RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.95■■■■■ 5.75
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TMOD3-203ENST00000558455 ABCC9O60706 1549 aa44.4■■■■■ 4.7
TMOD3-203ENST00000558455 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.65■■■■■ 4.42
TMOD3-203ENST00000558455 NACADO15069 1562 aa42.6■■■■■ 4.41
TMOD3-203ENST00000558455 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.58■■■■■ 4.41
TMOD3-203ENST00000558455 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
TMOD3-203ENST00000558455 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.33■■■■■ 4.37
TMOD3-203ENST00000558455 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.14■■■■■ 4.34
TMOD3-203ENST00000558455 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.66■■■■■ 4.26
TMOD3-203ENST00000558455 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.48■■■■■ 4.23
TMOD3-203ENST00000558455 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.38■■■■■ 4.22
TMOD3-203ENST00000558455 SCRIBQ14160 1630 aa41.36■■■■■ 4.21
TMOD3-203ENST00000558455 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.93■■■■■ 4.14
TMOD3-203ENST00000558455 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.78■■■■■ 4.12
TMOD3-203ENST00000558455 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
TMOD3-203ENST00000558455 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.13■■■■■ 4.02
TMOD3-203ENST00000558455 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.88■■■■□ 3.98
TMOD3-203ENST00000558455 SMARCA4P51532 1647 aa39.54■■■■□ 3.92
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TMOD3-203ENST00000558455 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.35■■■■□ 3.89
TMOD3-203ENST00000558455 NCAPD3P42695 1498 aa39.31■■■■□ 3.88
TMOD3-203ENST00000558455 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.29■■■■□ 3.88
TMOD3-203ENST00000558455 SMARCA2P51531 1590 aa39.28■■■■□ 3.88
TMOD3-203ENST00000558455 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.15■■■■□ 3.86
TMOD3-203ENST00000558455 HMGXB3Q12766 1538 aa39.13■■■■□ 3.85
TMOD3-203ENST00000558455 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.02■■■■□ 3.84
TMOD3-203ENST00000558455 WIZO95785 1651 aa38.84■■■■□ 3.81
TMOD3-203ENST00000558455 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.82■■■■□ 3.81
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TMOD3-203ENST00000558455 NESP48681 1621 aa38.41■■■■□ 3.74
TMOD3-203ENST00000558455 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.27■■■■□ 3.72
TMOD3-203ENST00000558455 ERCC6Q03468 1493 aa38.26■■■■□ 3.72
TMOD3-203ENST00000558455 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.18■■■■□ 3.7
TMOD3-203ENST00000558455 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.03■■■■□ 3.68
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.98■■■■□ 3.67
TMOD3-203ENST00000558455 CFTRP13569 1480 aa37.95■■■■□ 3.67
TMOD3-203ENST00000558455 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.92■■■■□ 3.66
TMOD3-203ENST00000558455 CUX2O14529 1486 aa37.85■■■■□ 3.65
TMOD3-203ENST00000558455 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
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TMOD3-203ENST00000558455 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.75■■■■□ 3.63
TMOD3-203ENST00000558455 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.71■■■■□ 3.63
TMOD3-203ENST00000558455 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.66■■■■□ 3.62
TMOD3-203ENST00000558455 PRDM2Q13029 1718 aa37.59■■■■□ 3.61
TMOD3-203ENST00000558455 WDR62O43379 1518 aa37.53■■■■□ 3.6
TMOD3-203ENST00000558455 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
TMOD3-203ENST00000558455 TOPBP1Q92547 1522 aa37.14■■■■□ 3.54
