RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559365.5

PSMA4-212, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSMA4, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-212ENST00000559365 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.83■■■■■ 5.09
PSMA4-212ENST00000559365 JPH4Q96JJ6 628 aa46.81■■■■■ 5.08
PSMA4-212ENST00000559365 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa46.66■■■■■ 5.06
PSMA4-212ENST00000559365 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.63■■■■■ 5.06
PSMA4-212ENST00000559365 IQGAP2Q13576 1575 aa46.31■■■■■ 5
PSMA4-212ENST00000559365 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.31■■■■■ 5
PSMA4-212ENST00000559365 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.29■■■■■ 5
PSMA4-212ENST00000559365 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.27■■■■■ 5
PSMA4-212ENST00000559365 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.16■■■■■ 4.98
PSMA4-212ENST00000559365 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.14■■■■■ 4.98
PSMA4-212ENST00000559365 MAPKBP1O60336 1514 aa46.13■■■■■ 4.98
PSMA4-212ENST00000559365 PTPRGP23470 1445 aa46.13■■■■■ 4.98
PSMA4-212ENST00000559365 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.09■■■■■ 4.97
PSMA4-212ENST00000559365 DISP1Q96F81 1524 aa46.06■■■■■ 4.96
PSMA4-212ENST00000559365 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.03■■■■■ 4.96
PSMA4-212ENST00000559365 UGGT2Q9NYU1 1516 aa46.03■■■■■ 4.96
PSMA4-212ENST00000559365 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.03■■■■■ 4.96
PSMA4-212ENST00000559365 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.99■■■■■ 4.95
PSMA4-212ENST00000559365 DIP2BQ9P265 1576 aa45.98■■■■■ 4.95
PSMA4-212ENST00000559365 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.93■■■■■ 4.94
PSMA4-212ENST00000559365 PRXQ9BXM0 1461 aa45.91■■■■■ 4.94
PSMA4-212ENST00000559365 KIAA0556O60303 1618 aa45.9■■■■■ 4.94
PSMA4-212ENST00000559365 ABCC2Q92887 1545 aa45.87■■■■■ 4.93
PSMA4-212ENST00000559365 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.83■■■■■ 4.93
PSMA4-212ENST00000559365 UACAQ9BZF9 1416 aa45.8■■■■■ 4.92
PSMA4-212ENST00000559365 TSPOAP1O95153 1857 aa45.71■■■■■ 4.91
PSMA4-212ENST00000559365 ASXL2Q76L83 1435 aa45.67■■■■■ 4.9
PSMA4-212ENST00000559365 GOLGA3Q08378 1498 aa45.64■■■■■ 4.9
PSMA4-212ENST00000559365 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.63■■■■■ 4.9
PSMA4-212ENST00000559365 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.62■■■■■ 4.89
PSMA4-212ENST00000559365 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.61■■■■■ 4.89
PSMA4-212ENST00000559365 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
PSMA4-212ENST00000559365 GLI2P10070 1586 aa45.53■■■■■ 4.88
PSMA4-212ENST00000559365 EEA1Q15075 1411 aa45.5■■■■■ 4.87
PSMA4-212ENST00000559365 KDM6BO15054 1643 aa45.46■■■■■ 4.87
PSMA4-212ENST00000559365 ABCA8O94911 1581 aa45.45■■■■■ 4.87
PSMA4-212ENST00000559365 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.86
PSMA4-212ENST00000559365 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
PSMA4-212ENST00000559365 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa45.33■■■■■ 4.85
PSMA4-212ENST00000559365 SAMD9Q5K651 1589 aa45.32■■■■■ 4.85
PSMA4-212ENST00000559365 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.3■■■■■ 4.84
PSMA4-212ENST00000559365 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.29■■■■■ 4.84
PSMA4-212ENST00000559365 WDR7Q9Y4E6 1490 aa45.29■■■■■ 4.84
PSMA4-212ENST00000559365 P3H3Q8IVL6 736 aa45.27■■■■■ 4.84
PSMA4-212ENST00000559365 KIF21BO75037 1637 aa45.19■■■■■ 4.83
PSMA4-212ENST00000559365 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.14■■■■■ 4.82
PSMA4-212ENST00000559365 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.08■■■■■ 4.81
PSMA4-212ENST00000559365 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.06■■■■■ 4.8
PSMA4-212ENST00000559365 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa45.05■■■■■ 4.8
PSMA4-212ENST00000559365 ATP10BO94823 1461 aa45.04■■■■■ 4.8
