RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558649.5

RABGGTA-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 768 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-206ENST00000558649 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.57■■□□□ 1.84
RABGGTA-206ENST00000558649 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.54■■□□□ 1.84
RABGGTA-206ENST00000558649 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.53■■□□□ 1.84
RABGGTA-206ENST00000558649 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
RABGGTA-206ENST00000558649 EEA1Q15075 1411 aa26.49■■□□□ 1.83
RABGGTA-206ENST00000558649 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
RABGGTA-206ENST00000558649 JPH4Q96JJ6 628 aa26.48■■□□□ 1.83
RABGGTA-206ENST00000558649 PRXQ9BXM0 1461 aa26.48■■□□□ 1.83
RABGGTA-206ENST00000558649 IQGAP2Q13576 1575 aa26.46■■□□□ 1.83
RABGGTA-206ENST00000558649 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.46■■□□□ 1.83
RABGGTA-206ENST00000558649 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.45■■□□□ 1.82
RABGGTA-206ENST00000558649 KIF21BO75037 1637 aa26.3■■□□□ 1.8
RABGGTA-206ENST00000558649 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.27■■□□□ 1.8
RABGGTA-206ENST00000558649 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.26■■□□□ 1.79
RABGGTA-206ENST00000558649 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.25■■□□□ 1.79
RABGGTA-206ENST00000558649 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
RABGGTA-206ENST00000558649 DISP1Q96F81 1524 aa26.23■■□□□ 1.79
RABGGTA-206ENST00000558649 KIAA0556O60303 1618 aa26.21■■□□□ 1.79
RABGGTA-206ENST00000558649 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.16■■□□□ 1.78
RABGGTA-206ENST00000558649 PTPRGP23470 1445 aa26.14■■□□□ 1.78
RABGGTA-206ENST00000558649 GOLGA3Q08378 1498 aa26.13■■□□□ 1.77
RABGGTA-206ENST00000558649 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.12■■□□□ 1.77
RABGGTA-206ENST00000558649 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
RABGGTA-206ENST00000558649 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
RABGGTA-206ENST00000558649 SAMD9Q5K651 1589 aa26.04■■□□□ 1.76
RABGGTA-206ENST00000558649 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
RABGGTA-206ENST00000558649 P3H3Q8IVL6 736 aa26.03■■□□□ 1.76
RABGGTA-206ENST00000558649 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
RABGGTA-206ENST00000558649 UACAQ9BZF9 1416 aa25.97■■□□□ 1.75
RABGGTA-206ENST00000558649 ABCC2Q92887 1545 aa25.96■■□□□ 1.75
RABGGTA-206ENST00000558649 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-206ENST00000558649 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.92■■□□□ 1.74
RABGGTA-206ENST00000558649 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.92■■□□□ 1.74
RABGGTA-206ENST00000558649 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.9■■□□□ 1.74
RABGGTA-206ENST00000558649 ABCA8O94911 1581 aa25.89■■□□□ 1.73
RABGGTA-206ENST00000558649 MAPKBP1O60336 1514 aa25.88■■□□□ 1.73
RABGGTA-206ENST00000558649 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-206ENST00000558649 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.83■■□□□ 1.73
RABGGTA-206ENST00000558649 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.82■■□□□ 1.72
RABGGTA-206ENST00000558649 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.81■■□□□ 1.72
RABGGTA-206ENST00000558649 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.79■■□□□ 1.72
RABGGTA-206ENST00000558649 DIP2BQ9P265 1576 aa25.78■■□□□ 1.72
RABGGTA-206ENST00000558649 ARID3CA6NKF2 412 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-206ENST00000558649 ASXL2Q76L83 1435 aa25.77■■□□□ 1.72
RABGGTA-206ENST00000558649 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.75■■□□□ 1.71
RABGGTA-206ENST00000558649 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.71■■□□□ 1.71
RABGGTA-206ENST00000558649 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
RABGGTA-206ENST00000558649 CLIP1P30622 1438 aa25.66■■□□□ 1.7
RABGGTA-206ENST00000558649 FMN1Q68DA7 1419 aa25.65■■□□□ 1.7
RABGGTA-206ENST00000558649 ATP10BO94823 1461 aa25.65■■□□□ 1.7
RABGGTA-206ENST00000558649 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.65■■□□□ 1.7
RABGGTA-206ENST00000558649 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.64■■□□□ 1.7
RABGGTA-206ENST00000558649 TSPOAP1O95153 1857 aa25.64■■□□□ 1.69
RABGGTA-206ENST00000558649 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
RABGGTA-206ENST00000558649 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
RABGGTA-206ENST00000558649 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
RABGGTA-206ENST00000558649 HECW1Q76N89 1606 aa25.6■■□□□ 1.69
RABGGTA-206ENST00000558649 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
RABGGTA-206ENST00000558649 GLI2P10070 1586 aa25.58■■□□□ 1.69
RABGGTA-206ENST00000558649 CEP162Q5TB80 1403 aa25.57■■□□□ 1.68
RABGGTA-206ENST00000558649 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
RABGGTA-206ENST00000558649 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
RABGGTA-206ENST00000558649 KCNH8Q96L42 1107 aa25.55■■□□□ 1.68
RABGGTA-206ENST00000558649 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.52■■□□□ 1.68
RABGGTA-206ENST00000558649 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.51■■□□□ 1.68
RABGGTA-206ENST00000558649 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-206ENST00000558649 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-206ENST00000558649 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-206ENST00000558649 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-206ENST00000558649 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-206ENST00000558649 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.4■■□□□ 1.66
RABGGTA-206ENST00000558649 CD109Q6YHK3 1445 aa25.39■■□□□ 1.66
RABGGTA-206ENST00000558649 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.38■■□□□ 1.65
RABGGTA-206ENST00000558649 KDM6BO15054 1643 aa25.37■■□□□ 1.65
RABGGTA-206ENST00000558649 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.36■■□□□ 1.65
RABGGTA-206ENST00000558649 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-206ENST00000558649 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-206ENST00000558649 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.31■■□□□ 1.64
RABGGTA-206ENST00000558649 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
RABGGTA-206ENST00000558649 KIF14Q15058 1648 aa25.3■■□□□ 1.64
RABGGTA-206ENST00000558649 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
RABGGTA-206ENST00000558649 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.23■■□□□ 1.63
RABGGTA-206ENST00000558649 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.21■■□□□ 1.63
RABGGTA-206ENST00000558649 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-206ENST00000558649 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-206ENST00000558649 FANCAO15360 1455 aa25.14■■□□□ 1.61
RABGGTA-206ENST00000558649 NEO1Q92859 1461 aa25.14■■□□□ 1.61
RABGGTA-206ENST00000558649 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-206ENST00000558649 TIAM1Q13009 1591 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-206ENST00000558649 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-206ENST00000558649 PLCH2O75038 1416 aa25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-206ENST00000558649 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.09■■□□□ 1.61
RABGGTA-206ENST00000558649 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.09■■□□□ 1.61
RABGGTA-206ENST00000558649 PREX2Q70Z35 1606 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-206ENST00000558649 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-206ENST00000558649 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-206ENST00000558649 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-206ENST00000558649 AKNAQ7Z591 1439 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-206ENST00000558649 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-206ENST00000558649 ADGRL1O94910 1474 aa25.02■■□□□ 1.6
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