RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.17■■■■□ 3.7
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.09■■■■□ 3.05
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCC9O60706 1549 aa33.1■■■□□ 2.89
RABGGTA-205ENST00000558534 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.05■■■□□ 2.72
RABGGTA-205ENST00000558534 NACADO15069 1562 aa32.01■■■□□ 2.71
RABGGTA-205ENST00000558534 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.85■■■□□ 2.69
RABGGTA-205ENST00000558534 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
RABGGTA-205ENST00000558534 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.8■■■□□ 2.68
RABGGTA-205ENST00000558534 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.7■■■□□ 2.66
RABGGTA-205ENST00000558534 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.23■■■□□ 2.59
RABGGTA-205ENST00000558534 SCRIBQ14160 1630 aa30.93■■■□□ 2.54
RABGGTA-205ENST00000558534 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.9■■■□□ 2.54
RABGGTA-205ENST00000558534 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.85■■■□□ 2.53
RABGGTA-205ENST00000558534 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.85■■■□□ 2.53
RABGGTA-205ENST00000558534 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.17■■■□□ 2.42
RABGGTA-205ENST00000558534 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
RABGGTA-205ENST00000558534 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.01■■■□□ 2.39
RABGGTA-205ENST00000558534 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.81■■■□□ 2.36
RABGGTA-205ENST00000558534 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
RABGGTA-205ENST00000558534 SMARCA4P51532 1647 aa29.64■■■□□ 2.34
RABGGTA-205ENST00000558534 SMARCA2P51531 1590 aa29.53■■■□□ 2.32
RABGGTA-205ENST00000558534 NCAPD3P42695 1498 aa29.45■■■□□ 2.31
RABGGTA-205ENST00000558534 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.42■■■□□ 2.3
RABGGTA-205ENST00000558534 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.39■■■□□ 2.3
RABGGTA-205ENST00000558534 HMGXB3Q12766 1538 aa29.38■■■□□ 2.29
RABGGTA-205ENST00000558534 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.33■■■□□ 2.29
RABGGTA-205ENST00000558534 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
RABGGTA-205ENST00000558534 WIZO95785 1651 aa29.05■■■□□ 2.24
RABGGTA-205ENST00000558534 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
RABGGTA-205ENST00000558534 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
RABGGTA-205ENST00000558534 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.76■■■□□ 2.19
RABGGTA-205ENST00000558534 ERCC6Q03468 1493 aa28.66■■■□□ 2.18
RABGGTA-205ENST00000558534 NESP48681 1621 aa28.59■■■□□ 2.17
RABGGTA-205ENST00000558534 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.58■■■□□ 2.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.55■■■□□ 2.16
RABGGTA-205ENST00000558534 CFTRP13569 1480 aa28.42■■■□□ 2.14
RABGGTA-205ENST00000558534 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.4■■■□□ 2.14
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.4■■■□□ 2.14
RABGGTA-205ENST00000558534 CUX2O14529 1486 aa28.4■■■□□ 2.14
RABGGTA-205ENST00000558534 PRDM2Q13029 1718 aa28.38■■■□□ 2.13
RABGGTA-205ENST00000558534 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
RABGGTA-205ENST00000558534 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.27■■■□□ 2.12
RABGGTA-205ENST00000558534 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
RABGGTA-205ENST00000558534 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.25■■■□□ 2.11
RABGGTA-205ENST00000558534 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.21■■■□□ 2.11
RABGGTA-205ENST00000558534 WDR62O43379 1518 aa28.12■■■□□ 2.09
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCC8Q09428 1581 aa27.96■■■□□ 2.07
RABGGTA-205ENST00000558534 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
RABGGTA-205ENST00000558534 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.83■■■□□ 2.05
