RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.27■■■■□ 3.24
TMOD3-203ENST00000558455 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.26■■■■□ 3.23
TMOD3-203ENST00000558455 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.25■■■■□ 3.23
TMOD3-203ENST00000558455 JPH4Q96JJ6 628 aa35.24■■■■□ 3.23
TMOD3-203ENST00000558455 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
TMOD3-203ENST00000558455 PRXQ9BXM0 1461 aa35.14■■■■□ 3.22
TMOD3-203ENST00000558455 EEA1Q15075 1411 aa35.1■■■■□ 3.21
TMOD3-203ENST00000558455 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.07■■■■□ 3.2
TMOD3-203ENST00000558455 IQGAP2Q13576 1575 aa35.07■■■■□ 3.2
TMOD3-203ENST00000558455 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
TMOD3-203ENST00000558455 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.9■■■■□ 3.18
TMOD3-203ENST00000558455 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.88■■■■□ 3.17
TMOD3-203ENST00000558455 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.87■■■■□ 3.17
TMOD3-203ENST00000558455 DISP1Q96F81 1524 aa34.84■■■■□ 3.17
TMOD3-203ENST00000558455 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.78■■■■□ 3.16
TMOD3-203ENST00000558455 PTPRGP23470 1445 aa34.77■■■■□ 3.16
TMOD3-203ENST00000558455 KIF21BO75037 1637 aa34.75■■■■□ 3.15
TMOD3-203ENST00000558455 KIAA0556O60303 1618 aa34.73■■■■□ 3.15
TMOD3-203ENST00000558455 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
TMOD3-203ENST00000558455 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.68■■■■□ 3.14
TMOD3-203ENST00000558455 GOLGA3Q08378 1498 aa34.66■■■■□ 3.14
TMOD3-203ENST00000558455 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
TMOD3-203ENST00000558455 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.54■■■■□ 3.12
TMOD3-203ENST00000558455 UACAQ9BZF9 1416 aa34.54■■■■□ 3.12
TMOD3-203ENST00000558455 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.53■■■■□ 3.12
TMOD3-203ENST00000558455 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.51■■■■□ 3.11
TMOD3-203ENST00000558455 SAMD9Q5K651 1589 aa34.49■■■■□ 3.11
TMOD3-203ENST00000558455 ABCC2Q92887 1545 aa34.48■■■■□ 3.11
TMOD3-203ENST00000558455 MAPKBP1O60336 1514 aa34.45■■■■□ 3.11
TMOD3-203ENST00000558455 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
TMOD3-203ENST00000558455 P3H3Q8IVL6 736 aa34.45■■■■□ 3.11
TMOD3-203ENST00000558455 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
TMOD3-203ENST00000558455 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.42■■■■□ 3.1
TMOD3-203ENST00000558455 ABCA8O94911 1581 aa34.36■■■■□ 3.09
TMOD3-203ENST00000558455 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.34■■■■□ 3.09
TMOD3-203ENST00000558455 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.32■■■■□ 3.08
TMOD3-203ENST00000558455 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.31■■■■□ 3.08
TMOD3-203ENST00000558455 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.3■■■■□ 3.08
TMOD3-203ENST00000558455 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.27■■■■□ 3.08
TMOD3-203ENST00000558455 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
TMOD3-203ENST00000558455 ASXL2Q76L83 1435 aa34.26■■■■□ 3.07
TMOD3-203ENST00000558455 DIP2BQ9P265 1576 aa34.26■■■■□ 3.07
TMOD3-203ENST00000558455 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.23■■■■□ 3.07
TMOD3-203ENST00000558455 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.16■■■■□ 3.06
TMOD3-203ENST00000558455 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.15■■■■□ 3.06
TMOD3-203ENST00000558455 ARID3CA6NKF2 412 aa34.1■■■■□ 3.05
TMOD3-203ENST00000558455 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.08■■■■□ 3.05
TMOD3-203ENST00000558455 ATP10BO94823 1461 aa34.07■■■■□ 3.05
TMOD3-203ENST00000558455 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
TMOD3-203ENST00000558455 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
TMOD3-203ENST00000558455 GLI2P10070 1586 aa34.04■■■■□ 3.04
TMOD3-203ENST00000558455 FMN1Q68DA7 1419 aa34■■■■□ 3.03
TMOD3-203ENST00000558455 CLIP1P30622 1438 aa33.94■■■■□ 3.02
TMOD3-203ENST00000558455 TSPOAP1O95153 1857 aa33.93■■■■□ 3.02
TMOD3-203ENST00000558455 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
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TMOD3-203ENST00000558455 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.89■■■■□ 3.02
TMOD3-203ENST00000558455 HECW1Q76N89 1606 aa33.85■■■■□ 3.01
TMOD3-203ENST00000558455 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
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TMOD3-203ENST00000558455 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.81■■■■□ 3
TMOD3-203ENST00000558455 CEP162Q5TB80 1403 aa33.79■■■■□ 3
TMOD3-203ENST00000558455 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.77■■■■□ 3
TMOD3-203ENST00000558455 CD109Q6YHK3 1445 aa33.76■■■□□ 2.99
TMOD3-203ENST00000558455 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
TMOD3-203ENST00000558455 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.75■■■□□ 2.99
TMOD3-203ENST00000558455 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.74■■■□□ 2.99
TMOD3-203ENST00000558455 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.74■■■□□ 2.99
TMOD3-203ENST00000558455 KDM6BO15054 1643 aa33.71■■■□□ 2.99
TMOD3-203ENST00000558455 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.7■■■□□ 2.99
TMOD3-203ENST00000558455 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.69■■■□□ 2.98
TMOD3-203ENST00000558455 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.66■■■□□ 2.98
TMOD3-203ENST00000558455 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.65■■■□□ 2.98
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.6■■■□□ 2.97
TMOD3-203ENST00000558455 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
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TMOD3-203ENST00000558455 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
TMOD3-203ENST00000558455 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
TMOD3-203ENST00000558455 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.53■■■□□ 2.96
TMOD3-203ENST00000558455 KIF14Q15058 1648 aa33.46■■■□□ 2.95
TMOD3-203ENST00000558455 NEO1Q92859 1461 aa33.44■■■□□ 2.94
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TMOD3-203ENST00000558455 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.4■■■□□ 2.94
TMOD3-203ENST00000558455 FANCAO15360 1455 aa33.37■■■□□ 2.93
TMOD3-203ENST00000558455 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.36■■■□□ 2.93
TMOD3-203ENST00000558455 PLCH2O75038 1416 aa33.36■■■□□ 2.93
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TMOD3-203ENST00000558455 AKNAQ7Z591 1439 aa33.3■■■□□ 2.92
TMOD3-203ENST00000558455 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.26■■■□□ 2.92
TMOD3-203ENST00000558455 RAPGEF3O95398 923 aa33.24■■■□□ 2.91
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TMOD3-203ENST00000558455 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.21■■■□□ 2.91
TMOD3-203ENST00000558455 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
TMOD3-203ENST00000558455 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.21■■■□□ 2.91
TMOD3-203ENST00000558455 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.2■■■□□ 2.91
TMOD3-203ENST00000558455 ADGRL1O94910 1474 aa33.19■■■□□ 2.9
TMOD3-203ENST00000558455 PREX2Q70Z35 1606 aa33.18■■■□□ 2.9
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