PSMA4-212ENST00000559365 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.03■■■■■ 4.8
PSMA4-212ENST00000559365 ARID3CA6NKF2 412 aa45.02■■■■■ 4.8
PSMA4-212ENST00000559365 KCNH8Q96L42 1107 aa45.02■■■■■ 4.8
PSMA4-212ENST00000559365 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
PSMA4-212ENST00000559365 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.97■■■■■ 4.79
PSMA4-212ENST00000559365 CD109Q6YHK3 1445 aa44.94■■■■■ 4.79
PSMA4-212ENST00000559365 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.92■■■■■ 4.78
PSMA4-212ENST00000559365 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.89■■■■■ 4.78
PSMA4-212ENST00000559365 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
PSMA4-212ENST00000559365 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.8■■■■■ 4.76
PSMA4-212ENST00000559365 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.79■■■■■ 4.76
PSMA4-212ENST00000559365 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.78■■■■■ 4.76
PSMA4-212ENST00000559365 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
PSMA4-212ENST00000559365 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.72■■■■■ 4.75
PSMA4-212ENST00000559365 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.72■■■■■ 4.75
PSMA4-212ENST00000559365 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa44.57■■■■■ 4.73
PSMA4-212ENST00000559365 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.56■■■■■ 4.72
PSMA4-212ENST00000559365 ADGRL1O94910 1474 aa44.55■■■■■ 4.72
PSMA4-212ENST00000559365 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.5■■■■■ 4.71
PSMA4-212ENST00000559365 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
PSMA4-212ENST00000559365 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.45■■■■■ 4.71
PSMA4-212ENST00000559365 FMN1Q68DA7 1419 aa44.45■■■■■ 4.71
PSMA4-212ENST00000559365 NEO1Q92859 1461 aa44.45■■■■■ 4.71
PSMA4-212ENST00000559365 HECW1Q76N89 1606 aa44.41■■■■■ 4.7
PSMA4-212ENST00000559365 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.39■■■■■ 4.7
PSMA4-212ENST00000559365 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.35■■■■■ 4.69
PSMA4-212ENST00000559365 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP44.29■■■■■ 4.68
PSMA4-212ENST00000559365 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa44.29■■■■■ 4.68
PSMA4-212ENST00000559365 RAPGEF3O95398 923 aa44.28■■■■■ 4.68
PSMA4-212ENST00000559365 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.25■■■■■ 4.67
PSMA4-212ENST00000559365 CFAP74Q9C0B2 1584 aa44.24■■■■■ 4.67
PSMA4-212ENST00000559365 FANCAO15360 1455 aa44.21■■■■■ 4.67
PSMA4-212ENST00000559365 AKNAQ7Z591 1439 aa44.18■■■■■ 4.66
PSMA4-212ENST00000559365 RICTORQ6R327 1708 aa44.18■■■■■ 4.66
PSMA4-212ENST00000559365 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
PSMA4-212ENST00000559365 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
PSMA4-212ENST00000559365 KIF14Q15058 1648 aa44.1■■■■■ 4.65
PSMA4-212ENST00000559365 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
PSMA4-212ENST00000559365 MYO5CQ9NQX4 1742 aa44.08■■■■■ 4.65
PSMA4-212ENST00000559365 PLCH2O75038 1416 aa44.07■■■■■ 4.64
PSMA4-212ENST00000559365 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP44.04■■■■■ 4.64
PSMA4-212ENST00000559365 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa44.04■■■■■ 4.64
PSMA4-212ENST00000559365 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa44■■■■■ 4.63
PSMA4-212ENST00000559365 CLIP1P30622 1438 aa43.97■■■■■ 4.63
PSMA4-212ENST00000559365 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.96■■■■■ 4.63
PSMA4-212ENST00000559365 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.96■■■■■ 4.63
PSMA4-212ENST00000559365 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.95■■■■■ 4.63
PSMA4-212ENST00000559365 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.91■■■■■ 4.62
PSMA4-212ENST00000559365 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.9■■■■■ 4.62
PSMA4-212ENST00000559365 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.89■■■■■ 4.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms