RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 ARAP1Q96P48 1450 aa26.42■■□□□ 1.82
RABGGTA-205ENST00000558534 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.37■■□□□ 1.81
RABGGTA-205ENST00000558534 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.37■■□□□ 1.81
RABGGTA-205ENST00000558534 JPH4Q96JJ6 628 aa26.37■■□□□ 1.81
RABGGTA-205ENST00000558534 IQGAP2Q13576 1575 aa26.33■■□□□ 1.81
RABGGTA-205ENST00000558534 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
RABGGTA-205ENST00000558534 PRXQ9BXM0 1461 aa26.32■■□□□ 1.8
RABGGTA-205ENST00000558534 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.3■■□□□ 1.8
RABGGTA-205ENST00000558534 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.3■■□□□ 1.8
RABGGTA-205ENST00000558534 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.25■■□□□ 1.79
RABGGTA-205ENST00000558534 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.24■■□□□ 1.79
RABGGTA-205ENST00000558534 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.16■■□□□ 1.78
RABGGTA-205ENST00000558534 KIF21BO75037 1637 aa26.15■■□□□ 1.78
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGA3Q08378 1498 aa26.11■■□□□ 1.77
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
RABGGTA-205ENST00000558534 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.08■■□□□ 1.77
RABGGTA-205ENST00000558534 KIAA0556O60303 1618 aa26.06■■□□□ 1.76
RABGGTA-205ENST00000558534 PTPRGP23470 1445 aa26.05■■□□□ 1.76
RABGGTA-205ENST00000558534 DISP1Q96F81 1524 aa26.04■■□□□ 1.76
RABGGTA-205ENST00000558534 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
RABGGTA-205ENST00000558534 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.93■■□□□ 1.74
RABGGTA-205ENST00000558534 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
RABGGTA-205ENST00000558534 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.9■■□□□ 1.74
RABGGTA-205ENST00000558534 SAMD9Q5K651 1589 aa25.89■■□□□ 1.73
RABGGTA-205ENST00000558534 UACAQ9BZF9 1416 aa25.88■■□□□ 1.73
RABGGTA-205ENST00000558534 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
RABGGTA-205ENST00000558534 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
RABGGTA-205ENST00000558534 MAPKBP1O60336 1514 aa25.86■■□□□ 1.73
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCC2Q92887 1545 aa25.86■■□□□ 1.73
RABGGTA-205ENST00000558534 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.85■■□□□ 1.73
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCA8O94911 1581 aa25.74■■□□□ 1.71
RABGGTA-205ENST00000558534 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.73■■□□□ 1.71
RABGGTA-205ENST00000558534 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.71■■□□□ 1.71
RABGGTA-205ENST00000558534 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
RABGGTA-205ENST00000558534 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.69■■□□□ 1.7
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.68■■□□□ 1.7
RABGGTA-205ENST00000558534 P3H3Q8IVL6 736 aa25.68■■□□□ 1.7
RABGGTA-205ENST00000558534 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
RABGGTA-205ENST00000558534 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.67■■□□□ 1.7
RABGGTA-205ENST00000558534 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.66■■□□□ 1.7
RABGGTA-205ENST00000558534 DIP2BQ9P265 1576 aa25.65■■□□□ 1.7
RABGGTA-205ENST00000558534 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.63■■□□□ 1.69
RABGGTA-205ENST00000558534 ASXL2Q76L83 1435 aa25.63■■□□□ 1.69
RABGGTA-205ENST00000558534 FMN1Q68DA7 1419 aa25.61■■□□□ 1.69
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.59■■□□□ 1.69
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.56■■□□□ 1.68
RABGGTA-205ENST00000558534 GLI2P10070 1586 aa25.56■■□□□ 1.68
RABGGTA-205ENST00000558534 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.54■■□□□ 1.68
RABGGTA-205ENST00000558534 HECW1Q76N89 1606 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-205ENST00000558534 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP10BO94823 1461 aa25.48■■□□□ 1.67
RABGGTA-205ENST00000558534 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
RABGGTA-205ENST00000558534 CLIP1P30622 1438 aa25.46■■□□□ 1.67
RABGGTA-205ENST00000558534 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
RABGGTA-205ENST00000558534 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
RABGGTA-205ENST00000558534 TSPOAP1O95153 1857 aa25.43■■□□□ 1.66
RABGGTA-205ENST00000558534 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.42■■□□□ 1.66
RABGGTA-205ENST00000558534 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.41■■□□□ 1.66
RABGGTA-205ENST00000558534 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.39■■□□□ 1.65
RABGGTA-205ENST00000558534 ARID3CA6NKF2 412 aa25.36■■□□□ 1.65
RABGGTA-205ENST00000558534 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.35■■□□□ 1.65
RABGGTA-205ENST00000558534 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
RABGGTA-205ENST00000558534 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.34■■□□□ 1.65
RABGGTA-205ENST00000558534 CEP162Q5TB80 1403 aa25.33■■□□□ 1.65
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNH8Q96L42 1107 aa25.33■■□□□ 1.65
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.33■■□□□ 1.65
RABGGTA-205ENST00000558534 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.32■■□□□ 1.64
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.3■■□□□ 1.64
RABGGTA-205ENST00000558534 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
RABGGTA-205ENST00000558534 CD109Q6YHK3 1445 aa25.29■■□□□ 1.64
RABGGTA-205ENST00000558534 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
RABGGTA-205ENST00000558534 KDM6BO15054 1643 aa25.29■■□□□ 1.64
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.28■■□□□ 1.64
RABGGTA-205ENST00000558534 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.2■■□□□ 1.62
RABGGTA-205ENST00000558534 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-205ENST00000558534 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.19■■□□□ 1.62
RABGGTA-205ENST00000558534 KIF14Q15058 1648 aa25.18■■□□□ 1.62
RABGGTA-205ENST00000558534 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.17■■□□□ 1.62
RABGGTA-205ENST00000558534 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
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RABGGTA-205ENST00000558534 NEO1Q92859 1461 aa25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-205ENST00000558534 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.09■■□□□ 1.61
RABGGTA-205ENST00000558534 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.09■■□□□ 1.61
RABGGTA-205ENST00000558534 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.07■■□□□ 1.6
RABGGTA-205ENST00000558534 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.06■■□□□ 1.6
RABGGTA-205ENST00000558534 PLCH2O75038 1416 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-205ENST00000558534 FANCAO15360 1455 aa25.02■■□□□ 1.6
RABGGTA-205ENST00000558534 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.99■■□□□ 1.59
RABGGTA-205ENST00000558534 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.98■■□□□ 1.59
RABGGTA-205ENST00000558534 AKNAQ7Z591 1439 aa24.95■■□□□ 1.59
RABGGTA-205ENST00000558534 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-205ENST00000558534 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-205ENST00000558534 PREX2Q70Z35 1606 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-205ENST00000558534 TIAM1Q13009 1591 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-205ENST00000558534 MAP3K1Q13233 1512 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-205ENST00000558534 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
RABGGTA-205ENST00000558534 ADGRL1O94910 1474 aa24.89■■□□□ 1.58
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