3-208ENST00000560514 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.5■■■□□ 2.47
TSPAN3-208ENST00000560514 PRXQ9BXM0 1461 aa30.46■■■□□ 2.47
TSPAN3-208ENST00000560514 P3H3Q8IVL6 736 aa30.46■■■□□ 2.47
TSPAN3-208ENST00000560514 ATP10BO94823 1461 aa30.45■■■□□ 2.47
TSPAN3-208ENST00000560514 PTPRMP28827 1452 aa30.44■■■□□ 2.46
TSPAN3-208ENST00000560514 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.44■■■□□ 2.46
TSPAN3-208ENST00000560514 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.41■■■□□ 2.46
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TSPAN3-208ENST00000560514 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
TSPAN3-208ENST00000560514 NEO1Q92859 1461 aa30.36■■■□□ 2.45
TSPAN3-208ENST00000560514 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.31■■■□□ 2.44
TSPAN3-208ENST00000560514 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.31■■■□□ 2.44
TSPAN3-208ENST00000560514 MADDQ8WXG6 1647 aa30.27■■■□□ 2.44
TSPAN3-208ENST00000560514 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
TSPAN3-208ENST00000560514 SAMD9Q5K651 1589 aa30.24■■■□□ 2.43
TSPAN3-208ENST00000560514 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPAN3-208ENST00000560514 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPAN3-208ENST00000560514 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
TSPAN3-208ENST00000560514 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
TSPAN3-208ENST00000560514 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.16■■■□□ 2.42
TSPAN3-208ENST00000560514 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.16■■■□□ 2.42
TSPAN3-208ENST00000560514 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.16■■■□□ 2.42
TSPAN3-208ENST00000560514 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
TSPAN3-208ENST00000560514 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
TSPAN3-208ENST00000560514 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.13■■■□□ 2.41
TSPAN3-208ENST00000560514 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPAN3-208ENST00000560514 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.12■■■□□ 2.41
TSPAN3-208ENST00000560514 AKNAQ7Z591 1439 aa30.11■■■□□ 2.41
TSPAN3-208ENST00000560514 RICTORQ6R327 1708 aa30.1■■■□□ 2.41
TSPAN3-208ENST00000560514 FANCAO15360 1455 aa30.08■■■□□ 2.41
TSPAN3-208ENST00000560514 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.05■■■□□ 2.4
TSPAN3-208ENST00000560514 HSPA2P54652 639 aa30.05■■■□□ 2.4
TSPAN3-208ENST00000560514 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.01■■■□□ 2.4
TSPAN3-208ENST00000560514 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.01■■■□□ 2.39
TSPAN3-208ENST00000560514 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.392e-7■■■■■ 47.7
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TSPAN3-208ENST00000560514 MLECQ14165 292 aa29.97■■■□□ 2.39
TSPAN3-208ENST00000560514 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.96■■■□□ 2.39
TSPAN3-208ENST00000560514 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.94■■■□□ 2.38
TSPAN3-208ENST00000560514 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.94■■■□□ 2.38
TSPAN3-208ENST00000560514 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.93■■■□□ 2.38
TSPAN3-208ENST00000560514 EEA1Q15075 1411 aa29.92■■■□□ 2.38
TSPAN3-208ENST00000560514 CERKQ8TCT0 537 aa29.92■■■□□ 2.38
TSPAN3-208ENST00000560514 HECW1Q76N89 1606 aa29.89■■■□□ 2.38
TSPAN3-208ENST00000560514 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.88■■■□□ 2.37
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