TMOD3-203ENST00000558455 ABCC8Q09428 1581 aa37.09■■■■□ 3.53
TMOD3-203ENST00000558455 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.08■■■■□ 3.53
TMOD3-203ENST00000558455 IFT140Q96RY7 1462 aa36.91■■■■□ 3.5
TMOD3-203ENST00000558455 CUX1P39880 1505 aa36.85■■■■□ 3.49
TMOD3-203ENST00000558455 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
TMOD3-203ENST00000558455 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.74■■■■□ 3.47
TMOD3-203ENST00000558455 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.73■■■■□ 3.47
TMOD3-203ENST00000558455 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
TMOD3-203ENST00000558455 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.68■■■■□ 3.46
TMOD3-203ENST00000558455 SOGA1O94964 1423 aa36.66■■■■□ 3.46
TMOD3-203ENST00000558455 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
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TMOD3-203ENST00000558455 SYNJ1O43426 1573 aa36.52■■■■□ 3.44
TMOD3-203ENST00000558455 TOP2BQ02880 1626 aa36.51■■■■□ 3.43
TMOD3-203ENST00000558455 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.49■■■■□ 3.43
TMOD3-203ENST00000558455 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
TMOD3-203ENST00000558455 WDR97A6NE52 1622 aa36.41■■■■□ 3.42
TMOD3-203ENST00000558455 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.37■■■■□ 3.41
TMOD3-203ENST00000558455 OSCARQ8IYS5 282 aa36.27■■■■□ 3.4
TMOD3-203ENST00000558455 GRIN2BQ13224 1484 aa36.24■■■■□ 3.39
TMOD3-203ENST00000558455 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.24■■■■□ 3.39
TMOD3-203ENST00000558455 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.23■■■■□ 3.39
TMOD3-203ENST00000558455 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.22■■■■□ 3.39
TMOD3-203ENST00000558455 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
TMOD3-203ENST00000558455 PBRM1Q86U86 1689 aa36.14■■■■□ 3.38
TMOD3-203ENST00000558455 CHD1O14646 1710 aa36.12■■■■□ 3.37
TMOD3-203ENST00000558455 FBLN2P98095 1184 aa36.1■■■■□ 3.37
TMOD3-203ENST00000558455 SYNJ2O15056 1496 aa36.01■■■■□ 3.36
TMOD3-203ENST00000558455 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
TMOD3-203ENST00000558455 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.93■■■■□ 3.34
TMOD3-203ENST00000558455 ADAMTS12P58397 1594 aa35.89■■■■□ 3.34
TMOD3-203ENST00000558455 KIF27Q86VH2 1401 aa35.83■■■■□ 3.33
TMOD3-203ENST00000558455 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.83■■■■□ 3.33
TMOD3-203ENST00000558455 GRIN2AQ12879 1464 aa35.79■■■■□ 3.32
TMOD3-203ENST00000558455 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.77■■■■□ 3.32
TMOD3-203ENST00000558455 ARHGEF11O15085 1522 aa35.71■■■■□ 3.31
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TMOD3-203ENST00000558455 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.71■■■■□ 3.31
TMOD3-203ENST00000558455 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.71■■■■□ 3.31
TMOD3-203ENST00000558455 IGF1RP08069 1367 aa35.69■■■■□ 3.3
TMOD3-203ENST00000558455 TRIM41Q8WV44 630 aa35.69■■■■□ 3.3
TMOD3-203ENST00000558455 NUP160Q12769 1436 aa35.63■■■■□ 3.29
TMOD3-203ENST00000558455 CEP170Q5SW79 1584 aa35.61■■■■□ 3.29
TMOD3-203ENST00000558455 CUL7Q14999 1698 aa35.58■■■■□ 3.29
TMOD3-203ENST00000558455 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.52■■■■□ 3.28
TMOD3-203ENST00000558455 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.48■■■■□ 3.27
TMOD3-203ENST00000558455 ARAP1Q96P48 1450 aa35.43■■■■□ 3.26
TMOD3-203ENST00000558455 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.37■■■■□ 3.25
TMOD3-203ENST00000558455 SHROOM2Q13796 1616 aa35.35■■■■□ 3.25
TMOD3-203ENST00000558455 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.29■■■■□ 3.24
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