RABGGTA-205ENST00000558534 TOPBP1Q92547 1522 aa27.79■■■□□ 2.04
RABGGTA-205ENST00000558534 IFT140Q96RY7 1462 aa27.69■■■□□ 2.02
RABGGTA-205ENST00000558534 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
RABGGTA-205ENST00000558534 CUX1P39880 1505 aa27.54■■■□□ 2
RABGGTA-205ENST00000558534 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
RABGGTA-205ENST00000558534 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.49■■□□□ 1.99
RABGGTA-205ENST00000558534 WDR97A6NE52 1622 aa27.49■■□□□ 1.99
RABGGTA-205ENST00000558534 SOGA1O94964 1423 aa27.45■■□□□ 1.98
RABGGTA-205ENST00000558534 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.98
RABGGTA-205ENST00000558534 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.43■■□□□ 1.98
RABGGTA-205ENST00000558534 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
RABGGTA-205ENST00000558534 TOP2BQ02880 1626 aa27.41■■□□□ 1.98
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
RABGGTA-205ENST00000558534 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.36■■□□□ 1.97
RABGGTA-205ENST00000558534 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.35■■□□□ 1.97
RABGGTA-205ENST00000558534 SYNJ1O43426 1573 aa27.31■■□□□ 1.96
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.26■■□□□ 1.96
RABGGTA-205ENST00000558534 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.26■■□□□ 1.954e-11■■■■■ 43.5
RABGGTA-205ENST00000558534 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
RABGGTA-205ENST00000558534 GRIN2BQ13224 1484 aa27.18■■□□□ 1.94
RABGGTA-205ENST00000558534 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.16■■□□□ 1.94
RABGGTA-205ENST00000558534 PBRM1Q86U86 1689 aa27.16■■□□□ 1.94
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.16■■□□□ 1.94
RABGGTA-205ENST00000558534 OSCARQ8IYS5 282 aa27.15■■□□□ 1.94
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
RABGGTA-205ENST00000558534 CHD1O14646 1710 aa27.07■■□□□ 1.92
RABGGTA-205ENST00000558534 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.07■■□□□ 1.92
RABGGTA-205ENST00000558534 SYNJ2O15056 1496 aa27■■□□□ 1.91
RABGGTA-205ENST00000558534 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27■■□□□ 1.91
RABGGTA-205ENST00000558534 FBLN2P98095 1184 aa26.98■■□□□ 1.91
RABGGTA-205ENST00000558534 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
RABGGTA-205ENST00000558534 KIF27Q86VH2 1401 aa26.92■■□□□ 1.9
RABGGTA-205ENST00000558534 ADAMTS12P58397 1594 aa26.9■■□□□ 1.9
RABGGTA-205ENST00000558534 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-205ENST00000558534 CUL7Q14999 1698 aa26.81■■□□□ 1.88
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM41Q8WV44 630 aa26.8■■□□□ 1.88
RABGGTA-205ENST00000558534 GRIN2AQ12879 1464 aa26.8■■□□□ 1.88
RABGGTA-205ENST00000558534 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.75■■□□□ 1.87
RABGGTA-205ENST00000558534 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.69■■□□□ 1.86
RABGGTA-205ENST00000558534 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.69■■□□□ 1.86
RABGGTA-205ENST00000558534 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.69■■□□□ 1.86
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGEF11O15085 1522 aa26.69■■□□□ 1.86
RABGGTA-205ENST00000558534 IGF1RP08069 1367 aa26.68■■□□□ 1.86
RABGGTA-205ENST00000558534 NUP160Q12769 1436 aa26.66■■□□□ 1.86
RABGGTA-205ENST00000558534 CEP170Q5SW79 1584 aa26.62■■□□□ 1.85
RABGGTA-205ENST00000558534 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.58■■□□□ 1.85
RABGGTA-205ENST00000558534 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.5■■□□□ 1.83
RABGGTA-205ENST00000558534 SHROOM2Q13796 1616 aa26.5■■□□□ 1.83
RABGGTA-205ENST00000558534 EEA1Q15075 1411 aa26.48■■□□□ 1.83
RABGGTA-205ENST00000558534 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.47■■□□□ 1.83
RABGGTA-205ENST00000558534 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.45■■□□□ 1.83
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