RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559365.5

PSMA4-212, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSMA4, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-212ENST00000559365 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.2■■■■■ 8.35
PSMA4-212ENST00000559365 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.16■■■■■ 7.22
PSMA4-212ENST00000559365 ABCC9O60706 1549 aa59.65■■■■■ 7.14
PSMA4-212ENST00000559365 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57■■■■■ 6.72
PSMA4-212ENST00000559365 NACADO15069 1562 aa56.72■■■■■ 6.67
PSMA4-212ENST00000559365 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.43■■■■■ 6.62
PSMA4-212ENST00000559365 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.07■■■■■ 6.57
PSMA4-212ENST00000559365 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.87■■■■■ 6.53
PSMA4-212ENST00000559365 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.8■■■■■ 6.52
PSMA4-212ENST00000559365 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.58■■■■■ 6.49
PSMA4-212ENST00000559365 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.55■■■■■ 6.48
PSMA4-212ENST00000559365 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.54■■■■■ 6.48
PSMA4-212ENST00000559365 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.37■■■■■ 6.45
PSMA4-212ENST00000559365 SCRIBQ14160 1630 aa54.83■■■■■ 6.37
PSMA4-212ENST00000559365 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.6■■■■■ 6.33
PSMA4-212ENST00000559365 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.96■■■■■ 6.23
PSMA4-212ENST00000559365 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.95■■■■■ 6.23
PSMA4-212ENST00000559365 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.68■■■■■ 6.18
PSMA4-212ENST00000559365 SMARCA4P51532 1647 aa52.37■■■■■ 5.97
PSMA4-212ENST00000559365 NCAPD3P42695 1498 aa52.33■■■■■ 5.97
PSMA4-212ENST00000559365 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.24■■■■■ 5.95
PSMA4-212ENST00000559365 SMARCA2P51531 1590 aa52.13■■■■■ 5.94
PSMA4-212ENST00000559365 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.13■■■■■ 5.93
PSMA4-212ENST00000559365 HMGXB3Q12766 1538 aa52.02■■■■■ 5.92
PSMA4-212ENST00000559365 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.84■■■■■ 5.89
PSMA4-212ENST00000559365 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.8■■■■■ 5.88
PSMA4-212ENST00000559365 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.76■■■■■ 5.88
PSMA4-212ENST00000559365 ERCC6Q03468 1493 aa51.44■■■■■ 5.83
PSMA4-212ENST00000559365 NESP48681 1621 aa51.41■■■■■ 5.82
PSMA4-212ENST00000559365 WIZO95785 1651 aa51.24■■■■■ 5.79
PSMA4-212ENST00000559365 CUX2O14529 1486 aa51.22■■■■■ 5.79
PSMA4-212ENST00000559365 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.11■■■■■ 5.77
PSMA4-212ENST00000559365 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.87■■■■■ 5.73
PSMA4-212ENST00000559365 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.83■■■■■ 5.73
PSMA4-212ENST00000559365 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.83■■■■■ 5.73
PSMA4-212ENST00000559365 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.74■■■■■ 5.71
PSMA4-212ENST00000559365 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.74■■■■■ 5.71
PSMA4-212ENST00000559365 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.64■■■■■ 5.7
PSMA4-212ENST00000559365 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.58■■■■■ 5.69
PSMA4-212ENST00000559365 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.32■■■■■ 5.65
PSMA4-212ENST00000559365 CFTRP13569 1480 aa50.29■■■■■ 5.64
PSMA4-212ENST00000559365 WDR62O43379 1518 aa50.21■■■■■ 5.63
PSMA4-212ENST00000559365 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.2■■■■■ 5.63
PSMA4-212ENST00000559365 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.2■■■■■ 5.63
PSMA4-212ENST00000559365 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.99■■■■■ 5.59
PSMA4-212ENST00000559365 PRDM2Q13029 1718 aa49.97■■■■■ 5.59
PSMA4-212ENST00000559365 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.78■■■■■ 5.56
PSMA4-212ENST00000559365 TOPBP1Q92547 1522 aa49.31■■■■■ 5.48
