RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559191.5

TLE3-216, Transcript of transducin like enhancer of split 3, human

TSL 5 BASIC

Gene TLE3, Length 1,575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE3-216	ENST00000559191	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		34.22	■■■■□ 3.07
TLE3-216	ENST00000559191	CLIP1	P30622	1438 aa		34.19	■■■■□ 3.06
TLE3-216	ENST00000559191	CHD1	O14646	1710 aa		34.09	■■■■□ 3.05
TLE3-216	ENST00000559191	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		34.07	■■■■□ 3.04
TLE3-216	ENST00000559191	NUP160	Q12769	1436 aa		34.06	■■■■□ 3.04
TLE3-216	ENST00000559191	IQGAP2	Q13576	1575 aa		34.05	■■■■□ 3.04
TLE3-216	ENST00000559191	CEP170	Q5SW79	1584 aa		34.05	■■■■□ 3.04
TLE3-216	ENST00000559191	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		33.95	■■■■□ 3.03
TLE3-216	ENST00000559191	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.94	■■■■□ 3.02
TLE3-216	ENST00000559191	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.86	■■■■□ 3.01
TLE3-216	ENST00000559191	ARAP1	Q96P48	1450 aa		33.85	■■■■□ 3.01
TLE3-216	ENST00000559191	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.85	■■■■□ 3.01
TLE3-216	ENST00000559191	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.83	■■■■□ 3.01
TLE3-216	ENST00000559191	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.82	■■■■□ 3
TLE3-216	ENST00000559191	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.8	■■■■□ 3
TLE3-216	ENST00000559191	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.76	■■■□□ 2.99
TLE3-216	ENST00000559191	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		33.74	■■■□□ 2.99
TLE3-216	ENST00000559191	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.73	■■■□□ 2.99
TLE3-216	ENST00000559191	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		33.71	■■■□□ 2.99
TLE3-216	ENST00000559191	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.69	■■■□□ 2.98
TLE3-216	ENST00000559191	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.69	■■■□□ 2.98
TLE3-216	ENST00000559191	FMN1	Q68DA7	1419 aa		33.67	■■■□□ 2.98
TLE3-216	ENST00000559191	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.64	■■■□□ 2.98
TLE3-216	ENST00000559191	SHROOM2	Q13796	1616 aa		33.63	■■■□□ 2.97
TLE3-216	ENST00000559191	APLP2	Q06481	763 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TLE3-216	ENST00000559191	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
TLE3-216	ENST00000559191	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
TLE3-216	ENST00000559191	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.49	■■■□□ 2.95
TLE3-216	ENST00000559191	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
TLE3-216	ENST00000559191	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TLE3-216	ENST00000559191	PTPRG	P23470	1445 aa		33.41	■■■□□ 2.94
TLE3-216	ENST00000559191	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.38	■■■□□ 2.93
TLE3-216	ENST00000559191	HECW1	Q76N89	1606 aa		33.34	■■■□□ 2.93
TLE3-216	ENST00000559191	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
TLE3-216	ENST00000559191	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		33.31	■■■□□ 2.92
TLE3-216	ENST00000559191	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.31	■■■□□ 2.92
TLE3-216	ENST00000559191	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.28	■■■□□ 2.92
TLE3-216	ENST00000559191	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TLE3-216	ENST00000559191	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TLE3-216	ENST00000559191	ABCA8	O94911	1581 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TLE3-216	ENST00000559191	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TLE3-216	ENST00000559191	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.9
TLE3-216	ENST00000559191	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.2	■■■□□ 2.9
TLE3-216	ENST00000559191	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
TLE3-216	ENST00000559191	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
TLE3-216	ENST00000559191	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TLE3-216	ENST00000559191	ARID3C	A6NKF2	412 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TLE3-216	ENST00000559191	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
TLE3-216	ENST00000559191	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
TLE3-216	ENST00000559191	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.13	■■■□□ 2.89
TLE3-216	ENST00000559191	ARHGEF11	O15085	1522 aa		33.1	■■■□□ 2.89
TLE3-216	ENST00000559191	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
TLE3-216	ENST00000559191	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TLE3-216	ENST00000559191	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
TLE3-216	ENST00000559191	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TLE3-216	ENST00000559191	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TLE3-216	ENST00000559191	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.88
TLE3-216	ENST00000559191	ATP10B	O94823	1461 aa		33	■■■□□ 2.87
TLE3-216	ENST00000559191	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TLE3-216	ENST00000559191	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TLE3-216	ENST00000559191	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TLE3-216	ENST00000559191	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TLE3-216	ENST00000559191	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.93	■■■□□ 2.86
TLE3-216	ENST00000559191	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.91	■■■□□ 2.86
TLE3-216	ENST00000559191	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TLE3-216	ENST00000559191	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.89	■■■□□ 2.86
TLE3-216	ENST00000559191	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
TLE3-216	ENST00000559191	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
TLE3-216	ENST00000559191	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.84	■■■□□ 2.85
TLE3-216	ENST00000559191	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.84	■■■□□ 2.85
TLE3-216	ENST00000559191	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
TLE3-216	ENST00000559191	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.83	■■■□□ 2.85
TLE3-216	ENST00000559191	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.82	■■■□□ 2.84
TLE3-216	ENST00000559191	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TLE3-216	ENST00000559191	KIF14	Q15058	1648 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TLE3-216	ENST00000559191	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
TLE3-216	ENST00000559191	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TLE3-216	ENST00000559191	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TLE3-216	ENST00000559191	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TLE3-216	ENST00000559191	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TLE3-216	ENST00000559191	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TLE3-216	ENST00000559191	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TLE3-216	ENST00000559191	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TLE3-216	ENST00000559191	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TLE3-216	ENST00000559191	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
TLE3-216	ENST00000559191	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TLE3-216	ENST00000559191	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.8
TLE3-216	ENST00000559191	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
TLE3-216	ENST00000559191	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.5	■■■□□ 2.79	9e-7	■■■□□ 15.4
TLE3-216	ENST00000559191	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.5	■■■□□ 2.79	4e-9	■■■■■ 26.8
TLE3-216	ENST00000559191	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TLE3-216	ENST00000559191	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TLE3-216	ENST00000559191	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.45	■■■□□ 2.79
TLE3-216	ENST00000559191	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.45	■■■□□ 2.78
TLE3-216	ENST00000559191	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TLE3-216	ENST00000559191	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
TLE3-216	ENST00000559191	ITGAE	P38570	1179 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TLE3-216	ENST00000559191	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
TLE3-216	ENST00000559191	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TLE3-216	ENST00000559191	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.38	■■■□□ 2.77

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