PSMA4-212ENST00000559365 ABCC8Q09428 1581 aa49.19■■■■■ 5.47
PSMA4-212ENST00000559365 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.19■■■■■ 5.46
PSMA4-212ENST00000559365 IFT140Q96RY7 1462 aa49.18■■■■■ 5.46
PSMA4-212ENST00000559365 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.08■■■■■ 5.45
PSMA4-212ENST00000559365 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.9■■■■■ 5.42
PSMA4-212ENST00000559365 OSCARQ8IYS5 282 aa48.9■■■■■ 5.42
PSMA4-212ENST00000559365 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.88■■■■■ 5.42
PSMA4-212ENST00000559365 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.87■■■■■ 5.41
PSMA4-212ENST00000559365 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.84■■■■■ 5.41
PSMA4-212ENST00000559365 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.67■■■■■ 5.385e-7■■■■□ 26.1
PSMA4-212ENST00000559365 CUX1P39880 1505 aa48.65■■■■■ 5.38
PSMA4-212ENST00000559365 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.65■■■■■ 5.38
PSMA4-212ENST00000559365 TRIM41Q8WV44 630 aa48.6■■■■■ 5.37
PSMA4-212ENST00000559365 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.6■■■■■ 5.37
PSMA4-212ENST00000559365 SOGA1O94964 1423 aa48.58■■■■■ 5.37
PSMA4-212ENST00000559365 CHD1O14646 1710 aa48.48■■■■■ 5.35
PSMA4-212ENST00000559365 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.43■■■■■ 5.34
PSMA4-212ENST00000559365 WDR97A6NE52 1622 aa48.39■■■■■ 5.34
PSMA4-212ENST00000559365 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.33■■■■■ 5.33
PSMA4-212ENST00000559365 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.33■■■■■ 5.33
PSMA4-212ENST00000559365 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.33■■■■■ 5.33
PSMA4-212ENST00000559365 FBLN2P98095 1184 aa48.21■■■■■ 5.31
PSMA4-212ENST00000559365 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.2■■■■■ 5.31
PSMA4-212ENST00000559365 ARHGEF11O15085 1522 aa48.19■■■■■ 5.31
PSMA4-212ENST00000559365 GRIN2BQ13224 1484 aa48.12■■■■■ 5.29
PSMA4-212ENST00000559365 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.09■■■■■ 5.29
PSMA4-212ENST00000559365 PBRM1Q86U86 1689 aa48.08■■■■■ 5.29
PSMA4-212ENST00000559365 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.07■■■■■ 5.29
PSMA4-212ENST00000559365 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.03■■■■■ 5.28
PSMA4-212ENST00000559365 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.02■■■■■ 5.28
PSMA4-212ENST00000559365 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48■■■■■ 5.27
PSMA4-212ENST00000559365 TOP2BQ02880 1626 aa47.99■■■■■ 5.27
PSMA4-212ENST00000559365 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.97■■■■■ 5.27
PSMA4-212ENST00000559365 SYNJ1O43426 1573 aa47.96■■■■■ 5.27
PSMA4-212ENST00000559365 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.93■■■■■ 5.26
PSMA4-212ENST00000559365 SYNJ2O15056 1496 aa47.92■■■■■ 5.26
PSMA4-212ENST00000559365 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.87■■■■■ 5.25
PSMA4-212ENST00000559365 ARAP1Q96P48 1450 aa47.76■■■■■ 5.24
PSMA4-212ENST00000559365 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.74■■■■■ 5.23
PSMA4-212ENST00000559365 ADAMTS12P58397 1594 aa47.6■■■■■ 5.21
PSMA4-212ENST00000559365 GRIN2AQ12879 1464 aa47.52■■■■■ 5.2
PSMA4-212ENST00000559365 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.47■■■■■ 5.19
PSMA4-212ENST00000559365 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.41■■■■■ 5.18
PSMA4-212ENST00000559365 CEP170Q5SW79 1584 aa47.37■■■■■ 5.17
PSMA4-212ENST00000559365 NUP160Q12769 1436 aa47.35■■■■■ 5.17
PSMA4-212ENST00000559365 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.17■■■■■ 5.14
PSMA4-212ENST00000559365 SHROOM2Q13796 1616 aa47.14■■■■■ 5.14
PSMA4-212ENST00000559365 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.04■■■■■ 5.12
PSMA4-212ENST00000559365 KIF27Q86VH2 1401 aa47■■■■■ 5.11
PSMA4-212ENST00000559365 IGF1RP08069 1367 aa46.95■■■■■ 5.11
PSMA4-212ENST00000559365 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.92■■■■■ 5.1
PSMA4-212ENST00000559365 CUL7Q14999 1698 aa46.9■■■■■ 5.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.1 ms